Cost-Efficient Transcriptomic-Based Drug Screening

Jacqueline Leidner; Heidi Theis; Michael Kraut; Alice Ragogna; Marc Beyer; Joachim Schultze; Jonas Schulte-Schrepping; Caterina Carraro; Lorenzo Bonaguro

doi:10.3791/65930

Transcriptome Profiling for High-Throughput Drug Screening

February 23, 2024

Screening farmacologico basato sulla trascrittomica efficiente in termini di costi

01:10 min

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Screening farmacologico utilizzando cellule mononucleate del sangue periferico (PBMC) e preparazione di lisato cellulare per il sequenziamento dell'mRNA

01:56 min

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Preparazione della libreria di cDNA dal lisato di cellule mononucleate del sangue periferico (PBMC) trattato con farmaci per il sequenziamento dell'mRNA

02:34 min

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Sequenziamento dell'mRNA per comprendere l'effetto cellulare del trattamento farmacologico

01:11 min

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Jacqueline Leidner², Heidi Theis, Michael Kraut, Alice Ragogna, Marc Beyer^3,4, Joachim Schultze^2,3, Jonas Schulte-Schrepping², Caterina Carraro², Lorenzo Bonaguro²

¹Systems Medicine,German Center for Neurodegenerative Diseases (DZNE) eV., ²Genomics & Immunoregulation, LIMES Institute,University of Bonn, ³PRECISE Platform for Single Cell Genomics and Epigenomics,DZNE and University of Bonn, ⁴Immunogenomics & Neurodegeneration,German Center for Neurodegenerative Diseases (DZNE) eV.

Summary

Questo protocollo descrive un flusso di lavoro che va dalle colture cellulari ex vivo o in vitro alla pre-elaborazione dei dati trascrittomici per uno screening farmacologico basato sul trascrittoma economicamente vantaggioso.