Cost-Efficient Transcriptomic-Based Drug Screening

Jacqueline Leidner; Heidi Theis; Michael Kraut; Alice Ragogna; Marc Beyer; Joachim Schultze; Jonas Schulte-Schrepping; Caterina Carraro; Lorenzo Bonaguro

doi:10.3791/65930

Transcriptome Profiling for High-Throughput Drug Screening

February 23, 2024

Triagem Transcriptomic-Based Drug Screening Custo-Eficiente

01:10 min

•

Triagem de Drogas Usando Células Mononucleares do Sangue Periférico (PBMCs) e Preparação de Lisado Celular para Sequenciamento de RNAm

01:56 min

•

Preparação da Biblioteca de cDNA a partir do Lisado de Células Mononucleares do Sangue Periférico Tratadas com Drogas (PBMC) para Sequenciamento de RNAm

02:34 min

•

Sequenciamento de mRNA para entender o efeito celular do tratamento medicamentoso

01:11 min

•

Jacqueline Leidner², Heidi Theis, Michael Kraut, Alice Ragogna, Marc Beyer^3,4, Joachim Schultze^2,3, Jonas Schulte-Schrepping², Caterina Carraro², Lorenzo Bonaguro²

¹Systems Medicine,German Center for Neurodegenerative Diseases (DZNE) eV., ²Genomics & Immunoregulation, LIMES Institute,University of Bonn, ³PRECISE Platform for Single Cell Genomics and Epigenomics,DZNE and University of Bonn, ⁴Immunogenomics & Neurodegeneration,German Center for Neurodegenerative Diseases (DZNE) eV.

Summary

Este protocolo descreve um fluxo de trabalho de culturas de células ex vivo ou in vitro para pré-processamento de dados transcriptômicos para triagem de drogas baseada em transcriptoma custo-efetivo.