Cost-Efficient Transcriptomic-Based Drug Screening

Jacqueline Leidner; Heidi Theis; Michael Kraut; Alice Ragogna; Marc Beyer; Joachim Schultze; Jonas Schulte-Schrepping; Caterina Carraro; Lorenzo Bonaguro

doi:10.3791/65930

Transcriptome Profiling for High-Throughput Drug Screening

February 23, 2024

Экономичный транскриптомный скрининг лекарственных препаратов

01:10 min

•

Лекарственный скрининг с использованием мононуклеарных клеток периферической крови (МПКМ) и подготовка клеточного лизата для секвенирования мРНК

01:56 min

•

Библиотечный препарат кДНК из лизата мононуклеарных клеток периферической крови (PBMC) для секвенирования мРНК

02:34 min

•

Секвенирование мРНК для понимания клеточного эффекта медикаментозного лечения

01:11 min

•

Jacqueline Leidner², Heidi Theis, Michael Kraut, Alice Ragogna, Marc Beyer^3,4, Joachim Schultze^2,3, Jonas Schulte-Schrepping², Caterina Carraro², Lorenzo Bonaguro²

¹Systems Medicine,German Center for Neurodegenerative Diseases (DZNE) eV., ²Genomics & Immunoregulation, LIMES Institute,University of Bonn, ³PRECISE Platform for Single Cell Genomics and Epigenomics,DZNE and University of Bonn, ⁴Immunogenomics & Neurodegeneration,German Center for Neurodegenerative Diseases (DZNE) eV.

Summary

Этот протокол описывает рабочий процесс от культивирования клеток ex vivo или in vitro до предварительной обработки транскриптомных данных для экономически эффективного скрининга лекарств на основе транскриптома.