Cost-Efficient Transcriptomic-Based Drug Screening

Jacqueline Leidner; Heidi Theis; Michael Kraut; Alice Ragogna; Marc Beyer; Joachim Schultze; Jonas Schulte-Schrepping; Caterina Carraro; Lorenzo Bonaguro

doi:10.3791/65930

Transcriptome Profiling for High-Throughput Drug Screening

February 23, 2024

Kostnadseffektiv transkriptomikbaserad läkemedelsscreening

01:10 min

•

Läkemedelsscreening med mononukleära celler i perifert blod (PBMC) och celllysatberedning för mRNA-sekvensering

01:56 min

•

cDNA-biblioteksberedning från läkemedelsbehandlad-perifer blodmononukleär cell (PBMC) lysat för mRNA-sekvensering

02:34 min

•

mRNA-sekvensering för att förstå den cellulära effekten av läkemedelsbehandling

01:11 min

•

Jacqueline Leidner², Heidi Theis, Michael Kraut, Alice Ragogna, Marc Beyer^3,4, Joachim Schultze^2,3, Jonas Schulte-Schrepping², Caterina Carraro², Lorenzo Bonaguro²

¹Systems Medicine,German Center for Neurodegenerative Diseases (DZNE) eV., ²Genomics & Immunoregulation, LIMES Institute,University of Bonn, ³PRECISE Platform for Single Cell Genomics and Epigenomics,DZNE and University of Bonn, ⁴Immunogenomics & Neurodegeneration,German Center for Neurodegenerative Diseases (DZNE) eV.

Summary

Detta protokoll beskriver ett arbetsflöde från ex vivo eller in vitro cellkulturer till transkriptomisk förbehandling av data för kostnadseffektiv transkriptombaserad läkemedelsscreening.