Summary

Una alternativa sencilla para inyección estereotáctica para el Cerebro Derribo específico de miARN

Published: December 26, 2015
doi:

Summary

MicroRNAs play crucial roles in the brain and are potential targets for modeling neuro-degeneration. However, perturbing miRNA levels is challenging due to the short length of miRNA and inaccessibility of the brain tissue. This video presents a method for antagomir design and brain specific delivery using a neuropeptide in mice.

Abstract

MicroRNAs (miRNAs) are key regulators of gene expression. In the brain, vital processes like neurodevelopment and neuronal functions depend on the correct expression of microRNAs. Perturbation of microRNAs in the brain can be used to model neurodegenerative diseases by modulating neuronal cell death. Currently, stereotactic injection is used to deliver miRNA knockdown agents to specific location in the brain. Here, we discuss strategies to design antagomirs against miRNA with locked nucleotide modifications (LNA). Subsequently describe a method for brain specific delivery of antagomirs, uniformly across different regions of the brain. This method is simple and widely applicable since it overcomes the surgery, associated injury and limitation of local delivery in stereotactic injections. We prepared a complex of neurotropic, cell-penetrating peptide Rabies Virus Glycoprotein (RVG) with antagomir against miRNA-29 and injected through tail vein, to specifically deliver in the brain. The antagomir design incorporated features that allow specific targeting of the miRNA and formation of non-covalent complexes with the peptide. The knock-down of the miRNA in neuronal cells, resulted in apoptotic cell death and associated behavioural defects. Thus, the method can be used for acute models of neuro-degeneration through the perturbation of miRNAs.

Introduction

Los microARNs se han convertido en nuevas dianas terapéuticas debido a su papel universal en la regulación de la expresión génica y pruebas directas de la participación en la enfermedad. MiRNAs se están explorando activamente por su potencial como fármaco dirigido a 1,2. Además, alteraciones en la expresión de los genes miARN están asociados con varias enfermedades 3 y simulación de estos cambios por la perturbación artificial de expresión de los genes miARN se puede utilizar para estudiar las vías celulares implicadas en la manifestación de la enfermedad. Entrega específica de tejido de miARN fármacos dirigidos es actualmente un gran desafío para el desarrollo de fármacos basados ​​miARN. Antagomirs e imita miARN son agentes prometedores para perturbar los niveles de miRNA 4-6. Sin embargo, las características especiales que mejoran su especificidad y eficacia tienen que ser incorporado en el diseño de antagomirs antes de que puedan ser utilizados para la perturbación in vivo de la expresión de los genes miARN.

Los microARN son especialmente relevantes como objetivos en neurodegenerativa actualmente incurable y enfermedades del neurodesarrollo. La barrera sangre-cerebro plantea una restricción a la entrega de antagomirs en el cerebro. Inyecciones estereotácticas son ampliamente utilizados en modelos de roedores para entregar moléculas a lugares específicos en el cerebro 7. Se requiere habilidad, amplia inversión en instrumentación y el tiempo. Inyecciones estereotáxicas son invasivas, implica cirugía, causar al menos leve lesión y se limita a la entrega local. El uso de péptidos penetrantes de células con una preferencia por las neuronas de orientación puede contrarrestar estas limitaciones, ya que pueden ser entregados a través de la ruta trans-vascular, pero romper la barrera hematoencefálica. Tal péptido derivado de la rabia Virus de la glucoproteína (RVG), se utilizó previamente para entregar siRNA contra virus de encefalitis japonesa en ratones 8. Encontramos que el uso del péptido para antagomir entrega, miRNAs puede ser efectivamente derribado en el cerebro del ratón 9.

ontenido "> El segundo gran reto de miARN knock-down surge desde el pequeño tamaño de miRNAs y la presencia de isoformas de secuencias estrechamente relacionadas. Tomamos el ejemplo de la MMU-miR-29 familiar que consta de tres isoformas estrechamente relacionados, miR-29a , b y c. antagomirs son también en general modificada a lo largo de la columna vertebral para aumentar su estabilidad y hacerlas resistentes al ataque de nucleasas. Locked Nucleic Acids (LNA) ofrecen una ventaja adicional que mejoran la estabilidad térmica e incluso conducir a la degradación orientar sobre y más allá impedimento estérico 10. La introducción de modificaciones a lo largo de la columna vertebral puede ser eficaz, pero caro. Hemos visto anteriormente que las modificaciones más allá de un número óptimo pueden no mejorar aún más la eficacia. El diseño de la antagomir por lo tanto, implica la modificación óptima de la antagomir.

Para antagomir complejo no covalente con el péptido neurotrópico, un hepta- cargada a la extensión nona-arginina se utiliza el. D-argininaresiduos se utilizan ya que confieren mayor estabilidad ya que no son susceptibles a la escisión por proteasas. Hepta a estiramientos-nona arginina actúan agentes celulares penetrante como eficientes, a pesar de que no confieren especificidad de tipo celular. Al enlazar covalentemente el péptido RVG al enlazador nona-arginina, un neurotrópico, péptido celular penetrante se generó. Los residuos cargados positivamente del péptido interactúan con la columna vertebral de ácido nucleico cargado negativamente, para formar complejos. Estos complejos se pueden utilizar para transfectar eficazmente ADN o ARN en células cultivadas e in vivo en los tejidos.

Protocol

Nota: Todo el procedimiento incluyendo sujetos animales han sido aprobados por el Comité Institucional de Ética Animales (AICE) en el Instituto de Genómica y Biología Integrativa, Nueva Delhi (IGIB / AEC / 10/2013). Este protocolo se ajusta específicamente para la ejecución selectiva de antagomir-29 en el cerebro y desmontables de miR-29. 1. antagomir Estrategia Diseño Recuperar la secuencia de los genes miARN maduro de miRBase 11 <a href="http://www.mirbase.org/…

Representative Results

Usando el procedimiento que aquí se presenta, complejos de oligonucleótido 50microgram marcado con fluorescencia (FLO) y ~ 850microgram RVG péptido 1:15 relación de carga molar: se prepararon (FLO péptido) y se inyecta una sola vez a través de la vena de la cola. Complejo de la no-neurotrópico Matrix Virus de la Rabia (RVM) péptido y FLO fue utilizado como un control de entrega. Al día siguiente, los ratones se aislaron cerebro y el hígado y se prepararon suspensiones de células individuales. Las células se …

Discussion

Here we demonstrate a widely accessible methodology to study the effects of miRNA modulation. Currently, most attempts at in vivo characterization of miRNA functions involve the creation of knockout mice or a transgenic that expresses a miRNA sponge. Most miRNAs, even the cell type specific ones are expressed in more than one organ. For instance, miRNAs initially thought to be specific to the hematopoietic system are also expressed in the brain, due to the presence of microglia. Thus even a cell type specifi…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

We thank Souvik Maiti for help in designing the antagomirs. We also acknowledge Rangeetha J. Naik, Rakesh Dey, and Bijay Pattnaik for their help with experimental methods. This work was funded by the Council of Scientific and Industrial Research (BSC0123). HS, MV and RR acknowledge fellowship from the Council of Scientific and Industrial Research, India. MAS acknowledge fellowship from the University Grants Commission, India.

Materials

Vortex
Restrainer or Decapicone
Narrow runway ~70-cm-long, ~5-cm-wide with ~5-cm-high walls.
Reagents
Fluorescently labelled oligonucleotides (siGLO) GE Healthcare Dharmacon INC D0016300120
10% sterile D-glucose
Antagomir-29 Exiqon custom synthesis
Antagomir-control Exiqon custom synthesis
Neuropeptide RVG G.L.Biochem (Shanghai) Ltd. custom synthesis >98% purity
Neuropeptide RVM G.L.Biochem (Shanghai) Ltd. custom synthesis >98% purity
其他
Cotton
Warm water
Insulin syringes
Absorbent sheets
Ink
Brush
Antiseptic

References

  1. Roshan, R., Ghosh, T., Scaria, V., Pillai, B. MicroRNAs: novel therapeutic targets in neurodegenerative diseases. Drug discovery today. 14, 1123-1129 (2009).
  2. Maes, O. C., Chertkow, H. M., Wang, E., Schipper, H. M. MicroRNA: Implications for Alzheimer Disease and other Human CNS Disorders. Current Genomics. 10, 154-168 (2009).
  3. Soifer, H. S., Rossi, J. J., Saetrom, P. MicroRNAs in Disease and Potential Therapeutic Applications. Mol Ther. 15, 2070-2079 (2007).
  4. Bader, A. G., Brown, D., Winkler, M. The Promise of MicroRNA Replacement Therapy. Cancer research. 70, 7027-7030 (2010).
  5. Stenvang, J., Petri, A., Lindow, M., Obad, S., Kauppinen, S. Inhibition of microRNA function by antimiR oligonucleotides. Silence. 3, 1-17 (2012).
  6. Trang, P., et al. Systemic Delivery of Tumor Suppressor microRNA Mimics Using a Neutral Lipid Emulsion Inhibits Lung Tumors in Mice. Molecular Therapy. 19, 1116-1122 (2011).
  7. Barbash, S., Hanin, G., Soreq, H. Stereotactic Injection of MicroRNA-expressing Lentiviruses to the Mouse Hippocampus CA1 Region and Assessment of the Behavioral Outcome. J Vis Exp. (76), e50170 (2013).
  8. Kumar, P., et al. Transvascular delivery of small interfering RNA to the central nervous system. Nature. 448, 39-43 (2007).
  9. Roshan, R., et al. Brain-specific knockdown of miR-29 results in neuronal cell death and ataxia in mice. RNA. 20, 1287-1297 (2014).
  10. Kaur, H., Wengel, J., Maiti, S. Thermodynamics of DNA−RNA Heteroduplex Formation: Effects of Locked Nucleic Acid Nucleotides Incorporated into the DNA Strand. 生物化学. 47, 1218-1227 (2008).
  11. Griffiths-Jones, S., Grocock, R. J., Van Dongen, S., Bateman, A., Enright, A. J. miRBase: microRNA sequences, targets and gene nomenclature. Nucleic Acids Research. 34, D140-D144 (2006).
  12. Kaur, H., Babu, B. R., Maiti, S. Perspectives on Chemistry and Therapeutic Applications of Locked Nucleic Acid (LNA). Chemical Reviews. 107, 4672-4697 (2007).
  13. Guyenet, S. J., et al. A Simple Composite Phenotype Scoring System for Evaluating Mouse Models of Cerebellar Ataxia. J. Vis. Exp. (39), (2010).
  14. Bergen, J. M., Park, I. -. K., Horner, P. J., Pun, S. H. Nonviral Approaches for Neuronal Delivery of Nucleic Acids. Pharmaceutical Research. 25, 983-998 (2008).
  15. Zou, L. -. L., Ma, J. -. L., Wang, T., Yang, T. -. B., Liu, C. -. B. Cell-Penetrating Peptide-Mediated Therapeutic Molecule Delivery into the Central Nervous System. Current Neuropharmacology. 11, 197-208 (2013).
  16. Hwang, D. W., et al. A brain-targeted rabies virus glycoprotein-disulfide linked PEI nanocarrier for delivery of neurogenic microRNA. Biomaterials. 32, 4968-4975 (2011).
check_url/cn/53307?article_type=t

Play Video

Cite This Article
Suryawanshi, H., Sarangdhar, M. A., Vij, M., Roshan, R., Singh, V. P., Ganguli, M., Pillai, B. A Simple Alternative to Stereotactic Injection for Brain Specific Knockdown of miRNA. J. Vis. Exp. (106), e53307, doi:10.3791/53307 (2015).

View Video