Summary

Medición del flujo de sustrato mitocondrial en células perfrendolisaminas o-permeabilizadas recombinantes

Published: August 13, 2021
doi:

Summary

En este trabajo, describimos un protocolo modificado para probar el flujo del sustrato respiratorio mitocondrial utilizando perfringolisina O recombinante en combinación con respirometría basada en microplacas. Con este protocolo, mostramos cómo la metformina afecta la respiración mitocondrial de dos líneas celulares tumorales diferentes.

Abstract

El flujo de sustrato mitocondrial es una característica distintiva de cada tipo de célula, y los cambios en sus componentes, como transportadores, canales o enzimas, están involucrados en la patogénesis de varias enfermedades. El flujo de sustrato mitocondrial se puede estudiar utilizando células intactas, células permeabilizadas o mitocondrias aisladas. La investigación de células intactas encuentra varios problemas debido a la oxidación simultánea de diferentes sustratos. Además, varios tipos de células contienen almacenes internos de diferentes sustratos que complican la interpretación de los resultados. Métodos como el aislamiento mitocondrial o el uso de agentes permeabilizantes no son fácilmente reproducibles. Aislar mitocondrias puras con membranas intactas en cantidades suficientes a partir de muestras pequeñas es problemático. El uso de permeabilizadores no selectivos causa varios grados de daño inevitable de la membrana mitocondrial. La perfringolisina O recombinante (rPFO) se ofreció como un permeabilizante más apropiado, gracias a su capacidad para permeabilizar selectivamente la membrana plasmática sin afectar la integridad mitocondrial. Cuando se usa en combinación con la respirometría de microplacas, permite probar el flujo de varios sustratos mitocondriales con suficientes réplicas dentro de un experimento mientras se usa un número mínimo de células. En este trabajo, el protocolo describe un método para comparar el flujo de sustrato mitocondrial de dos fenotipos o genotipos celulares diferentes y se puede personalizar para probar varios sustratos o inhibidores mitocondriales.

Introduction

La respirometría basada en microplacas ha revolucionado la investigación mitocondrial al permitir el estudio de la respiración celular de un tamaño de muestra pequeño1. La respiración celular generalmente se considera como un indicador de la función mitocondrial o “disfunción”, a pesar del hecho de que el rango mitocondrial de funciones se extiende más allá de la producción de energía2. En condiciones aeróbicas, las mitocondrias extraen la energía almacenada en diferentes sustratos descomponiendo y convirtiendo estos sustratos en intermedios metabólicos que pueden alimentar el ciclo del ácido cítrico3 (Figura 1). El flujo continuo de sustratos es esencial para que el flujo del ciclo del ácido cítrico genere ‘donantes de electrones’ de alta energía, que entregan electrones a la cadena de transporte de electrones que genera un gradiente de protones a través de la membrana mitocondrial interna, lo que permite que la ATP-sintasa fosforila ADP a ATP4. Por lo tanto, un diseño experimental para evaluar la respiración mitocondrial debe incluir la naturaleza de la muestra (células intactas, células permeabilizadas o mitocondrias aisladas) y sustratos mitocondriales.

Las células mantienen un almacén de sustratos autóctonos5,y las mitocondrias oxidan varios tipos de sustratos simultáneamente6,lo que complica la interpretación de los resultados obtenidos de los experimentos realizados sobre células intactas. Un enfoque común para investigar la capacidad mitocondrial para oxidar un sustrato seleccionado es aislar las mitocondrias o permeabilizar las células investigadas5. Aunque las mitocondrias aisladas son ideales para estudios cuantitativos, el proceso de aislamiento es laborioso. Se enfrenta a dificultades técnicas como la necesidad de un gran tamaño de muestra, la pureza del rendimiento y la reproducibilidad de la técnica5. Las células permeabilizadas ofrecen una solución para las desventajas del aislamiento mitocondrial; sin embargo, los agentes permeabilizantes rutinarios de naturaleza detergente no son específicos y pueden dañar las membranas mitocondriales5.

La perfringolisina O recombinante (rPFO) se ofreció como agente permeabilizante selectivo de la membrana plasmática7,y se utilizó con éxito en combinación con un analizador de flujo extracelular en varios estudios7,8,9,10. Hemos modificado un protocolo utilizando rPFO para detectar el flujo de sustrato mitocondrial utilizando el analizador de flujo extracelular XFe96. En este protocolo, se comparan cuatro vías oxidantes de sustrato diferentes en dos fenotipos celulares mientras se tienen suficientes réplicas y el control adecuado para cada material probado.

Protocol

1. Un día antes del ensayo Preparación de reactivos y sustratos. Solución de ensayo mitocondrial (MAS): Preparar soluciones madre de todos los reactivos como se describe en la Tabla 1. Caliente las existencias de manitol y sacarosa a 37 °C para disolverlas por completo. Mezcle los reactivos para preparar 2x MAS, luego caliente la mezcla a 37 ° C. Ajuste el pH con 5N KOH a 7.4 (~ 7 mL), luego agregue agua para llevar el volumen hasta 1 L. Filtre-esterilice y almacene las alícuotas…

Representative Results

Comience por normalizar los resultados a la segunda medición de la respiración basal para mostrar los valores como porcentaje de tasa de consumo de oxígeno (OCR%). Los resultados del ensayo se muestran en las Figuras 5,Figura 6, Figura 7 y Figura 8. Es importante asignar los pozos de fondo adecuados para cada grupo e inactivar los pozos de fondo de otros grupos. <st…

Discussion

Este protocolo es una modificación de los estudios publicados previamente7,8,9,10 y la guía del usuario del producto. En contraste con el protocolo del fabricante, se utiliza 2x MAS en lugar de 3x MAS, ya que 2× MAS es más fácil de disolver y no forma precipitaciones después de la congelación. Las alícuotas MAS congeladas 2x se pueden almacenar hasta seis meses y muestran resultados con…

Divulgations

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Los autores agradecen a los miembros del personal del Departamento de Fisiología de la Facultad de Medicina de Hradec Králové y del Departamento de Fisiopatología de la Tercera Facultad de Medicina por la ayuda con los productos químicos y la preparación de muestras. Este trabajo fue apoyado por los programas de subvenciones de la Universidad Charles PROGRES Q40/02, la subvención NU21-01-00259 del Ministerio de Salud de la República Checa, la subvención de la fundación científica checa 18-10144 y el proyecto INOMED CZ.02.1.01/0.0/0.0/18_069/0010046 financiado por el Ministerio de Educación, Juventud y Deportes de la República Checa y por la Unión Europea.

Materials

Adinosine 5′ -diphosphate monopotassium salt dihydrate Merck A5285 store at -20 °C
Antimycin A Merck A8674 store at -20 °C
Bovine serum albumin Merck A3803 store at 2 – 8 °C
Carbonyl cyanide 4-(trifluoromethoxy)phenylhydrazone Merck C2920 store at -20 °C
Dimethyl sulfoxide Merck D8418 store at RT
D-Mannitol Merck 63559 store at RT
Dulbecco's phosphate buffered saline Gibco 14190-144 store at RT
Ethylene glycol-bis(2-aminoethylether)-N,N,N′,N′-tetraacetic acid Merck 03777 store at RT
HEPES Merck H7523 store at RT
L(-)Malic acid disodium salt Merck M9138 store at RT
L-Glutamic acid sodium salt hydrate Merck G5889 store at RT
Magnissium chloride hexahydrate Merck M2670 store at RT
Oligomycin Merck O4876 store at -20 °C
Palmitoyl-DL-carnitine chloride Merck P4509 store at -20 °C
Potassium hydroxide Merck 484016 store at RT
Potassium phosphate monobasic Merck P5655 store at RT
Rotenone Merck R8875 store at -20 °C
Seahorse Wave Desktop Software Agilent technologies Download from www.agilent.com
Seahorse XFe96 Analyzer Agilent technologies
Seahorse XFe96 FluxPak Agilent technologies 102416-100 XFe96 sensor cartridges and XF96 cell culture microplates
Sodium pyruvate Merck P2256 store at 2 – 8 °C
Sodium succinate dibasic hexahydrate Merck S2378 store at RT
Sucrose Merck S7903 store at RT
Water Merck W3500 store at RT
XF calibrant Agilent technologies 100840-000 store at RT
XF Plasma membrane permeabilizer Agilent technologies 102504-100 Recombinant perfringolysin O (rPFO) – Aliquot and store at -20 °C

References

  1. Gerencser, A. A., et al. Quantitative microplate-based respirometry with correction for oxygen diffusion. Analytical Chemistry. 81 (16), 6868-6878 (2009).
  2. Murphy, E., et al. Mitochondrial function, biology, and role in disease: A scientific statement from the American Heart Association. Circulation Research. 118 (12), 1960-1991 (2016).
  3. Owen, O. E., Kalhan, S. C., Hanson, R. W. The key role of anaplerosis and cataplerosis for citric acid cycle function. Journal of Biological Chemistry. 277 (34), 30409-30412 (2002).
  4. Nicholls, D. G., Ferguson, S. J. . Bioenergetics 3. , (2002).
  5. Brand, M. D., Nicholls, D. G. Assessing mitochondrial dysfunction in cells. Biochemical Journal. 435 (2), 297-312 (2011).
  6. Staňková, P., et al. Adaptation of mitochondrial substrate flux in a mouse model of nonalcoholic fatty liver disease. International Journal of Molecular Sciences. 21 (3), 1101 (2020).
  7. Salabei, J. K., Gibb, A. A., Hill, B. G. Comprehensive measurement of respiratory activity in permeabilized cells using extracellular flux analysis. Nature Protocols. 9 (2), 421-438 (2014).
  8. Divakaruni, A. S., et al. Thiazolidinediones are acute, specific inhibitors of the mitochondrial pyruvate carrier. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 110 (14), 5422-5427 (2011).
  9. Divakaruni, A. S., Rogers, G. W., Murphy, A. N. Measuring mitochondrial function in permeabilized cells using the seahorse XF analyzer or a Clark-type oxygen electrode. Current Protocols in Toxicology. 60, 1-16 (2014).
  10. Elkalaf, M., Tůma, P., Weiszenstein, M., Polák, J., Trnka, J. Mitochondrial probe Methyltriphenylphosphonium (TPMP) inhibits the Krebs cycle enzyme 2-Oxoglutarate dehydrogenase. PLoS One. 11 (8), 0161413 (2016).
  11. Rogers, G. W., et al. High throughput microplate respiratory measurements using minimal quantities of isolated mitochondria. PLoS One. 6 (7), 21746 (2011).
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Citer Cet Article
Elkalaf, M., Vaněčková, K., Staňková, P., Červinková, Z., Polák, J., Kučera, O. Measuring Mitochondrial Substrate Flux in Recombinant Perfringolysin O-Permeabilized Cells. J. Vis. Exp. (174), e62902, doi:10.3791/62902 (2021).

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