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De novo Identifizierung von aktiv übersetzten offenen Leserahmen mit Ribosom-Profiling-Daten
 
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De novo Identifizierung von aktiv übersetzten offenen Leserahmen mit Ribosom-Profiling-Daten

Article DOI: 10.3791/63366-v 08:23 min February 18th, 2022
February 18th, 2022

Chapitres

résumé

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Übersetzende Ribosomen dekodieren drei Nukleotide pro Codon in Peptide. Ihre Bewegung entlang der mRNA, die durch Ribosomenprofilierung erfasst wird, erzeugt die Fußabdrücke, die eine charakteristische Triplettperiodizität aufweisen. Dieses Protokoll beschreibt, wie RiboCode verwendet werden kann, um dieses herausragende Merkmal aus Ribosom-Profiling-Daten zu entschlüsseln, um aktiv übersetzte offene Leserahmen auf der Ebene des gesamten Transkriptoms zu identifizieren.

Tags

Biologie Ausgabe 180 Ribosom-Profiling offener Leserahmen mRNA-Translation Mikropeptid uORF dORF
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