Un test de concurrence plaque comme une rapide évaluation préliminaire de la Suppression de la maladie
Summary
Présenté est un protocole pour un test de concurrence de plaque déterminer si un compost spécifique est susceptible de contenir des bactéries et des champignons qui inhibent la croissance de Rhizoctonia solani.
Abstract
L’objectif était de développer et optimiser un bioessai de simple, abordable et efficace pour détecter les capacité suppressive de maladie d’un compost spécifique contre le champignon terricole Rhizoctonia solani. R. solani est un pathogène d’une large gamme de plantes-hôtes dans le monde entier. Le champignon survit dans le sol comme un saprophyte et pousse rapidement sur milieu gélosé eau simple. L’essai de plaque est une méthode rapide pour comparer les composts pour leur capacité à ralentir la croissance de r. solani. L’essai corrèle aussi bien avec la suppression d’autres pathogènes fongiques terricole qui survivent en tant que saprophytes dans les sols comme les premiers fléaux Alternaria, fusariose, pourridié phytophthoréen, Pythium et pourriture des racines.
Introduction
Rhizoctonia représente un vaste complexe de champignons, de laquelle Donk Thanatephorus cucumeris (Frank) (anamorphe Rhizoctonia solani Kühn de =) est l’agent pathogène causant la pourriture des racines et la fonte des semis1. Rhizoctonia solani est un pathogène agressif et un saprophyte qui peut survivre comme sclérotes sous des conditions environnementales défavorables1. En conséquence, il a une répartition mondiale et peut provoquer des maladies sur la large gamme de plantes hôtes, y compris les Solanaceae, Fabaceae, Asteraceae et Brassicaceae entraînant des pertes économiques sérieuses.
Compost a la capacité d’abriter des agents de lutte biologique pour certains agents pathogènes de plantes2. Cependant, pas tous les terreaux ne se ressemblent ni ils affectent tous les agents pathogènes de la même façon3. Carbone à base de bois a lignine supérieure aux ratios de cellulose que le foin ou la paille-carbone basé composts. R. solani préfère carbone facilement accessible dans la paille. En revanche, la lutte biologique champignons, tels que les espèces de Trichoderma , sont plus efficaces lorsque le carbone est moins facile d’obtenir. Champignons bénéfiques et les bactéries en compost peuvent supprimer des maladies des plantes par le biais de concours, antagonisme ou régulation de la croissance végétale3. Le test proposé détecte principalement antagonisme créée par la production d’antibiotiques, les ecoenzymes ou les chélateurs qui nuisent à l’agent pathogène.
Plantes biologiques sont un étalon-or pour déterminer si les composts favorisent ou dissuader de croissance végétale4. Cependant, plantes biologiques sont beaucoup de temps (semaines ou mois) pour terminer qui peut être plus longtemps que vous le souhaitez et exige plus de travail pour extraire les plantes avec des racines de quantifier la sévérité des systèmes racinaires. Relativement robuste, mais plus rapide des essais (jours) serait idéales pour les programmes de contrôle de la qualité. L’objectif de cet article est de démontrer un test relativement rapide et précis pour prédire le potentiel suppressive de compost. La méthode a été modelée après Alfano et al. 5 à deux exceptions près, des extraits de compost ont été dilués et gélose aqueuse a été utilisé à la place de la gélose dextrosée à la pomme de terre (PDA). R. solani pousse rapidement sur milieu gélosé simple d’eau tandis que le PDA a favorisé la croissance des bactéries et autres champignons qui a contaminé la culture6.
Cet essai de plaque sert d’indicateur de suppression qui s’applique à un éventail d’agents pathogènes des plantes qui survivent dans le sol comme saprophytes y compris r. solani7, les premiers fléaux Alternaria, fusariose, pourridié phytophthoréen et Pythium pourridié. Le test de concurrence de plaque est utile pour dépister une gamme de produits de compost pour endiguer les communautés de microbes qui servent d’agents de lutte biologique des agents pathogènes du sol. Le test a été un des indicateurs plus constants de la suppression de la maladie dans le compost commercial produits6,8. Produits ont été choisis pour leur variation dans la recette, maturité et processus de production.
Protocol
Representative Results
Discussion
Nous savons par les recherches antérieures, que certains composts sont efficaces pour réprimer r. solani et que les effets suppresseurs sont due à des microbes vivant dans le compost, pas les propriétés abiotiques de compost6,8. L’utilisation de l’autoclave afin de « tuer » microbiote a été critiquée parce qu’elle affecte la chimie du carbone des médias10. Nous avons comparé l’utilisation de l’autoclave pou…
Disclosures
The authors have nothing to disclose.
Acknowledgements
La recherche financée par le Vermont Agricultural Experiment Station concurrentiel Hatch programme VT-HO1609. Lynn Fang a utilisé la méthode dans le cadre de sa thèse de M.S. à l’Université du Vermont,6.
Materials
| autoclavable narrow-neck glass conical flask | Fisher Scientific | 10-040D | 125-mL |
| dehydrated granulated agar | Fisher Scientific | DF0145-17-0 | 500 g quantity |
| heat resistant gloves | Fisher Scientific | MEMGG1314WL | several brands available |
| Parafilm (strips of 2-3 cm wide) | Fisher Scientific | PM992 13-374-16 | 5 or 10 cm widths work |
| disposable polystyrene petri dishes | Fisher Scientific | R80116 | comes in sleeves of 20/ea or cases of 500 |
| dehydrated potato dextrose agar | Fisher Scientific | DF0013-15-8 | comes in quantities of 100, 500 and 2000 grams |
| benchtop reciprocal shaker | Thomas Scientific | 1227Y31 | other models will work |
| water bath | ThermoScientific | S37363 | 5L general purpose |
| clear ruler, flat, at least 10 cm | Any | use metric rule | |
| ATCC culture | American Type Culture Collection | ATCC 10154 | teleomorph Thanatephorus cucumeris (Frank) (ATCC 10154) or MYA 4031; |
| lab tape | Fisher Scientific | 15935 | autoclavable and removable, 1" wide preferred |
| water resistant marker | office or scientific supply | Sharpie fine tip | write sample number on tape |
References
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