Assay конкуренции плита как быстрой предварительной оценки заболевания подавления
Summary
Представлено — это протокол для конкуренции assay пластины для идентификации ли конкретные компост может содержать бактерии и грибки, которые подавляют рост Солани ризоктониоза.
Abstract
Целью было разработать и оптимизировать простой, доступной и эффективной биопроб для обнаружения болезни подавляющих способности конкретной компоста против soilborne гриб ризоктониоза Солани. R. Солани является патогеном широкого круга растения узлов во всем мире. Гриб сохраняется в почве как сапрофитные и растет быстрыми темпами на простой воды агар СМИ. Assay плита является быстрый метод для сравнения компостов для их способность замедлить рост R. Солани. Assay также хорошо коррелирует с подавления других soilborne грибковых патогенов, которые выживают как развернёт в почвах Alternaria ранних губит, фузариозному увяданию, фитофторозом корневым гнилям и Pythium корневой гнили.
Introduction
Ризоктониоза представляет собой широкий комплекс грибов, из которых Thanatephorus cucumeris (Франк) Донк (анаморфа = ризоктониоза Солани Кюна) является патогена, вызывая корневым гнилям и затухания от1. Ризоктониоза Солани является агрессивным возбудителя и сапрофитные, которые могут выжить как склероции при неблагоприятных условий окружающей среды1. В результате он имеет глобальное распространение и может вызвать заболевания на широкий спектр узлов растений, включая пасленовых, бобовые, сложноцветных и капустные, что привело к серьезным экономическим потерям.
Компост имеет способность питать биоконтроля агентов для определенных патогенов растений2. Однако, не все компостов так ни они влияют на все патогенов аналогично3. На основе древесины углерода имеет выше лигнина целлюлозы коэффициенты, чем сена или соломы углерода на основе компостов. R. Солани предпочитает легко доступны углерода в солому. В отличие от биологического контроля грибов, таких как Trichoderma spp., являются более эффективными, когда углерода менее доступными. Полезных грибов и бактерий в компост может подавлять болезни растений через конкурс, антагонизм или регулирование роста растений3. Главным образом предлагаемого анализа обнаруживает антагонизм, созданные производства антибиотиков, ecoenzymes или энтеросорбенты, которые наносят ущерб возбудителя.
Bioassays растений являются золотым стандартом для определения компостов пользу или сдерживать рост растений4. Однако, завод bioassays являются длительным (недель до месяцев) для завершения, который может быть больше, чем желаемого и требует больше труда для извлечения растения с корнями для количественного определения тяжести корневых систем. Соответствующе надежные, но быстрее (дней) анализов будет идеально подходит для контроля качества программ. Целью этой статьи является продемонстрировать относительно быстрый и точный тест, чтобы предсказать подавляющих потенциал компоста. Метод был рисунком после Альфано и др. 5 с двумя исключениями, экстракты компост разводили и агар воды был использован вместо картофеля декстроза агар (PDA). R. Солани растет быстрыми темпами на простой воды агар СМИ, тогда как КПК способствовало росту бактерий и других грибков, которые загрязнены культуры6.
Этот assay пластина служит индикатором подавления, которое применяется к ряду патогенов растений, которые выживают в почве как развернёт, включая р. Солани7, Alternaria ранних губит, фузариозному увяданию, фитофторозом корневым гнилям и Pythium корневой гнили. Assay конкуренции плита является полезным для экран ряд продуктов компоста для содержащих сообществ микробов, которые служат в качестве биоконтролирующих агентов почвенными патогеннами. Assay был одним из наиболее последовательных показателей заболевания подавления в коммерческих компост продукты6,8. Продукты были выбраны для их изменения в рецепт, зрелости и производственного процесса.
Protocol
Representative Results
Discussion
Из предыдущих исследований, мы знаем, что некоторые компостов являются эффективными на подавление R. Солани и что подавляющее воздействие благодаря микробов, живущих в компост, не абиотических свойства компоста6,8. Использование автоклавирования ка?…
Disclosures
The authors have nothing to disclose.
Acknowledgements
Вермонт сельскохозяйственной опытной станции конкурентных Люк программы VT-HO1609 финансирование исследований. Линн Fang используется метод как часть защитила диссертацию магистра в университете штата Вермонт6.
Materials
| autoclavable narrow-neck glass conical flask | Fisher Scientific | 10-040D | 125-mL |
| dehydrated granulated agar | Fisher Scientific | DF0145-17-0 | 500 g quantity |
| heat resistant gloves | Fisher Scientific | MEMGG1314WL | several brands available |
| Parafilm (strips of 2-3 cm wide) | Fisher Scientific | PM992 13-374-16 | 5 or 10 cm widths work |
| disposable polystyrene petri dishes | Fisher Scientific | R80116 | comes in sleeves of 20/ea or cases of 500 |
| dehydrated potato dextrose agar | Fisher Scientific | DF0013-15-8 | comes in quantities of 100, 500 and 2000 grams |
| benchtop reciprocal shaker | Thomas Scientific | 1227Y31 | other models will work |
| water bath | ThermoScientific | S37363 | 5L general purpose |
| clear ruler, flat, at least 10 cm | Any | use metric rule | |
| ATCC culture | American Type Culture Collection | ATCC 10154 | teleomorph Thanatephorus cucumeris (Frank) (ATCC 10154) or MYA 4031; |
| lab tape | Fisher Scientific | 15935 | autoclavable and removable, 1" wide preferred |
| water resistant marker | office or scientific supply | Sharpie fine tip | write sample number on tape |
References
- Gonzalez Garcia, G., Onco, M. A. P., Susan, V. R. Review. Biology and systematics of the form genus Rhizoctonia. Spanish Journal of Agricultural Research. 4 (1), 55-79 (2006).
- Bonanomi, G., Antignani, V., Pane, C., Scala, E. Suppression of soilborne fungal diseases with organic amendments. Journal of Plant Pathology. 89, 311-324 (2007).
- Noble, R. Risks and benefits of soil amendment with composts in relation to plant pathogens. Australasian Plant Pathology. 40, 157-167 (2011).
- Wichuk, K. M., McCartney, D. Compost stability and maturity evaluation – a literature review. Canadian Journal of Civil Engineering. 37, 1505-1523 (2010).
- Alfano, G., Lustrato, G., Lima, G., Vitullo, D., Ranalli, G. Characterization of composted olive mill wastes to predict potential plant disease suppressiveness. Biological Control. 3, 199-207 (2011).
- Fang, L. . Biological indicators of compost-mediated disease suppression against the soilborne plant pathogen Rhizoctonia solani. , (2015).
- Bonanomi, G., Antignani, V., Capodilupo, M., Scala, F. Identifying the characteristics of organic soil amendments that suppress soilborne plant diseases. Soil Biology and Biochemistry. 42, 136-144 (2010).
- Neher, D. A., Fang, L., Weicht, T. R. Ecoenzymes as indicators of compost to suppress Rhizoctonia solani. Compost Science and Utilization. 25 (4), 251-261 (2017).
- . ATCC® Mycology Culture Guide Available from: https://www.atcc.org/~/media/PDFs/Culture%20Guides/Mycology_Guide.ashx (2018)
- Berns, A. E., Phillip, H., Narres, H. -. D., Burauel, P., Vereecken, H., Tappe, W. Effect of gamma-sterilization and autoclaving on soil organic matter structure as studied by solid state NMR, UV and fluorescence spectroscopy. European Journal of Soil Science. 59, (2008).
