Un test di competizione di piatto come una rapida valutazione preliminare di soppressione di malattia
Summary
Un protocollo per l’analisi di un concorso di piastra identificare se un compost specifico è probabile contenere batteri e funghi che sopprimono la crescita di Rhizoctonia solaniè presentato.
Abstract
L’obiettivo era quello di sviluppare e ottimizzare analisi biologica un semplice, conveniente ed efficace per rilevare capacità soppressive di malattia di un compost specifico contro terricole fungo Rhizoctonia solani. R. solani è un agente patogeno di una vasta gamma di ospiti della pianta in tutto il mondo. Il fungo sopravvive in terreni come un saprofito e cresce rapidamente su agarizzati di semplice acqua. L’analisi del piatto è un metodo rapido per confrontare il compost per la loro capacità di rallentare la crescita di r. solani. L’analisi inoltre correla bene con soppressione di altri patogeni fungini terricole che sopravvivono come saprofiti nel suolo come primi arruginisce Alternaria, Fusarium, Phytophthora putrefazione di radice e marciume radicale Pythium.
Introduction
Rhizoctonia rappresenta un vasto complesso di funghi, di cui Donk Thanatephorus cucumeris (Frank) (anamorph = Rhizoctonia solani Kühn) è l’agente patogeno che causa marciume radicale e smorzamento-off1. Rhizoctonia solani è un agente patogeno aggressivo e un saprofita che può sopravvivere come sclerozi sotto condizioni ambientali1. Di conseguenza, ha una distribuzione globale e possono causare malattie su vasta gamma di ospiti della pianta tra cui Solanaceae, Fabaceae, Asteraceae e Brassicaceae causando gravi perdite economiche.
Compost ha la capacità di agenti di biocontrollo per determinati patogeni di pianta2del porto. Tuttavia, non tutti i composti sono uguali né colpiscono tutti gli agenti patogeni allo stesso modo3. Carbonio a base di legno ha lignina superiore ai rapporti di cellulosa di fieno o paglia-carbonio basata compost. R. solani preferisce prontamente disponibile carbonio trovato in paglia. Al contrario, funghi di controllo biologico, come Trichoderma spp., sono più efficaci quando il carbonio è meno prontamente disponibile. Benefici funghi e batteri in compost possono sopprimere la malattia delle piante attraverso la competizione, antagonismo o che regolano la crescita della pianta3. Il dosaggio proposto rileva principalmente antagonismo creato da produzione di antibiotici, ecoenzymes o chelanti che sono dannosi per l’agente patogeno.
Pianta le analisi biologiche sono un gold standard per determinare se il compost favorire o scoraggiare la crescita della pianta4. Tuttavia, le analisi biologiche pianta sono richiede molto tempo (settimane o mesi) per completare che può essere più di quanto desiderato e richiede più lavoro per estrarre piante con radici per quantificare la gravità degli apparati radicali. In modo paragonabile robusto, ma più veloce analisi (giorni) sarebbe l’ideale per i programmi di controllo di qualità. L’obiettivo di questa carta è di dimostrare un test relativamente rapido e accurato per predire soppressivo potenziale di compost. Il metodo è stato modellato dopo Alfano et al. 5 con due eccezioni, compost estratti sono stati diluiti e agar di acqua è stato usato al posto di agar di patata destrosio (PDA). R. solani cresce rapidamente su agarizzati di acqua semplice considerando che PDA promosso la crescita di batteri e altri funghi che hanno contaminato la cultura6.
Questa analisi del piatto serve come un indicatore di soppressione che si applica a una gamma di agenti patogeni della pianta che sopravvivere nel suolo come saprofiti, tra cui r. solani7, primi arruginisce Alternaria, Fusarium, Phytophthora putrefazione di radice e marciume radicale Pythium. L’analisi di concorrenza del piatto è utile per lo screening di una gamma di prodotti di compost per contenente la comunità di microbi che fungono da agenti di controllo biologico degli agenti patogeni del suolo. Il dosaggio è stato uno degli indicatori più coerenti della soppressione della malattia in compost commerciale prodotti6,8. I prodotti sono stati scelti per la loro variazione nella ricetta, la maturità e processo di produzione.
Protocol
Representative Results
Discussion
Sappiamo da precedenti ricerche, che alcuni composti sono efficaci a sopprimere r. solani e che gli effetti soppressivi sono dovuto i microbi che vivono nel compost, non le proprietà abiotici di compost6,8. L’uso di autoclave come un mezzo per ‘uccidere’ microbiota è stata criticata perché interessa la chimica del carbonio di media10. Abbiamo confrontato l’uso di autoclave per filtrazione sotto vuoto tramite carta Whatman n. 1….
Disclosures
The authors have nothing to disclose.
Acknowledgements
Il Vermont Agricultural Experiment Station competitivo Hatch programma VT-HO1609 ha finanziato la ricerca. Lynn Fang ha utilizzato il metodo come parte della sua tesi di M.S. presso University of Vermont6.
Materials
| autoclavable narrow-neck glass conical flask | Fisher Scientific | 10-040D | 125-mL |
| dehydrated granulated agar | Fisher Scientific | DF0145-17-0 | 500 g quantity |
| heat resistant gloves | Fisher Scientific | MEMGG1314WL | several brands available |
| Parafilm (strips of 2-3 cm wide) | Fisher Scientific | PM992 13-374-16 | 5 or 10 cm widths work |
| disposable polystyrene petri dishes | Fisher Scientific | R80116 | comes in sleeves of 20/ea or cases of 500 |
| dehydrated potato dextrose agar | Fisher Scientific | DF0013-15-8 | comes in quantities of 100, 500 and 2000 grams |
| benchtop reciprocal shaker | Thomas Scientific | 1227Y31 | other models will work |
| water bath | ThermoScientific | S37363 | 5L general purpose |
| clear ruler, flat, at least 10 cm | Any | use metric rule | |
| ATCC culture | American Type Culture Collection | ATCC 10154 | teleomorph Thanatephorus cucumeris (Frank) (ATCC 10154) or MYA 4031; |
| lab tape | Fisher Scientific | 15935 | autoclavable and removable, 1" wide preferred |
| water resistant marker | office or scientific supply | Sharpie fine tip | write sample number on tape |
References
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