Journal
/
/
Une plate-forme intégrée pour la cartographie de la Genome-wide, des États de la chromatine, à l’aide de la puce séquençage haut-débit dans les tissus de la tumeur
JoVE Journal
Cancer Research
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Cancer Research
An Integrated Platform for Genome-wide Mapping of Chromatin States Using High-throughput ChIP-sequencing in Tumor Tissues
DOI:

10:41 min

April 05, 2018

, , , , , , ,

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:31Tissue/Cell Line Processing and Cross-linking
  • 01:57Tissue Lysis, Sonication, and Antibody Preparation
  • 02:52Chromatin Immunoprecipitation
  • 03:40Washing and Reverse Cross-linking of Immunoprecipitated DNA-protein Complexes
  • 04:43Purification and Quantification of Precipitated DNA
  • 06:00Library Generation Using the NEBNext Ultra II DNA Library Preparation Kit
  • 07:53Results: Immunoprecipitation of Tumor Tissues and Cells Using High-throughput ChIP-sequencing
  • 09:23Conclusion

Summary

Automatic Translation

Nous décrivons ici un protocole de puce-séquençage haut débit optimisé et pipeline analyses calcul pour la détermination de modèles État pangénomique chromatine de lignées de cellules et tissus tumoraux congelés.

Related Videos

Read Article