Journal
/
Cancer Research
/
Yüksek işlem hacmi ChIP-sıralama tümör dokularda kullanarak genom geniş eşleme Kromatin devletler için entegre bir Platform
JoVE Journal
Cancer Research
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Cancer Research
An Integrated Platform for Genome-wide Mapping of Chromatin States Using High-throughput ChIP-sequencing in Tumor Tissues
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Yüksek işlem hacmi ChIP-sıralama tümör dokularda kullanarak genom geniş eşleme Kromatin devletler için entegre bir Platform

DOI:
10.3791/56972-v

•

10:41 min

•

April 05, 2018

•

, , , , , , ,
1Department of Genomic Medicine,University of Texas MD Anderson Cancer Center, 2The Jackson Laboratory for Genomic Medicine

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:31Tissue/Cell Line Processing and Cross-linking
  • 01:57Tissue Lysis, Sonication, and Antibody Preparation
  • 02:52Chromatin Immunoprecipitation
  • 03:40Washing and Reverse Cross-linking of Immunoprecipitated DNA-protein Complexes
  • 04:43Purification and Quantification of Precipitated DNA
  • 06:00Library Generation Using the NEBNext Ultra II DNA Library Preparation Kit
  • 07:53Results: Immunoprecipitation of Tumor Tissues and Cells Using High-throughput ChIP-sequencing
  • 09:23Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Burada, bir en iyi duruma getirilmiş yüksek işlem hacmi ChIP-sıralama Protokolü ve genom çapında Kromatin devlet desenlerini donmuş tümör doku ve hücre hatları belirlenmesi için hesaplama analizleri potansiyel açıklar.

Tags

Chromatin StatesChIP-sequencingCancer EpigeneticsHistone ModificationsChromatin FragmentsHistone AntibodiesProtein G Magnetic BeadsChIP Dilution Buffer

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

<em> Drosophila</em> Hayali Disk Tümör Modeli: Genetik Mozaikler kullanma Gen İfade ve Tümör invazivliğinin Görselleştirme ve

Tümör hücre görselleştirme akciğer dokusu içinde dolaşan bir akciğer kolonizasyon tahlil kurulması

Tedavi Oncolytic virusu modüle ana faktörleri tanımlamak için genom çapında RNAi tarama

Fare Beyin tümör Neurospheres kullanarak yerel Kromatin Immunoprecipitation

Yüksek işlem hacmi üç boyutlu tümör pulcuklarının nesil uyuşturucu taraması

Dijital polimeraz zincir reaksiyonu tahlil için tüp içinde çip biçimini kullanarak bir sporadik ailesel Adenomatous poliposis hastada genetik varyasyon

In vitro assay tümör çalışma-macrophage etkileşim

İnce Barsak Nöroendokrin Tümör Spheroidlerinin Kurulması ve Karakterizasyonu

Gastrointestinal Kanserde DNA Metilasyonunun Genom Çapında Analizi

Hasta Kaynaklı Tümör, Hastalarda İlaç Direncini Tahmin Etmek İçin "Canlı" Preklinik Bir Platform Olarak Eksplantlar

Read Article