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ट्यूमर के ऊतकों में उच्च प्रवाह चिप-अनुक्रमण का उपयोग कर क्रोमेटिन राज्यों के जीनोम चौड़ा मानचित्रण के लिए एक एकीकृत मंच
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An Integrated Platform for Genome-wide Mapping of Chromatin States Using High-throughput ChIP-sequencing in Tumor Tissues
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ट्यूमर के ऊतकों में उच्च प्रवाह चिप-अनुक्रमण का उपयोग कर क्रोमेटिन राज्यों के जीनोम चौड़ा मानचित्रण के लिए एक एकीकृत मंच

DOI:
10.3791/56972-v

•

10:41 min

•

April 05, 2018

•

, , , , , , ,
1Department of Genomic Medicine,University of Texas MD Anderson Cancer Center, 2The Jackson Laboratory for Genomic Medicine

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:31Tissue/Cell Line Processing and Cross-linking
  • 01:57Tissue Lysis, Sonication, and Antibody Preparation
  • 02:52Chromatin Immunoprecipitation
  • 03:40Washing and Reverse Cross-linking of Immunoprecipitated DNA-protein Complexes
  • 04:43Purification and Quantification of Precipitated DNA
  • 06:00Library Generation Using the NEBNext Ultra II DNA Library Preparation Kit
  • 07:53Results: Immunoprecipitation of Tumor Tissues and Cells Using High-throughput ChIP-sequencing
  • 09:23Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

यहाँ, हम जमे हुए ट्यूमर ऊतकों और सेल लाइनों से जीनोम चौड़ा क्रोमेटिन राज्य पैटर्न के निर्धारण के लिए एक अनुकूलित उच्च प्रवाह चिप अनुक्रमण प्रोटोकॉल और गणनात्मक विश्लेषण पाइपलाइन का वर्णन ।

Tags

Chromatin StatesChIP-sequencingCancer EpigeneticsHistone ModificationsChromatin FragmentsHistone AntibodiesProtein G Magnetic BeadsChIP Dilution Buffer

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