/

/

خط أنابيب المعلوماتية الحيوية للتحقيق في التطور الجزيئي والتعبير الجيني باستخدام الحمض النووي الريبي-seq

JoVE Journal
Biology

A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.

JoVE Journal Biology

A Bioinformatics Pipeline for Investigating Molecular Evolution and Gene Expression using RNA-seq

Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

خط أنابيب المعلوماتية الحيوية للتحقيق في التطور الجزيئي والتعبير الجيني باستخدام الحمض النووي الريبي-seq

DOI:

10.3791/61633-v

•

07:09 min

•

May 28, 2021

•

Aide Macias-Muñoz, Ali Mortazavi

¹Department of Developmental and Cell Biology,University of California, Irvine

Chapters

00:04Introduction
00:44Obtain RNA-seq Reads and Reference Assembly
01:57Identify Genes of Interest
03:32Phylogenetic Trees
04:21Results: Opsin Genes in Hydra vulgaris
06:20Conclusion

Summary

Automatic Translation

الغرض من هذا البروتوكول هو التحقيق في تطور والتعبير عن الجينات المرشحة باستخدام بيانات تسلسل الحمض النووي الريبي.

Tags

Keywords: Bioinformatics Pipeline Molecular Evolution Gene Expression RNA-seq SRA Toolkit NCBI FASTQ Reference Genome GTF FASTA Gene Mapping Gene Expression BLAST Homologous Genes Gene Annotation MEGA

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

الجزيئية تطور Recombinase تري

التحضير لزراعة الخلايا المكونة للدم الابتدائية من نخاع عظام الفئران لElectroporation

باستخدام الجينات Electroporation MXcell بولسير النظام لTransfect الخلايا الأولية ذات الكفاءة العالية

باستخدام خلية مكافحة الآلي لتبسيط دراسات التعبير الجيني : ضربة قاضية سيرنا من IL - 4 التعبير الجيني في الخلايا التابعة Namalwa

البارافين ، جزءا لا يتجزأ من والمجمدة أقسام ذبابة الفاكهة

إعادة إعماره في المختبر من أحدث T. castaneum تيلوميراز

بروتوكول لبنية البروتين القائم على الحاسوب والتنبؤات وظيفة

تحليل الحمض النووي الريبي العالمي التجميعي على مستوى خلية واحدة نقص الأكسجة التالي

قياس معدل الأيض في<em> ذبابة الفاكهة</em> باستخدام قياس التنفس

والتجريبية وبروتوكول المعلوماتية الحيوية لتحليل-RNA وما يليها من دور التعرض للضوء الكمون في النمر الآسيوي البعوض،<em> بحمى الضنك</em

Read Article