Summary

Cultivo de bacterias magnétotactiques del género Magnetotacticum: cepas MSR-1, 1 AMB y MS-1

Published: October 17, 2018
doi:

Summary

Presentamos un procedimiento para el crecimiento de varias cepas de Magnetotacticum en dos tipos diferentes de medios de cultivo. Cepa gryphiswaldense Magnetotacticum MSR-1 se cultiva en líquido y gradiente de la concentración de O2 medios semisólidos mientras M. magneticum cepa 1 AMB y M. Magnetospirillum cepa MS-1 se cultivan en medio líquido.

Abstract

Magnétotactiques bacterias son procariotas Gram-negativos, móviles, principalmente acuáticos ubicuos en hábitats de agua dulce y marinos. Se caracterizan por su capacidad de magnetosomes biomineralize, que son magnéticos cristales tamaño de nanómetros de magnetita (Fe3O4) o greigite (Fe3S4) rodeados por una membrana de bicapa lipídica, en su citoplasma. Para la mayoría de las bacterias conocidas magnétotactiques, magnetosomes se montan en cadenas dentro del citoplasma, lo que confiere un permanente momento de dipolo magnético a las células y haciendo que alinear pasivamente con campos magnéticos externos. Debido a estas características específicas, magnétotactiques las bacterias tienen un gran potencial para aplicaciones comerciales y médicas. Sin embargo, la mayoría de especies son microaerofílicas y O2 concentración requisitos específicos, haciéndolos más difícil de cultivar rutinariamente que muchas otras bacterias como Escherichia coli. Aquí presentamos protocolos detallados para el cultivo de tres de las cepas más ampliamente estudiadas de bacterias magnétotactiques, todos pertenecientes al género Magnetotacticum. Estos métodos permiten un control preciso de la concentración de O2 a disposición de las bacterias, con el fin de asegurarse de que crecen normalmente y sintetizar magnetosomes. Cultivo de bacterias magnétotactiques para futuros estudios con estos procedimientos no requiere el experimentador a ser un experto en Microbiología. Los métodos generales presentados en este artículo pueden usarse para aislar y cultura otras bacterias magnétotactiques, aunque es probable que composición química de los medios de crecimiento tendrán que modificarse.

Introduction

Magnétotactiques bacterias (MTB) representan una amplia gama de procariotas gramnegativos ubicuos en ambientes acuáticos de agua dulce y marinos1. Estas bacterias comparten la habilidad de producir cristales magnéticos de magnetita (Fe3O4) o greigite (Fe3S4), que son en la mayoría de los casos montada en cadenas dentro de las células. Este motivo estructural particular es debido a la presencia de varias proteínas específicas que actúan tanto en el citoplasma de la bacteria y la membrana lipídica que envuelve cada cristal2. Cada cristal individual y su vesícula de membrana circundante se llama un magnetosome y es que van en tamaño desde unos 30 a 50 nm en Magnetotacticum especies3. Debido a la disposición de la cadena de magnetosomes, estas bacterias poseen un permanente momento de dipolo magnético que hace alinear pasivamente con campos magnéticos aplicados externamente. Por lo tanto, estas bacterias nadan activamente a lo largo de líneas del campo magnético, actuando como automotores micro-brújulas presumiblemente más efectivamente localizar las condiciones más favorables (por ej., concentración de O2 ) para el crecimiento.

Una propiedad interesante de MTB es su capacidad para regular la química y la cristalografía de los cristales de magnetosome. Mayoría de las cepas produce cristales de pureza relativamente elevada de magnetita o greigite, aunque algunos biomineralize ambos minerales4. En todos los casos, las bacterias son capaces de controlar con precisión el tamaño y la forma de sus cristales solo dominio magnético. Esto explica por qué una gran cantidad de investigación se lleva a cabo para desarrollar una mejor comprensión de cómo MTB realizar este proceso de biomineralización. Comprender este proceso permitiría a los investigadores a adaptar-hacer nanocristales magnéticos para muchos usos médicos y comerciales.

Un obstáculo importante a la investigación extensa sobre MTB ha sido la dificultad de cultivarlas en el laboratorio. Mayoría de las especies, incluyendo las cepas utilizadas en este trabajo, es obligatoriamente microaerofílico cuando se cultiva con O2 como aceptor terminal de electrones. Esto explica por qué estas bacterias más a menudo se encuentran en la zona de transición entre condiciones anóxicas y óxicas (la interfaz oxic-anoxic, OAI). Esto claramente muestra que MTB O2 concentración requerimientos precisos que obviamente debe tenerse en cuenta al elaborar medios de cultivo para estos organismos. Por otra parte, la gran diversidad existente de MTB implica que diferentes cepas tendrán diferentes tipos de gradientes químicos y nutrientes para lograr un crecimiento óptimo.

En este trabajo, describimos los métodos para el cultivo de tres de la MTB más ampliamente estudiado: magneticum Magnetotacticum (cepa AMB-1), M. Magnetospirillum (MS-1) y M. gryphiswaldense (MSR-1). Estas especies pertenecen a la clase Alphaproteobacteria en el phylum proteobacterias filogenéticamente, son helicoidales en morfología y poseen un flagelo polar en cada extremo de la célula. Proporcionamos los protocolos para el cultivo de cepa MSR-1 en líquido y O gradiente de concentración semisólidos medios2 , basados en recetas medio previamente publicados5,6. También presentamos un protocolo detallado para el cultivo de cepas 1 AMB y 1 MS en modificado magnético Spirillum crecimiento medio (MGSM)7.

Protocol

1. instalación de la estación2 de N Nota: Elija el diámetro interno de la tubería por lo que se puede conectar al tanque de gas con fuga mínima y para que el cilindro de una jeringa de plástico de 1 mL se ajusta firmemente en esta tubería. Para ilustrar el completa N2 estación de burbujeo se proporciona en la figura 1. Con seguridad, instale un tanque de gas N2 cerca de un banco en el que hay espacio suficiente pa…

Representative Results

Exitosa preparación de los medios de crecimiento puede ser evaluada como sigue. Al final del proceso, claro soluciones (es decir., libre de cualquier precipitado) se debe obtener (esto es válido para los medios líquidos y el medio semisólido gradiente de O2 ). Una foto mostrando el aspecto esperado de medio líquido de MSR-1 antes de la inoculación puede verse en la Figura 2a. Un éxito medio semisólido O2 gradiente de con…

Discussion

Los requisitos específicos de concentración de2 O de MTB hacen no trivial para crecer en el laboratorio. Un paso clave del Protocolo de medio líquido es la eliminación inicial de todos O2 del medio para el control de la concentración final mediante la adición de un volumen definido de O2, justo antes de la inoculación. Se ha demostrado que el MSR-1 crece en condiciones aerobias casi completamente, sin embargo, el magnetismo de las células se reduce drásticamente. Los resultados d…

Divulgations

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Agradecemos a Richard B. Frankel por su ayuda con MTB culturas Adam P. Hitchcock y Xiaohui Zhu su apoyo durante la configuración de las culturas MTB en la Universidad de McMaster y Marcia Reid para la formación y el acceso a las instalaciones de microscopía electrónica (McMaster University, Facultad de Ciencias de la salud). Este trabajo fue apoyado por las ciencias naturales e Ingeniería investigación Consejo de Canadá (NSERC) y la Fundación Nacional de ciencia.

Materials

AMB-1 American Type Culture Collection (ATCC) ATCC 700264
MS-1 ATCC ATCC 31632 
MSR-1 Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen (DSMZ) DSM 6361
Ferric citrate Sigma-Aldrich F3388-250G
Trace mineral supplement ATCC MD-TMS
KH2PO4 EMD PX1565-1
MgSO4.7 H2O EMD MX0070-1
HEPES BioShop Canada Inc HEP001.250
NaNO3 Sigma-Aldrich S5506-250G
Yeast extract Fischer scientific DF210929
Peptone Fischer scientific DF0436-17-5
Potassium L-lactate solution (60%) Sigma-Aldrich 60389-250ML-F
D-(-)-Quinic acid Sigma-Aldrich 138622
FeCl3.6H2O Fischer scientific I88-100
Vitamin supplement ATCC MD-VS
Sodium succinate hexahydrate Fischer scientific S413-500
Sodium L-tartrate dibasic dihydrate Sigma-Aldrich 228729-100G
Sodium acetate trihydrate EMD SX0255-1
Resazurin Difco 0704-13
Ascorbic acid Sigma-Aldrich A4544-25G
K2HPO4 Caledon 6620-1-65
FeCl2 .4H2O Sigma-Aldrich 44939-250G
Sodium bicarbonate EMD SX0320-1
NaCl Caledon 7560-1
NH4Cl EMD 1011450500
CaCl2.2 H2O EMD 1023820500
Agar A Bio Basic Canada Inc FB0010
L-cysteine.HCl.H2O Sigma-Aldrich C7880-100G
1.0 mL syringes Fischer scientific B309659
25G  x 1 needles BD 305125
125 mL serum bottles Wheaton 223748
20 mm aluminum seals Wheaton 224223-01
20mm E-Z Crimper Wheaton W225303
Butyl-rubber stoppers Bellco Glass, Inc. 2048-11800
Hungate tubes Chemglass (VWR) CLS-4208-01
Septum stopper, 13mm, Hungate Bellco Glass, Inc. 2047-11600
Glass culture Tubes Corning (VWR) 9826-16X
Hydrochloric acid 36.5-38%, BioReagent Sigma-Aldrich H1758-100ML 11.6 – 12 N

References

  1. Blakemore, R. P. Magnetotactic bacteria. Annual Reviews in Microbiology. 36 (1), 217-238 (1982).
  2. Uebe, R., Schüler, D. Magnetosome biogenesis in magnetotactic bacteria. Nature Reviews Microbiology. 14 (10), 621 (2016).
  3. Faivre, D., Schuler, D. Magnetotactic bacteria and magnetosomes. Chemical Reviews. 108 (11), 4875-4898 (2008).
  4. Bazylinski, D. A., et al. Controlled biomineralization of magnetite (Fe3O4) and greigite (Fe3S4) in a magnetotactic bacterium. Applied and Environmental Microbiology. 61 (9), 3232-3239 (1995).
  5. Lefèvre, C. T., et al. Diversity of magneto-aerotactic behaviors and oxygen sensing mechanisms in cultured magnetotactic bacteria. Biophysical Journal. 107 (2), 527-538 (2014).
  6. Heyen, U., Schüler, D. Growth and magnetosome formation by microaerophilic Magnetospirillum strains in an oxygen-controlled fermentor. Applied Microbiology and Biotechnology. 61 (5-6), 536-544 (2003).
  7. Blakemore, R. P., Maratea, D., Wolfe, R. S. Isolation and pure culture of a freshwater magnetic spirillum in chemically defined medium. Journal of bacteriology. 140 (2), 720-729 (1979).
  8. Oestreicher, Z., Lower, S. K., Lin, W., Lower, B. H. Collection, isolation and enrichment of naturally occurring magnetotactic bacteria from the environment. Journal of Visualized Experiments. (69), (2012).
  9. Pósfai, M., Lefèvre, M., Trubitsyn, C., Bazylinski, D. A., Frankel, R. Phylogenetic significance of composition and crystal morphology of magnetosome minerals. Frontiers in Microbiology. 4, 344 (2013).
  10. Wolfe, R. S., Thauer, R. K., Pfennig, N. A ‘capillary racetrack’ method for isolation of magnetotactic bacteria. FEMS Microbiology Ecology. 3 (1), 31-35 (1987).
  11. Schübbe, S., et al. Characterization of a spontaneous nonmagnetic mutant of Magnetospirillum gryphiswaldense reveals a large deletion comprising a putative magnetosome island. Journal of Bacteriology. 185 (19), 5779-5790 (2003).
  12. Nadkarni, R., Barkley, S., Fradin, C. A comparison of methods to measure the magnetic moment of magnetotactic bacteria through analysis of their trajectories in external magnetic fields. PloS One. 8 (12), e82064 (2013).
  13. Waisbord, N., Lefèvre, C. T., Bocquet, L., Ybert, C., Cottin-Bizonne, C. Destabilization of a flow focused suspension of magnetotactic bacteria. Physical Review Fluids. 1 (5), 053203 (2016).
  14. Komeili, A., Vali, H., Beveridge, T. J., Newman, D. K. Magnetosome vesicles are present before magnetite formation, and MamA is required for their activation. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 101 (11), 3839-3844 (2004).
  15. Scheffel, A., et al. An acidic protein aligns magnetosomes along a filamentous structure in magnetotactic bacteria. Nature. 440 (7080), 110 (2006).
  16. Zhu, X., et al. Measuring spectroscopy and magnetism of extracted and intracellular magnetosomes using soft X-ray ptychography. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 113 (51), E8219-E8227 (2016).
  17. Schüler, D. Molecular analysis of a subcellular compartment: the magnetosome membrane in Magnetospirillum gryphiswaldense. Archives of Microbiology. 181 (1), 1-7 (2004).
  18. Kolinko, I., et al. Biosynthesis of magnetic nanostructures in a foreign organism by transfer of bacterial magnetosome gene clusters. Nature Nanotechnology. 9 (3), 193 (2014).
  19. Hergt, R., et al. Magnetic properties of bacterial magnetosomes as potential diagnostic and therapeutic tools. Journal of Magnetism and Magnetic Materials. 293 (1), 80-86 (2005).
  20. Lefevre, C. T., et al. Novel magnetite-producing magnetotactic bacteria belonging to the Gammaproteobacteria. The ISME Journal. 6 (2), 440 (2012).
  21. Williams, T. J., Lefèvre, C. T., Zhao, W., Beveridge, T. J., Bazylinski, D. A. Magnetospira thiophila gen. nov., sp. nov., a marine magnetotactic bacterium that represents a novel lineage within the Rhodospirillaceae (Alphaproteobacteria). International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 62 (10), 2443-2450 (2012).
  22. Zhu, K., et al. Isolation and characterization of a marine magnetotactic spirillum axenic culture QH-2 from an intertidal zone of the China Sea. Research in Microbiology. 161 (4), 276-283 (2010).

Play Video

Citer Cet Article
Le Nagard, L., Morillo-López, V., Fradin, C., Bazylinski, D. A. Growing Magnetotactic Bacteria of the Genus Magnetospirillum: Strains MSR-1, AMB-1 and MS-1. J. Vis. Exp. (140), e58536, doi:10.3791/58536 (2018).

View Video