This protocol provides step-by-step instruction on how to generate parabiotic zebrafish embryos of different genetic backgrounds. When combined with the unparalleled imaging capabilities of the zebrafish embryo, this method provides a uniquely powerful means to investigate cell-autonomous versus non-cell-autonomous functions for candidate genes of interest.
Хирургическая парабиозом двух животных разных генетических фонов создает уникальный сценарий для изучения клеток по сравнению с внутренней клеточной внешняя роли для генов-кандидатов, представляющих интерес, миграционным поведением клеток и спрятали сигналов в различных генетических условиях. Поскольку парабиотического животные имеют общую циркуляцию, любая кровь или фактор через кровь от одного животного будет обмениваться со своим партнером, и наоборот. Таким образом, клетки и молекулярные факторы, полученные из одного генетического фона могут быть изучены в контексте второго генетического фона. Парабиозе взрослых мышей широко используется для исследований старения, рака, диабета, ожирения и развития мозга. Совсем недавно, парабиозом из эмбрионов данио были использованы для изучения биологии развития кроветворения. В отличие от мышей, прозрачный характер эмбрионов данио позволяет прямой визуализации клеток в парабиотического контексте, что делает его уникальным мощным методом исследования пundamental клеточные и молекулярные механизмы. Полезность этого метода, однако, ограничена крутой кривой обучения для генерации парабиотического эмбрионов данио рерио. Этот протокол обеспечивает метод шаг за шагом о том, как хирургическим путем сплавления blastulae двух эмбрионов данио различных генетических фонов для изучения роли генов-кандидатов, представляющих интерес. Кроме того, парабиотического данио эмбрионы толерантны к тепловому удару, что делает временной контроль экспрессии гена возможно. Этот метод не требует сложного настройки и имеет широкое применение для изучения миграции клеток, спецификации судьбы и дифференциации в естественных условиях во время эмбрионального развития.
Создание генетических мозаик (химер) между дикого типа и генетически модифицированных животных является устоявшейся и классическая стратегия для исследования клеток внутренней клеточной сравнению внешняя функций генов – кандидатов 1-6. Бластулы трансплантации в данио широко используется для получения химерных эмбрионов для исследований клеточной автономии 7-9. В зависимости от интересующей ткани, тем не менее, она может быть сложной задачей , чтобы предсказуемо целевых донорских клеток в требуемую ткань (например, крови) 1-3, 7-9. Генетики мыши уже давно используются парабиотического хирургические методы для создания сиамских организмов с общим тиражом 10-14. Поскольку парабиотического животные имеют общую кровеносную систему , взаимодействие между клетками , которые произошли от одного животного с клетками другого животного другого генетического фона могут быть изучены 10-16. В последнее время группа Карима Kissa в элегантно продемонстрировал способность CREели сиамских эмбрионов данио рерио , а затем использовать эту систему для изучения гемопоэтических стволовых и клеток – предшественников (HSPC) миграции 15. Кроме того, данио парабиозом недавно был использован для изучения роли эндотелиальной кадгерину 5 в гемопоэтических стволовых клеток (ГСК) возникновения и миграции, 16 и изучить роль стромальных клеток в нише HSPC во время данио развития 17.
В отличие от мышей, данио эмбрионы являются прозрачными и позволяют для прямой визуализации клеток в процессе развития парабиотического, что делает систему однозначно мощным. Полезность парабиозе в данио, однако, ограничена крутой кривой обучения, и парабиотического операции на тонких эмбрионов может быть технически сложным без подробной инструкции и визуальной демонстрации. Целью данного протокола является предоставление набора четких, шаг за шагом инструкции для сопровождения видео на основе руководства о том, как генерировать парабиотического данио эмбрионов для изучениявременная, клетка-внутренняя, или клеточные функции внешняя гена кандидата (ов) хирургическим путем слияния разработки blastulae. Основные модификации и дополнительные рекомендации по увеличению выживаемости parabiont и новых экспериментальных приложений включены.
Парабиотического слияние было мощным инструментом для исследования клеточных функций генов – кандидатов у взрослых мышиных моделях и куриных эмбрионов 10-14. Совсем недавно, метод бластула фьюжн был описан для генерации сиамских эмбрионов данио 15. В настоящем протоколе, вид?…
The authors have nothing to disclose.
We thank Julie R. Perlin for helpful comments on the manuscript. D.I.S. is supported by grants from the American Society of Hematology, the Cooley’s Anemia Foundation, and the NIH (K01DK085217 and R03DK100672). E.J.H. is a Howard Hughes Medical Institute Fellow of the Helen Hay Whitney Foundation. B.L. is a Howard Hughes Medical Institute Medical Research Fellow. B.W.B. is supported by an Irvington Fellowship from the Cancer Research Institute and a Young Investigator Award from the Conquer Cancer Foundation of ASCO. L.I.Z. is supported by grants from the NIH (R01CA103846, P01HL032262, and R01HL04880), Taub Foundation for MDS Research, Harvard Stem Cell Institute, and is an investigator of the Howard Hughes Medical Institute.
Methyl cellulose | Sigma | M0387 |
Individual components for E3/HCR: | For 1L: 14,61g NaCl, 0,63g KCl, 2,43g CaCl2-2H2O, 1,99g MgSO4 | |
NaCl (Sodium chloride) | Sigma-Aldrich | S9888 |
KCl (Potassium chloride) | Sigma-Aldrich | P9541 |
CaCl2 (Calcium chloride dihydrate) | Sigma-Aldrich | 223506 |
MgSO4 (Magnessium sulfate heptahydrate) | Sigma-Aldrich | 230391 |
Hepes (1M ) buffer solution | ThermoFisher | 15630-080 |
Name | Company | Catalog Number |
Antibiotics: | ||
Pen/Strep | gibco by Life technologies | 15140-120 |
Ampicilin sodium salt | Sigma Life Science | A0166 |
Kanamycin sulfate from Streptomyces kanamyceticus | Sigma Life Science | K1377 |
Name of Reagent/ Equipment | Company | Catalog Number |
50 mg/ml Pronase from Streptomyces griseus | Roche | 11459643001 |
capillary glass used for needles (Capillary Glass & Filaments) | Sutter Instrument | ITEM#: BF 100-50-10 |
Teasing needles with wooden handles | Fisher Scientific | S07894 |
Glass Pasteur pipettes | Fisherbrand | 13-678-20A |
10 mL pipette pump (green) (Pipette Pump Pipettor) | Novatech International | F37898-0000 |
100 mm diameter/ 20 mm deep plastic petri dishes (PETRI DISH, 100/20 MM, PS, CLEAR, WITH VENTS, HEAVY DESIGN, 15 PCS./BAG ) |
Greiner Bio-one | 664102 |
Dextran, Cascade Blue, 10,000 MW, Anionic, Lysine Fixable | ThermoFisher | D-1976 |
PTU. working stock is 0.003% (50X is 0.15%). for 500ml, 0.75 g N-Phenylthiourea | Sigma-Aldrich | P7629 |
Tricaine (powder) (Tricaine Methanesulfonato, Tricaine-S) | Western Chemical Inc | MS 222 |
LMP agarose (Ultrapure LMP agarose) | Invitrogen | 16520100 |
plastic transfer pipette (just the wide ended one I think) | Fisherbrand | 137115AM |
Glass-bottom 6-well plates used for imaging | MatTek | P06G1.5-20-F |
plastic western gel loading tip fixed on the end of a wood-handled dissecting needle (GELoader tips) | Eppendorf | 22351656 |
glass cover slips, slides and vacuum grease if mounting for an upright microscope: | ||
Vaccum grease ( Dow Corning® high-vacuum silicone grease colorless, weight 5.3 oz (tube) ) |
Dow Corning | Z273554 |
Glass cover slips | Corning Life Sciences | 2960-244 |