Invecchiamento cronologico di lievito si riferisce alla perdita di vitalità cellulare associato con il tempo in fase stazionaria. Qui si descrivono un elevato throughput metodo per determinare quantitativamente la durata della vita cronologico lievito.
Abstract
Il lievito in erba<em> Saccharomyces cerevisiae</em> Ha dimostrato di essere un organismo modello importante nel campo della ricerca sull'invecchiamento<sup> 1</sup>. La replicazione e la durata della vita cronologico sono due paradigmi stabiliti utilizzato per studiare l'invecchiamento nel lievito. Invecchiamento replicativo è definito come il numero di cellule figlie una sola cellula madre lievito produce prima di senescenza, invecchiamento cronologico è definito dalla lunghezza delle cellule tempo può sopravvivere in un non-divisione, quiescenza stato simile<sup> 2</sup>. Abbiamo sviluppato un elevato throughput metodo per la misurazione quantitativa della durata cronologica. Questo metodo comporta l'invecchiamento delle cellule in un mezzo definito sotto agitazione ea temperatura costante. Ad ogni età-point, una sotto-popolazione di cellule viene rimosso dalla cultura invecchiamento e inoculati in terreno di coltura ricco. Ad alta risoluzione curva di crescita è quindi ottenuto per questa sotto-popolazione di cellule invecchiate con una macchina Bioscreen C MBR. Un algoritmo viene poi applicata per determinare la percentuale relativa di cellule vitali in ogni sub-popolazione basata sulla cinetica di crescita ad ogni età-point. Questo metodo richiede meno tempo e risorse rispetto ad altri saggi cronologico durata della vita, pur mantenendo la riproducibilità e precisione. L'high-throughput natura di questo test dovrebbe consentire schermi genetiche e chimiche su larga scala per identificare i modificatori longevità romanzo per ulteriori test in organismi più complessi.
Protocol
Parte 1: Preparazione delle colture invecchiamento Ceppi striscia di interesse da parte scorte congelate su piastre di agar YEPD (1 estratto di lievito%, 2% bacto-peptone, 2% agar, 2% di glucosio). Incubare le cellule a 30 ˚ C per 48 ore o fino a singole colonie appaiono. Scegli singole colonie e inoculare in 5 ml di liquido YEPD (1 estratto di lievito%, 2% bacto-peptone, 2% di glucosio) in provetta. Grow culture notte a 30 ˚ C, mantenendo costante agitazione utilizzando uno sh…
Discussion
L'high-throughput vita saggio arco cronologico qui descritto è un metodo efficace per quantificare il potenziale di invecchiamento di un gran numero di ceppi con elevata accuratezza e precisione. L'anticipo principale di questo metodo rispetto ai metodi classici per stabilire la sopravvivenza contando unità formanti colonie (ad esempio vedi 3) è l'uso di un dispositivo di lettura shaker / incubatore / piastra, come la macchina Bioscreen C MBR di ottenere alta risoluzione curve di crescita a ogn…
Acknowledgements
Questo lavoro è stato sostenuto da NIH di Grant 1R21AG031965-01A1. MK è una Ellison Medical Foundation Scholar Nuove invecchiamento.