자기 활성 셀 정렬 (LIMACS)를 사용하여 지질 소포 - 중재 동질 크로마 토그래피 : 단백질 지질 상호 작용을 분석하는 소설 방법
Summary
우리가 맥스와 Annexin V – 복합 자석 구슬과 대상 지질 및 Annexin V – 구속력 phosphatidylserine의 합성 지질 vesicles를 사용하여 자사의 목표 지질과 단백질의 상호 작용을 테스트하려면. 대상 지질에 바인딩 단백질은 공동 정화 및 비즈에서 용출 후 분석하고 있습니다.
Abstract
lipids 대부분의 정화 절차에 접근할 그러므로 세포 점막에 포함된하고 있기 때문에 지질 단백질 상호 작용의 분석 어렵습니다. 대안으로, lipids은 지질 엘리사와 Plasmon 공명 분광법을 위해 사용되는 평면 표면에 코팅하실 수 있습니다. 그러나, 표면 코팅 lipids은 지질 바인딩 속성에 대해 중요한 수있는, microdomain 구조를 형성하지 않습니다. 또한, 이러한 방법들은 목표 lipids에 바인딩 단백질의 대용량의 정화를 위해 허용하지 않습니다.
지질 단백질 상호 작용을 테스트 이러한 한계를 극복하고 지질 바인딩 단백질을 정화하기 위해 우리는 자기가 활성화된 셀 정렬 (LIMACS)를 사용하여 지질 소포 – 중재 친화 크로마 토그래피를 칭했다 소설 방법을 개발했습니다. 이 방법에서는 지질 vesicles는 Annexin V Mac 용 앵커 지질로 대상 지질 및 phosphatidylserine와 준비가되어 있습니다. Phosphatidylserine는 단백질 Annexin V. phosphatidylserine 함유 지질 vesicles는 자성 비즈에 바인딩됩니다 Annexin V에 복합 자기 구슬을 사용하여 높은 친화력을 보여주는 유비 쿼터스 세포막의 인지질이다. 지질 vesicles이 lysate 세포와 incubated 경우 대상 지질에 바인딩 단백질도 비즈에 바인딩되며, 맥을 사용하는 공동 정화 수 있습니다. 이 방법은 테스트하는 데 사용할 수있는 재조합 단백질은 reconstitute 대상 지질에 바인딩 단백질 컴플렉스를하는 경우.
우리는 sphingolipid ceramide와 공동 정화 전립선 apoptosis 반응 4 (파 4), ceramide – 관련 aPKC에 바인딩 단백질 비정형 PKC (aPKC)의 상호 작용을 표시하기 위해이 방법을 사용했습니다. 우리는 또한 세포 극성과 관련된 단백질 Par6 및 Cdc42와 재조합 aPKC의 ceramide – 연결된 복합 reconstitution이 방법을 사용했습니다. 지질 vesicles가 sphingo 또는 phospholipids의 다양한 준비할 수 있기 때문에 LIMACS은 세포막의 밀접하게 유사한 지질 환경에서 지질 – 단백질 상호 작용에 대한 다양한 테스트를 제공합니다. 추가 지질 단백질 단지는 지질 바인딩 단백질 지질 vesicles 공동 정화의 proteomics 분석을 사용하여 확인할 수 있습니다.
Protocol
Discussion
지질과 결합 단백질 간의 특정 상호 작용을 테스트하려면 것은 세포막의 lipids의 포함에 의해 방해합니다. 세포막은 여러 lipids과 단백질의 혼합물로 구성되어 있으며, 그것은 지질 microdomains이나 보트로 구성됩니다. 단백질 직접 지질에 바인딩 또는 유일한 microdomain 구조에 풍부한 경우 따라서 microdomains 및 단백질의 공동 정화 명확하게 구별 수 없습니다. 이러한 지질 ELISAs 또는 Plasmon 공명 분광법?…
Disclosures
The authors have nothing to disclose.
Acknowledgements
이 작품은 NIH 보조금 R01NS046835과 R01AG034389, 그리고 천 부여 6FY08 – 322 3 월 지원했다. 특별한 당신이 맥을 기술에 그녀의 통찰력과 함께 엄청난 도움을 부인 엘리 노어 브라운 (Miltenyi Biotec, 오번, CA)에 전념합니다 감사합니다. Miltenyi은 아낌없이 무료로 실험의 시연에 사용되는 자료를 제공하고 있습니다. 또 세포 라인을 표현 PKCζ을 생성 박사 Guanghu 왕 (조지아 / 조지아 보건 과학 대학, 오거 스타의 메디컬 칼리지, GA)에 감사드립니다. 조지아 / 조지아 보건 과학 대학 (박사 린 메이의 지도자의 임기 미만)의 의료 대학에서 분자 의학 연구소에 의해 지원도 인정받고 있습니다.
Materials
Annexin V-conjugated magnetic beads and MACS micro and minicolumns were provided by Miltenyi Biotec, Inc. (Auburn, CA). All lipids were of highest purity and obtained from Avanti Polar Lipids (Alabaster, AL).
References
- Wang, G. Direct binding to ceramide activates protein kinase Czeta before the formation of a pro-apoptotic complex with PAR-4 in differentiating stem cells. J Biol Chem. 280, 26415-26424 (2005).
- Wang, G., Krishnamurthy, K., Umapathy, N. S., Verin, A. D., Bieberich, E. The carboxyl-terminal domain of atypical protein kinase Czeta binds to ceramide and regulates junction formation in epithelial cells. J Biol Chem. 284, 14469-14475 (2008).
- Chalfant, C. E. De novo ceramide regulates the alternative splicing of caspase 9 and Bcl-x in A549 lung adenocarcinoma cells. Dependence on protein phosphatase-1. J Biol Chem. 277, 12587-12595 (2002).
- Simon, C. G., Holloway, P. W., Gear, A. R. Exchange of C(16)-ceramide between phospholipid vesicles. Biochemistry. 38, 14676-14682 (1999).
- Goni, F. M., Contreras, F. X., Montes, L. R., Sot, J., Alonso, A. Biophysics (and sociology) of ceramides. Biochem Soc Symp. , 177-188 (2005).
- Kumagai, K. CERT mediates intermembrane transfer of various molecular species of ceramides. J Biol Chem. 280, 6488-6495 (2005).
- Wessel, D., Flugge, U. I. A method for the quantitative recovery of protein in dilute solution in the presence of detergents and lipids. Anal Biochem. 138, 141-143 (1984).
