Summary

使用网关兼容双分子荧光互补(附设)系统在植物蛋白相互作用检测

Published: September 16, 2011
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Summary

我们已经开发出一种技术,以测试植物蛋白质相互作用。一个黄色荧光蛋白(YFP)被分成两个非重叠的片段。每个帧通过网关系统的兴趣基因片段克隆,使融合蛋白的表达。重组YFP的信号只发生在研讯的蛋白质相互作用。

Abstract

我们已经开发出一种附设的技术测试体内的蛋白质之间的相互作用。这是通过一个黄色荧光蛋白(YFP)分裂成两个非重叠的片段。每帧到一个感兴趣的基因片段克隆。然后,这些结构可以合作转化烟草通过农杆菌介导的转化,使过境融合蛋白表达。重组YFP的信号只发生时,研讯的蛋白质相互作用1-7。测试和验证的蛋白质 – 蛋白质相互作用,附设可以一起使用的酵母双杂交(Y2H)检测。这可能会侦测到间接的相互作用,可在Y2H忽视。 Gateway技术是一个通用平台,使研究人员感兴趣的基因(GOI)穿梭成尽可能多的表达和功能分析系统, 可能 8,9 。可维持的方向和阅读框,而无需使用限制性内切酶或结扎表达准备克隆。因此,可以消除所有的重测序步骤,以确保在整个实验一致的结果。我们已经建立了一系列网关兼容附设和Y2H载体,提供易于使用的工具执行附设的Y2H检测的研究人员10。在这里,我们展示了易于使用我们的附设系统测试N中的蛋白质-蛋白质相互作用benthamiana植物。

Protocol

1。 农杆菌文化的制备 农杆菌菌株GV3101中转换网关兼容附设载体pEarleyGate201 YC和pEarleyGate202 – YN,每个包含一个融合构建印尼政府。 接种5毫升YEB(5G L – 1牛肉膏,1G L – 1酵母提取物,5G L – 1的蛋白胨,5G L – 1蔗糖,硫酸镁2MM 4,pH值7.2)附设的融合蛋白文化建设与农杆菌转化选择适当的抗生素。成长培养过夜,在28 ° C晃动在2…

Discussion

附设实验是研究蛋白质相互作用的有力工具。附设不同于传统的Y2H检测,不仅可以使蛋白质 – 蛋白质相互作用的可视化,而且还提供了更多的蛋白质复合体的亚细胞定位等信息。此外,它是可能的,只要检测到间接的相互作用的两个候选蛋白可以由第三方的合作伙伴带来足够接近。任何技术一样,附设有其局限性。由于附设的荧光基团形成的氧分子的要求,不能用于专性厌氧菌,在氧气存在的无?…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

我们感谢阮阅读的手稿和一般实验室援助第六。

Materials

Name of the reagent Company Catalogue number
Acetosyringone Sigma D134406
MES hydrate Sigma M2933
1 mL slip-tip tuberculin syringe BD 309602

References

  1. Ohad, N., Yalovsky, S. Utilizing bimolecular fluorescence complementation (BiFC) to assay protein-protein interaction in plants. Methods in molecular biology. 655, 347-358 (2010).
  2. Fang, Y., Spector, D. L. BiFC imaging assay for plant protein-protein interactions. Cold Spring Harbor protocols. 2, (2010).
  3. Schutze, K., Harter, K., Chaban, C. Bimolecular fluorescence complementation (BiFC) to study protein-protein interactions in living plant cells. Methods in molecular biology. 479, 189-202 (2009).
  4. Hiatt, S. M. Bimolecular fluorescence complementation (BiFC) analysis of protein interactions in Caenorhabditis elegans. Methods. 45, 185-191 (2008).
  5. Barnard, E. Development and implementation of split-GFP-based bimolecular fluorescence complementation (BiFC) assays in yeast. Biochemical Society Transactions. 36, 479-482 (2008).
  6. Kerppola, T. K. Design and implementation of bimolecular fluorescence complementation (BiFC) assays for the visualization of protein interactions in living cells. Nature. 1, 1278-1286 (2006).
  7. Hu, C. D., Grinberg, A. V., Kerppola, T. K. Visualization of protein interactions in living cells using bimolecular fluorescence complementation (BiFC) analysis. Current protocols in cell biology. 21, 3-3 (2006).
  8. Earley, K. W. Gateway-compatible vectors for plant functional genomics and proteomics. The Plant journal : for cell and molecular biology. 45, 616-629 (2006).
  9. Karimi, M., Inze, D., Depicker, A. GATEWAY vectors for Agrobacterium-mediated plant transformation. Trends in Plant Science. 7, 193-195 (2002).
  10. Lu, Q. Arabidopsis homolog of the yeast TREX-2 mRNA export complex: components and anchoring nucleoporin. The Plant journal : for cell and molecular biology. 61, 259-270 (2010).
  11. Sparkes, I. A. transient expression of fluorescent fusion proteins in tobacco plants and generation of stably transformed plants. Nature protocols. 1, 2019-2025 (2006).
  12. Rackham, O., Brown, C. M. Visualization of RNA-protein interactions in living cells: FMRP and IMP1 interact on mRNAs. The EMBO journal. 23, 3346-3355 (2004).
  13. Demidov, V. V. Fast complementation of split fluorescent protein triggered by DNA hybridization. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 103, 2052-2056 (2006).
  14. Shyu, Y. J., Suarez, C. D., Hu, C. D. Visualization of ternary complexes in living cells by using a BiFC-based FRET assay. Nature. 3, 1693-1702 (2008).
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Cite This Article
Tian, G., Lu, Q., Zhang, L., Kohalmi, S. E., Cui, Y. Detection of Protein Interactions in Plant using a Gateway Compatible Bimolecular Fluorescence Complementation (BiFC) System. J. Vis. Exp. (55), e3473, doi:10.3791/3473 (2011).

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