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Capture d'sélectif de 5-hydroxyméthylcytosine partir de l'ADN génomique
JoVE Journal
Biology
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JoVE Journal Biology
Selective Capture of 5-hydroxymethylcytosine from Genomic DNA
DOI:

06:26 min

October 05, 2012

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Chapters

  • 00:05Title
  • 01:20Genomic DNA Fragmentation
  • 02:02Glucosyl Transfer: B-GT Reaction
  • 02:49Biotinylation Reaction: Click Chemistry
  • 03:30Capture of 5-hmC-containing DNA
  • 04:51Results: Selective Capture of 5-hmC from Genomic DNA
  • 06:01Conclusion

Summary

Automatic Translation

Décrit un procédé de marquage en deux étapes à l'aide β-glucosyltransférase (β-GT) pour transférer un azide-glucose à 5-HMC, suivie par click chemistry pour transférer un segment de liaison de biotine pour l'enrichissement facile et indépendante de la densité. Cette méthode d'étiquetage efficace et spécifique permet l'enrichissement de la 5-HMC avec un fond extrêmement faible et la cartographie épigénomique à haut débit via séquençage de prochaine génération.

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