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Cattura selettiva di 5 hydroxymethylcytosine dal DNA genomico
JoVE Journal
Biology
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JoVE Journal Biology
Selective Capture of 5-hydroxymethylcytosine from Genomic DNA
DOI:

06:26 min

October 05, 2012

, , ,

Chapters

  • 00:05Title
  • 01:20Genomic DNA Fragmentation
  • 02:02Glucosyl Transfer: B-GT Reaction
  • 02:49Biotinylation Reaction: Click Chemistry
  • 03:30Capture of 5-hmC-containing DNA
  • 04:51Results: Selective Capture of 5-hmC from Genomic DNA
  • 06:01Conclusion

Summary

Automatic Translation

Descritto è un processo a due fasi usando etichettatura β-glucosil (β-GT) per trasferire una azide-glucosio al 5-HMC, seguita dalla chimica click per trasferire un linker biotina per l'arricchimento facile e densità-indipendenti. Questo metodo efficace di etichettatura e specifica consente l'arricchimento di 5-HMC con fondo estremamente basso e high-throughput mappatura epigenomic tramite sequenziamento di prossima generazione.

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