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Chapters
- 00:05Title
- 01:20Genomic DNA Fragmentation
- 02:02Glucosyl Transfer: B-GT Reaction
- 02:49Biotinylation Reaction: Click Chemistry
- 03:30Capture of 5-hmC-containing DNA
- 04:51Results: Selective Capture of 5-hmC from Genomic DNA
- 06:01Conclusion
Beschrieben wird ein zweistufiges Verfahren unter Verwendung Kennzeichnung β-Glucosyltransferase (β-GT), um ein Azid-Glukose zu 5-HMC übertragen, gefolgt von Klickchemie einen Linker Biotin für die einfache und dichteunabhängigen Anreicherung zu übertragen. Dieses effiziente und spezifische Kennzeichnung Methode ermöglicht die Anreicherung von 5-HMC mit extrem niedrigen Hintergrund und hohem Durchsatz epigenomischen Mapping über Next-Generation-Sequenzierung.
Tags
Selective Capture5-hydroxymethylcytosineGenomic DNA5-methylcytosineBiological FunctionsGene ExpressionGenome IntegrityParental ImprintingX-chromosome InactivationDevelopmentAgingCancerMammalian CellsEmbryonic Stem CellsNeuronal CellsTET Family Iron (II)/α-ketoglutarate-dependent DioxygenasesMES CellsNormal HematopoiesisMalignanciesZygote DevelopmentBisulfite SequencingLabeling And CaptureBacteriophage EnzymeGlucose MoietyGlucosyltransferase
