A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Chapters
- 00:05Title
- 01:20Genomic DNA Fragmentation
- 02:02Glucosyl Transfer: B-GT Reaction
- 02:49Biotinylation Reaction: Click Chemistry
- 03:30Capture of 5-hmC-containing DNA
- 04:51Results: Selective Capture of 5-hmC from Genomic DNA
- 06:01Conclusion
Описывается два шага маркировки процесса с использованием β-glucosyltransferase (β-GT), чтобы передать азид-глюкозы до 5-HMC, а затем нажмите химия для передачи биотин компоновщика для легкой и плотности независимых обогащения. Это эффективный и конкретный маркировки метод позволяет обогащению 5-HMC с крайне низким фоном и высокой пропускной эпигеномном отображения с помощью следующего поколения секвенирования.
Tags
Selective Capture5-hydroxymethylcytosineGenomic DNA5-methylcytosineBiological FunctionsGene ExpressionGenome IntegrityParental ImprintingX-chromosome InactivationDevelopmentAgingCancerMammalian CellsEmbryonic Stem CellsNeuronal CellsTET Family Iron (II)/α-ketoglutarate-dependent DioxygenasesMES CellsNormal HematopoiesisMalignanciesZygote DevelopmentBisulfite SequencingLabeling And CaptureBacteriophage EnzymeGlucose MoietyGlucosyltransferase
