A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Chapters
- 00:05Title
- 01:20Genomic DNA Fragmentation
- 02:02Glucosyl Transfer: B-GT Reaction
- 02:49Biotinylation Reaction: Click Chemistry
- 03:30Capture of 5-hmC-containing DNA
- 04:51Results: Selective Capture of 5-hmC from Genomic DNA
- 06:01Conclusion
Beskrivs är en tvåstegsprocess märkning med användning β-glukosyltransferas (β-GT) för att överföra en azid-glukos till 5-HMC, följt genom att klicka kemi för att överföra en biotin linker för enkel och densitet oberoende anrikning. Denna effektiva och särskild märkning metod möjliggör anrikning av 5-HMC med extremt låg bakgrund och hög genomströmning epigenomic kartläggning via nästa generations sekvensering.
Tags
Selective Capture5-hydroxymethylcytosineGenomic DNA5-methylcytosineBiological FunctionsGene ExpressionGenome IntegrityParental ImprintingX-chromosome InactivationDevelopmentAgingCancerMammalian CellsEmbryonic Stem CellsNeuronal CellsTET Family Iron (II)/α-ketoglutarate-dependent DioxygenasesMES CellsNormal HematopoiesisMalignanciesZygote DevelopmentBisulfite SequencingLabeling And CaptureBacteriophage EnzymeGlucose MoietyGlucosyltransferase
