Journal

Biology

IR-TEx: een open source data-integratie tool voor Big Data transcriptomics ontworpen voor de malaria vector Anopheles gambiae

JoVE Journal
Biology

This content is Free Access.

JoVE Journal Biology

IR-TEx: An Open Source Data Integration Tool for Big Data Transcriptomics Designed for the Malaria Vector Anopheles gambiae

Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

IR-TEx: een open source data-integratie tool voor Big Data transcriptomics ontworpen voor de malaria vector Anopheles gambiae

DOI:

10.3791/60721-v

•

08:22 min

•

January 15, 2020

•

Victoria A. Ingham, Andrew Bennett, Duo Peng, Simon C. Wagstaff, Hilary Ranson

¹Vector Biology,Liverpool School of Tropical Medicine, ²Research Computing Unit,Liverpool School of Tropical Medicine, ³Department of Immunology and Infectious Diseases,Harvard T.H. Chan School of Public Health

Chapters

00:04Title
00:30Using the IR-TEx Web Application
03:57Downloading and Implementing IR-TEx Locally
04:52Modifying IR-TEx for use with Different Datasets
06:05Results: Microsomal GST Contributes to Insecticide Resistance in Anopheles gambiae and Anopheles coluzzii Mosquitoes from Cte D Ivoire and Burkina Faso
07:31Conclusion

Summary

Automatic Translation

IR-TEx verkent transcriptionele profielen van insecticide-resistentie in de soort Anopheles gambiae. Hier vindt u volledige instructies voor het gebruik van de toepassing, wijzigingen voor het verkennen van meerdere Transcriptomic-gegevenssets en het gebruik van het framework om een interactieve database te bouwen voor verzamelingen transcriptomische gegevens van elk organisme, gegenereerd in elk platform.

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Protocol voor Mosquito Opfok (A. gambiae)

Populatie Vervanging Strategieën voor Controlling Vector populaties en het gebruik van Wolbachia pipientis voor Genetische Drive

Protocol voor RNAi Testen in volwassen muggen (A. gambiae)

Bouwen aan een betere Mosquito: Het identificeren van de genen Enabling malaria en knokkelkoorts verzet in A. gambiae en A. aegypti muggen

Workflow voor High-inhoud, individuele cel Kwantificering van fluorescente merkers van Universal Microscoop gegevens, Ondersteund door Open Source Software

Open-source Single-deeltje Analyse voor Super-resolutie microscopie met VirusMapper

Een efficiënte In Vitro omzetting methode door een Transcriptionally gereglementeerde Sleeping Beauty systeem verpakt in een defecte lentivirale Vector integratie

Worm-align en Worm_CP, Twee Open-Source Pipelines voor straightening en kwantificering van fluorescentie beeldgegevens verkregen van Caenorhabditis elegans