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IR-TEx: Uma ferramenta de integração de dados de código aberto para transcrição de big data projetada para o Vector Anopheles gambiae da malária

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IR-TEx: An Open Source Data Integration Tool for Big Data Transcriptomics Designed for the Malaria Vector Anopheles gambiae

IR-TEx: Uma ferramenta de integração de dados de código aberto para transcrição de big data projetada para o Vector Anopheles gambiae da malária

DOI:

10.3791/60721-v

•

08:22 min

•

January 15, 2020

•

Victoria A. Ingham, Andrew Bennett, Duo Peng, Simon C. Wagstaff, Hilary Ranson

¹Vector Biology,Liverpool School of Tropical Medicine, ²Research Computing Unit,Liverpool School of Tropical Medicine, ³Department of Immunology and Infectious Diseases,Harvard T.H. Chan School of Public Health

Chapters

00:04Title
00:30Using the IR-TEx Web Application
03:57Downloading and Implementing IR-TEx Locally
04:52Modifying IR-TEx for use with Different Datasets
06:05Results: Microsomal GST Contributes to Insecticide Resistance in Anopheles gambiae and Anopheles coluzzii Mosquitoes from Cte D Ivoire and Burkina Faso
07:31Conclusion

Summary

Automatic Translation

Ir-TEx explora perfis transcricionais relacionados à resistência inseticida na espécie Anopheles gambiae. Estão aqui instruções completas para o uso do aplicativo, modificações para explorar vários conjuntos de dados transcriptômicos e usar a estrutura para criar um banco de dados interativo para coletas de dados transcritas de qualquer organismo, gerados em qualquer plataforma.

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