Journal
/
Biology
/
IR-TEx: 말라리아 벡터 아노펠레스 감비아를 위해 설계된 빅 데이터 전사학을 위한 오픈 소스 데이터 통합 도구
JoVE Journal
Biology
This content is Free Access.
JoVE Journal Biology
IR-TEx: An Open Source Data Integration Tool for Big Data Transcriptomics Designed for the Malaria Vector Anopheles gambiae
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

IR-TEx: 말라리아 벡터 아노펠레스 감비아를 위해 설계된 빅 데이터 전사학을 위한 오픈 소스 데이터 통합 도구

DOI:
10.3791/60721-v

•

08:22 min

•

January 15, 2020

•

, , , ,
1Vector Biology,Liverpool School of Tropical Medicine, 2Research Computing Unit,Liverpool School of Tropical Medicine, 3Department of Immunology and Infectious Diseases,Harvard T.H. Chan School of Public Health

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:30Using the IR-TEx Web Application
  • 03:57Downloading and Implementing IR-TEx Locally
  • 04:52Modifying IR-TEx for use with Different Datasets
  • 06:05Results: Microsomal GST Contributes to Insecticide Resistance in Anopheles gambiae and Anopheles coluzzii Mosquitoes from Cte D Ivoire and Burkina Faso
  • 07:31Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

IR-TEx는 아노펠레스 감비아종에서 살충제 저항 성 전사 프로파일을 탐구한다. 여기에 는 응용 프로그램 사용, 여러 전사 데이터 집합을 탐색하기 위한 수정 및 프레임워크를 사용하여 모든 플랫폼에서 생성된 모든 유기체의 전사 데이터 수집을 위한 대화형 데이터베이스를 빌드하기 위한 전체 지침이 제공됩니다.

Tags

Keywords: Data IntegrationTranscriptomicsAnopheles GambiaeIR-TExWeb ApplicationGene ExpressionInsecticide ResistancePyrethroidAnopheles ColuzziiFold ChangeAdjusted P-valueData Download

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/60721?article_type=v

모스키토 리어링 (A. gambiae)에 대한 프로토콜
check_url/60721?article_type=v

유전 드라이브에 대한 제어 벡터 인구와 Wolbachia pipientis의 사용에 대한 인구 교체 전략
check_url/60721?article_type=v

성인 모기 (A. gambiae)에서 RNAi의 Assays을위한 프로토콜
check_url/60721?article_type=v

더 나은 모스키토 구축 : A. gambiae 및 A. aegypti 모기에 말라리아와 뎅그열 발열 저항을 사용 유전자를 확인
check_url/60721?article_type=v

높은 콘텐츠, 오픈 소스 소프트웨어에 의해 지원되는 범용 현미경 데이터에서 형광 마커, 개별 셀 정량화를위한​​ 워크 플로우
check_url/60721?article_type=v

VirusMapper 슈퍼 해상도 현미경을위한 오픈 소스 단일 입자 분석
check_url/60721?article_type=v

효율적인 체 외에서 이항 메서드인 Transcriptionally 규제 자 아름다움 시스템 통합 결함이 Lentiviral 벡터에 포장 하 여
check_url/60721?article_type=v

벌레 정렬 및 Worm_CP, Caenorhabditis elegans에서 얻은 형광 이미지 데이터의 스트레이트 및 정량화를 위한 두 개의 오픈 소스 파이프라인
check_url/60721?article_type=v

성인 Anopheles 감비아 모기에 효과적인 경구 RNA 간섭 (RNAi) 투여
check_url/60721?article_type=v

데 노보 리보솜 프로파일링 데이터를 사용하여 능동적으로 번역된 오픈 리딩 프레임 식별

Read Article