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IR-TEx: Un outil d'intégration de données Open Source pour la transcriptionomique Big Data conçu pour le vecteur antipaludique Anopheles gambiae

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IR-TEx: An Open Source Data Integration Tool for Big Data Transcriptomics Designed for the Malaria Vector Anopheles gambiae

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IR-TEx: Un outil d'intégration de données Open Source pour la transcriptionomique Big Data conçu pour le vecteur antipaludique Anopheles gambiae

DOI:

10.3791/60721-v

•

08:22 min

•

January 15, 2020

•

Victoria A. Ingham, Andrew Bennett, Duo Peng, Simon C. Wagstaff, Hilary Ranson

¹Vector Biology,Liverpool School of Tropical Medicine, ²Research Computing Unit,Liverpool School of Tropical Medicine, ³Department of Immunology and Infectious Diseases,Harvard T.H. Chan School of Public Health

Chapters

00:04Title
00:30Using the IR-TEx Web Application
03:57Downloading and Implementing IR-TEx Locally
04:52Modifying IR-TEx for use with Different Datasets
06:05Results: Microsomal GST Contributes to Insecticide Resistance in Anopheles gambiae and Anopheles coluzzii Mosquitoes from Cte D Ivoire and Burkina Faso
07:31Conclusion

Summary

Automatic Translation

IR-TEx explore les profils transcriptionnels liés à la résistance aux insecticides chez l'espèce Anopheles gambiae. Fourni ici sont des instructions complètes pour l'utilisation de l'application, des modifications pour explorer plusieurs ensembles de données transcriptomiques, et en utilisant le cadre pour construire une base de données interactive pour les collections de données transcriptomiques de n'importe quel organisme, généré dans n'importe quelle plate-forme.

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