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IR-TEx: Ein Open Source Data Integration Tool für Big Data Transcriptomics entwickelt für den Malaria Vector Anopheles gambiae

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IR-TEx: An Open Source Data Integration Tool for Big Data Transcriptomics Designed for the Malaria Vector Anopheles gambiae

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IR-TEx: Ein Open Source Data Integration Tool für Big Data Transcriptomics entwickelt für den Malaria Vector Anopheles gambiae

DOI:

10.3791/60721-v

•

08:22 min

•

January 15, 2020

•

Victoria A. Ingham, Andrew Bennett, Duo Peng, Simon C. Wagstaff, Hilary Ranson

¹Vector Biology,Liverpool School of Tropical Medicine, ²Research Computing Unit,Liverpool School of Tropical Medicine, ³Department of Immunology and Infectious Diseases,Harvard T.H. Chan School of Public Health

Chapters

00:04Title
00:30Using the IR-TEx Web Application
03:57Downloading and Implementing IR-TEx Locally
04:52Modifying IR-TEx for use with Different Datasets
06:05Results: Microsomal GST Contributes to Insecticide Resistance in Anopheles gambiae and Anopheles coluzzii Mosquitoes from Cte D Ivoire and Burkina Faso
07:31Conclusion

Summary

Automatic Translation

IR-TEx erforscht insektizidresistenzbedingte Transkriptionsprofile in der Art Anopheles gambiae. Hier finden Sie vollständige Anweisungen für die Verwendung der Anwendung, Änderungen zum Untersuchen mehrerer transkriptomischer Datensätze und die Verwendung des Frameworks zum Erstellen einer interaktiven Datenbank für Sammlungen von transkriptomischen Daten aus jedem Organismus, die in jeder Plattform generiert werden.

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