Journal
/
Biology
/
IR-TEx: ett open source data integreringsverktyg för stordata transcriptomics avsedda för malaria vektorn Anopheles gambiae
JoVE Journal
Biology
This content is Free Access.
JoVE Journal Biology
IR-TEx: An Open Source Data Integration Tool for Big Data Transcriptomics Designed for the Malaria Vector Anopheles gambiae
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

IR-TEx: ett open source data integreringsverktyg för stordata transcriptomics avsedda för malaria vektorn Anopheles gambiae

DOI:
10.3791/60721-v

•

08:22 min

•

January 15, 2020

•

, , , ,
1Vector Biology,Liverpool School of Tropical Medicine, 2Research Computing Unit,Liverpool School of Tropical Medicine, 3Department of Immunology and Infectious Diseases,Harvard T.H. Chan School of Public Health

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:30Using the IR-TEx Web Application
  • 03:57Downloading and Implementing IR-TEx Locally
  • 04:52Modifying IR-TEx for use with Different Datasets
  • 06:05Results: Microsomal GST Contributes to Insecticide Resistance in Anopheles gambiae and Anopheles coluzzii Mosquitoes from Cte D Ivoire and Burkina Faso
  • 07:31Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

IR-TEx utforskar insekticid resistensrelaterade transkriptionella profiler i arten Anopheles gambiae. Förutsatt här är fullständiga instruktioner för att använda programmet, ändringar för att utforska flera transcriptomic datauppsättningar, och med hjälp av ramverket för att bygga en interaktiv databas för samlingar av transkriptomic data från någon organism, som genereras i någon plattform.

Tags

Keywords: Data IntegrationTranscriptomicsAnopheles GambiaeIR-TExWeb ApplicationGene ExpressionInsecticide ResistancePyrethroidAnopheles ColuzziiFold ChangeAdjusted P-valueData Download

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/60721?article_type=v

Protokoll för Mosquito Uppfödning (A. gambiae)
check_url/60721?article_type=v

Reproduktionsnivån strategier för kontroll Vector Populationer och användning av Wolbachia pipientis för genetiska Drive
check_url/60721?article_type=v

Protokoll för RNAi-tester på vuxna myggor (A. gambiae)
check_url/60721?article_type=v

Bygga en bättre Mosquito: Identifiera gener Aktivera malaria och denguefeber Motståndet i A. gambiae och A. aegypti myggor
check_url/60721?article_type=v

Arbetsflöde för hög halt, Individuell Cell Kvantifiering av fluorescerande markörer från Universal Mikroskop Data, som stöds av Open Source Software
check_url/60721?article_type=v

Öppen källkod Single-partikelanalys för Super högupplösande mikroskopering med VirusMapper
check_url/60721?article_type=v

En effektiv In Vitro införlivande metod av en Transcriptionally reglerade Sleeping Beauty System paketeras i en Integration defekta Lentiviral Vector
check_url/60721?article_type=v

Worm-align och Worm_CP, två Open-Source Pipelines för Räta och kvantifiering av fluorescens bilddata erhålls från Caenorhabditis elegans
check_url/60721?article_type=v

Effektiv oral RNA-interferens (RNAi) administrering till vuxna anopheles gambiae myggor
check_url/60721?article_type=v

De novo Identifiering av aktivt översatta öppna läsramar med ribosomprofileringsdata

Read Article