Bu içeriği görüntülemek için JoVE aboneliğiniz gereklidir. Giriş yapın veya ücretsiz denemenizi bugün başlatın.

Yöntem makalesi

Prekambriyen Deniz upwelling Sistemi Fotosentetik Bakteri Büyüme Keşfet bakımından zengin bir Demir (II) Laboratuar Simülasyonu

11.7K görüntülenme

⸱

DOI:

10.3791/54251

⸱

24 Temmuz 2016

 ,  ,  , 

Bu makalede

Özet

Bir laboratuvar ölçekli dikey akış yoluyla sütununda bir Prekambriyen demirli deniz upwelling sistemini simüle. Amaç O 2 ve Fe (II) ve nasıl jeokimyasal profillerini anlamaya siyanobakteriler üretmek O 2 olarak gelişmeye oldu. Sonuçlar, fotosentetik üretilen O 2, Fe (II) oksitlenmeye karşı Kemoklin kurulmasını göstermektedir.

Özet

Bazı Prekambriyen Şeritli Demir Oluşum (BIF) birikimi için geleneksel bir konsept Prekambriyen okyanusta hidrotermal kaynaklardan demir demir [Fe (II)] upwelling moleküler oksijen ile okside olduğu varsayımına ilerler [O 2] siyanobakteriler tarafından üretilen. önce yaklaşık 2,4 milyar yıl (Gy) de önce Büyük oksidasyon Olay (GOE) yatırılan eski BIFS, anoksik koşullar altında anoxygenic photoferrotrophs tarafından Fe (II) direkt oksidasyonu ile oluşan olabilirdi. Farklı biyolojik senaryolar altında geliştirmek jeokimyasal ve mineralojik desenleri test etmek için bir yöntem olarak, biz bir laboratuar ölçeğinde bakımından zengin deniz upwelling sistemi eski bir okyanusun temsilcisi anoksik Fe (II) simüle etmek için bir 40 cm uzunluğunda dikey akış yoluyla sütun tasarlanmış . Silindir jeokimyasal geçişlerini stabilize etmek için bir gözenekli cam boncuk matris ile doluydu ve demir ölçümü için sıvı örnekleri su kolonu boyunca alınabilir. Çözünmüş oksijen olduğudışarıdan optodes yoluyla non-invaziv algıladı. su sütununda alt üst ayrı bir ışık degrade ve siyanobakteriler günümüze gelen Fe (II) ve upwelling akıları ilgili biyotik deneyler, Fe oluşumu için göstermek açık kanıtlar elde edilen sonuçlar (III) mineral çökeltiler ve Kemoklin gelişimi Fe arasında (II) ve O 2. Bu sütun bize simüle deniz Prekambriyen koşullar altında (ve gelecekteki photoferrotrophs olarak) siyanobacteria kültüre göre BIFS oluşması için hipotezler test etmenizi sağlar. sığ deniz veya göl çökelleri de dahil olmak üzere - Ayrıca bizim sütun kavramı çeşitli kimyasal ve fiziksel ortamların simülasyonu için izin verdiğini varsayımında.

Giriş

Prekambriyen (4.6 Gy 0.541 kadar önce) atmosfer fotosentetik üretilen oksijen kademeli birikmesi deneyimli (O 2), belki de yaklaşık 2.4 Gy sözde "Büyük oksidasyon Olay" (GOE) de adım değişiklikleri vurgulanmaya önce ve yine atmosferik O kadar Neoproterozoyik (1-,541 Gy önce) 2 Modern seviyeleri 1 yaklaştı. Siyanobakteri oksijenik fotosentez 2 yeteneğine sahip ilk organizmaların evrimsel kalıntıları bulunmaktadır. Jeokimyasal kanıt ve modelleme çalışmaları ağırlıklı olarak anoksik atmosfer 3-5 altındaki yüzey okyanusta yerel oksijen vahalar üreten siyanobakteri ya da oksijenli fotosentez veya oksijenik fototroflar....

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Protokol

Kültürleme Ortama hazırlanması 1.

Not: kültür ortamının hazırlanması için gerekli ekipman, kimyasallar ve sarf malzemeleri ile ilgili bilgiler Tablo listelenir 1 parantez içinde italik alfanümerik kodlar Tablo 2'de dökümü ve Şekil 1'de gösterildiği ekipman bakın..

  1. Deniz fototrofun (MP) ortamın 5 L Hazırlama Wu ve ark., 16 protokole ( "orta" olarak anılan). Oksijensiz ve steril 1 M HCI veya 0.5 M Naco 3 kullanılarak 6.8 pH ayarlayın. Fe için bir kaynak olarak (II), bir sonraki aşamada orta çözelti filtre edildikten sonra 50....

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Sonuçlar

Kontrol deneyi

Abiyotik kontrol deneyleri (10 gün) sürekli olarak düşük oksijen konsantrasyonlarını gösterdi (O 2

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Tartışma

Prekambrien okyanus mikrobiyal topluluklar tarafından düzenlenen veya bunların aktivite bir sonucu ve mevcut jeokimyasal koşulları değiştirilmiştir. BIF kaynağını yorumlama, araştırmacılar, genellikle Sedimentolojinin ya BIF jeokim- örneğin, Smith ve ark. 23 ve Johnson ve ark., 24 göre mikroorganizmaların varlığını veya aktivitesini çıkarılabilir. Antik ortamlara jeokimyasal analogları sahip, modern ortamlarda çağdaş organizmaların çalışma aynı zamanda değerli bi.......

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Açıklamalar

Yazarlar ifşa hiçbir şey yok.

Teşekkürler

Mark Nordhoff boru bağlantılarının tasarımı ve uygulanmasında yardımcı olmuştur. Ellen Struve seçmek ve kullanılan ekipman elde etmek için yardımcı oldu.

....

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Malzemeler

Bu makalede kullanılan malzemelerin listesi
AdŞirketKatalog numarasıYorumlar
Widdel şişesi (5 L)Ochs110015labor-ochs.de
Cam şişeler (5 L)RotilaboY682.1carlroth.com
Cam pipetler (5 ml)51714labor-ochs.de
0.22 &mikro; m Steritop filtre ünitesi (0.22  &mikro; m Polietersülfon membran)MilliporeX337.1carlroth.com
Alüminyum folyo
Steril Luer Lock cam şırınga, pamuklaC681.1carlroth.com
Luer Lock paslanmaz çelik iğneler (150 mm, 1.0  mm ID)201015labor-ochs.de
NaClSigma433209sigmaaldrich.com
MgSO4Sigma208094sigmaaldrich.com
CaCl2SigmaC4901sigmaaldrich.com
NH4ClSigmaA9434sigmaaldrich.com
KH< alt>2PO4SigmaP5655sigmaaldrich.com
KBrSigmaP3691sigmaaldrich.com
KClSigmaP9541sigmaaldrich.com
Cam silindirY310.1carlroth.com
Cam yünü7377.2carlroth.com
Cam boncuklar (ø 0.55 - 0.7& nbsp; mm)11079105biospec.com
Bütil kauçuk tıpa (ø 1.2 cm)271024
labor-ochs.de Petri Kabı, cam (ø 8.0  cm)T939.1carlroth.com
Polimerler tutkalOTTOSEAL S68adchem.de
Optik oksijen sensörü folyosu (oksijen analizi için aşağıya bakın)– istek üzerine –presens.de
Kauçuk boru (35 mm, 7  mm ID)770350labor-ochs.de
Luer Lock boru konektörü (3.0 mm, Luer kilit erkek = LLM)P343.1carlroth.com
Luer Lock boru konektörü (3.0 mm, Luer kilit dişi = LLF)P335.1carlroth.com
Kauçuk boru (25 mm, 0.72 mm ID)2600185newageindustries.com
Kauçuk boru (50 mm, 7  mm ID)770350labor-ochs.de
Luer Lock paslanmaz çelik iğne (150 mm, 1.0 mm ID)201015labor-ochs.de
Luer Lock cam şırınga (10 ml)C680.1carlroth.com
Gevşek pamuk –
Butil kauçuk tıpa (ø 1.75 cm)271050labor-ochs.de
Paslanmaz çelik iğne (40 mm, 1.0  mm ID)Sterican4665120bbraun.de
Luer Lock paslanmaz çelik iğne (150 mm, 1,5 mm ID)201520labor-ochs.de
pozisyonu: C.7'de
Polimer tutkalOTTOSEAL S68adchem.de
Paslanmaz çelik iğne (120 mm, 0,7 mm ID)Sterican4665643bbraun.de
Kauçuk boru (40 mm, 0,74 mm iç çap)2600185newageindustries.com
Isıyla daralan makaron (35  mm, 3 mm İç çap küçüldü)541458 - 62conrad.de
Boru kelepçesiSTHC-C-500-4tekproducts.com
Luer Lock tüp konektörü (1.0 mm, LLF)P334.1carlroth.com
Luer Lock plastik kapak (LLM)CT69.1carlroth.com
Cam şişe (5 L)RotilaboY682.1carlroth.com
Bütil kauçuk tıpa (için GL45)444704labor-ochs.de
Paslanmaz çelik kılcal (300 mm, 0,74 mm İç çap)56736sigmaaldrich.com
Paslanmaz çelik kılcal (50 mm, 0,74 mm İç çap)56737sigmaaldrich.com
Shrink makaron (35 mm, 3  mm İç çap küçüldü)541458 - 62conrad.de
Kauçuk boru (100 mm, 0,74 mm İç Çap)2600185newageindustries.com
Luer Lock tüp konektörü (1,0 mm, LLF)P334.1carlroth.com
Luer Lock cam şırınga (10 ml)C680.1carlroth.com
Gevşek pamuk –
Butil kauçuk tıpa (ø 1.75 cm)271050labor-ochs.de
Paslanmaz Çelik iğne (40 mm, 0.8  mm ID)Sterican4657519bbraun.de
Luer kilitli cam şırınga (5 ml)C679.1carlroth.com
Bütil kauçuk tıpa (ø 1.75 mm)271050labor-ochs.de
Kauçuk boru (40 mm, 0.74 mm ID)2600185newageindustries.com
Cam şişe (2 L)RotilaboX716.1carlroth.com
Bütil kauçuk tıpa (GL45 için)444704labor-ochs.de
Paslanmaz çelik kılcal (50 mm, 0,74 mm İç Çap)56736sigmaaldrich.com
Kauçuk boru (30 mm x 0,74 mm İç Çap)2600185newageindustries.com
Kauçuk boru (100 mm x 0,74 mm İç Çap)2600185newageindustries.com
Luer Lock tüp konektörü (1,0 mm, LLF)P334.1carlroth.com
Luer Lock 3 konektör (LLF, 2x LLM)6134cadenceinc.com
Işık kaynağıSamsungSI-P8V151DB1USsamsung.com
Peristalik pompaIsmatecEW-78017-35coleparmer.com
Pompalama boruları (0.89  mm ID)EW-97628-26coleparmer.com
Paslanmaz çelik kılcal (200 mm, 0,74 mm ID)56736sigmaaldrich.com
Paslanmaz çelik kılcal (400 mm, 0,74 mm İç Çap)56737sigmaaldrich.com
Süpel-İnert Folyo (Tedlar - PFC) gaz paketi (10 L)30240-U
sigmaaldrich.com Kauçuk boru (30 mm, 6  mm ID)770300labor-ochs.de
Luer Lock tüp konektörü (3.0 mm, LLM)P343.1carlroth.com
Luer Lock tüp konektörü (3.0 mm, LLF)P335.1carlroth.com
Gaz geçirmez şırınga (20  ml)C681.1carlroth.com
Bunsen brülörü–
Oksijen ölçümü için fiber optik oksijen ölçerPresensTR-FB-10-01presens.de
Vakum pompası–
Oksijen optodları için silikon yapıştırıcıPresensPS1presens.de
doldurulmuş Luer Lock dişi konektör parçası

Kaynaklar

  1. Lyons, T. W., Reinhard, C. T., Planavsky, N. J. The rise of oxygen in Earth's early ocean and atmosphere. Nature. 506 (7488), 307-315 (2014).
  2. Raymond, J., Blankenship, R. E. The origin of the oxygen-evolving complex. Coord. Chem. Rev. 252 (3-4), 377-383 (2008).
  3. Kendall, B., Reinha....

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Yeniden basım ve izinler

Daha fazla makale keşfet

Demir(II) OksidasyonuSiyanobakteri BüyümesiBantlı Demir FormasyonuAkışlı KolonCam Boncuk MatrisiÇözünmüş Oksijen TespitiAnoksik KoşullarFe(II) AkısıIşık Gradyanı