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Articolo metodologico

Modifica del genoma mediato da Lentiviral/Cas9 per lo studio delle cellule ematopoietiche nei modelli di malattia

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DOI:

10.3791/59977

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3 ottobre 2019

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In questo articolo

Sommario

Descritto sono protocolli per l'editing genomico altamente efficiente di cellule staminali e progenitrici (HSPC) murine (HSPC) dal sistema CRISPR/Cas9 per sviluppare rapidamente sistemi di modelli murini con modifiche genetiche specifiche del sistema ematopoietico.

Abstract

La manipolazione dei geni nelle cellule staminali ematopoietiche utilizzando approcci convenzionali di transgenesi può essere dispendiosa in termini di tempo, costi e impegnativi. Approfittando dei progressi nella tecnologia di editing del genoma e nei sistemi di erogazione transgenici mediati da lentivirus, è descritto un metodo efficiente ed economico che stabilisce topi in cui i geni vengono manipolati specificamente nelle cellule staminali ematopoietiche. I lentivirus vengono utilizzati per trasdurre le cellule del midollo osseo con un'RNA guida (gRNA) mirato a geni specifici e a un gene di segnalazione della fluorescenza rossa (RFP), quindi queste cellule vengono trapiantate in topi C57BL/6 irradiati letale. I topi trapiantati con lentivirus che esprimono gRNA non mirati vengono utilizzati come controlli. L'innesto di cellule staminali ematopoietiche trasdotte viene valutato mediante analisi citometrica del flusso di leucociti RFP positivi al sangue periferico. Utilizzando questo metodo, è possibile ottenere la trasduzione di cellule mieloidi e il 70% delle cellule linfoidi a 4 settimane dopo il trapianto. Il DNA genomico è isolato dalle cellule del sangue RFP-positive e parti del DNA del sito mirato sono amplificate dalla PCR per convalidare l'editing del genoma. Questo protocollo fornisce una valutazione ad alto throughput dei geni regolatori dell'ematopoiesi e può essere esteso a una varietà di modelli di malattia dei topi con coinvolgimento delle cellule ematopoietiche.

Introduzione

Molti studi in ematologia e immunologia si basano sulla disponibilità di topi geneticamente modificati, tra cui topi transgenici/knock-out convenzionali e condizionali che utilizzano driver Cre specifici del sistema ematopoietico come Mx1-Cre, Vav-Cre e altri 1,2,3,4,5. Queste strategie richiedono la creazione di nuovi ceppi di topi, che possono richiedere molto tempo e gravare finanziariamente. Mentre i progressi rivoluzionari nella tecnologia di editing del genoma hanno permesso la generazione di nuovi ce....

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Protocollo

Tutte le procedure che coinvolgono soggetti animali sono state approvate dal Comitato istituzionale per la cura e l'uso degli animali (IACUC) dell'Università della Virginia.

1. Generazione e purificazione delle particelle di lentivirus

NOTA: Le particelle di Lentivirus contenenti la guida ottimizzata RNA possono essere prodotte dai protocolli dettagliati forniti da Addgene: . I metodi ottimizzati per la preparazione e lo stoccaggio del lentivirus ad alto titro sono discussi altrove17,

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Risultati

Utilizzando il protocollo sopra descritto, sono stati ottenuti circa 0,8-1,0 x 108 cellule del midollo osseo per topo. Il numero di cellule lignaggio-negativo che otteniamo è di circa 3 x 106 celle per mouse. Tipicamente, la resa delle cellule del lingaggio-negativo del midollo osseo è del 4%-5% di quella delle cellule nucleari totali del midollo osseo.

Il chimerismo delle cellule trasdotte (RFP-positivo) è.......

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Discussione

Il vantaggio di questo protocollo è la creazione di modelli animali che ospitano mutazioni specifiche nelle cellule ematopoietiche in modo rapido e altamente economico rispetto agli approcci transgenici murini convenzionali. Si è scoperto che questa metodologia consente la generazione di topi con manipolazioni geniche delle cellule ematopoietiche entro 1 mese. Ci sono diversi passaggi critici in questo protocollo che richiedono ulteriore considerazione.

Screening della sequenza di gRNA.......

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Dichiarazioni

Gli autori non hanno nulla da rivelare.

Ringraziamenti

S. S. è stato sostenuto da una borsa di studio post-dottorato dell'American Heart Association 17POST33670076. K. W. era supportato dalle sovvenzioni NIH R01 HL138014, R01 HL141256 e R01 HL139819.

....

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Materiali

Elenco dei materiali utilizzati in questo articolo
NomeAziendaNumero di catalogoCommenti
RPMI Medium 1640 (1X)Gibco11875-093
Medium Sulfamethoxazole e Trimetoprim iniezioneTEVA0703-9526-01
1/2 cc LO-DOSE INSULIN SYRINGEEXELINT26028fornitura generale
293T celluleATCCCRL-3216--Linea cellulare
APC-anti-topo Ly6C (Clone AL-21)BD Biosciences560599anticorpi
APC-Cy7-anti-mouse CD45R (RA3-6B2)BD Biosciences552094Anticorpi
Siringhe monouso BD Luer-Lok, 10 mldi309604provette per
la raccolta del sangue BD Microtainer, K2EDTA aggiuntoBD Bioscience365974l'ago
BD Precisionglide, 18 GBD305195
ago BD Precisionglide, 22 G BD305155fornitura generale
BV510-anti-topo CD8a (clone 53-6.7)Biolegend100752Anticorpi
BV711-anti-topo CD3e (clone 145-2C11)Biolegend100349Anticorpi
Collagene da pelle di vitelloSigma-Aldrich9007-34-5fornitura generale
Corning Costar Ultra-Low Attachment Multiple Well Plate, 6 pozzetti Millipore SigmaCLS3471fornitura generale
CRISPR/Cas9 topi knock-inThe Jackson Laboratory028555mouse
DietGel 76AClear H2O70-01-5022fornitura generale
Dulbecco' s Aquila modificata' s Medium (DMEM) - alto glucosioSigma AldrichD6429Medium
eBioscience 1X RBC Lisi BufferThermo fisher Scientific00-4333-57Soluzione
Falcon 100 mm Piatto per colture cellulari trattato con TC Scienzevita353003fornitura generale
Falcon 5 mL provetta in polistirene a fondo tondo LifeSciences352054alimentazione generale
Falcon 50 mL conico Provette per centrifugaFisher Scientific352098fornitura generale
Falcon 6 Well Clear Flat Bottom TC-Treated Multiwell Cell Culture Plate Scienze della vita353046fornitura generale
Provette capillari per microematocrito FisherbrandThermo Fisher Scientific22-362566fornitura generale
Filtri cellulari sterili Fisherbrand, 70 &; mFisher Scientific22363548fornitura generale
FITC-anti-mouse CD4 (clone RM4-5)Invitrogen11-0042-85Anticorpi
Fixation BufferBD Bioscience554655Solution
Guide-it Compete sgRNA Screening SystemsClontech632636Kit
Soluzione di isotesia (isoflurano)Henry Schein29404
Kit di titolazione Lenti-X qRT-PCR in soluzione Kit631235Takara
Kit di deplezione cellulare per lignaggio, topoMiltenyi Biotec130-090-858Kit
Millex-HV Unità filtro siringa, 0,45 mmMillipore SigmaSLHV004SLalimentazione generale
PBS pH7.4 (1X)GibcoSoluzione 10010023
PE-Cy7-anti-mouse CD115 (Clone AFS98)eBioscience25-1152-82Anticorpi
PEI MAXPolysciences24765-1Soluzione
Penicillina-Streptomicina MiscelaLonza17-602FSoluzione
PerCP-Cy5.5-anti-topo Ly6G (Clone 1A8)BD Biosciences560602Anticorpi
pLKO5.sgRNA.EFS.tRFP Addgene57823Plasmide
pMG2DAddgene12259Plasmide
Polibrene Reagente di infezione/trasfezioneSigma AldrichTR-1003-GSoluzione
Polipropilene Provette per centrifugaBECKMAN COULTER326823fornitura generale
psPAX2 Addgene12260Plasmide
RadDisk – Disco Irradiatore RoditoriBraintree ScientificIRD-P Mfornitura generale
Murina Ricombinante SCFPeprotech250-03Soluzione
Murina Ricombinante TPO Peprotech 315-14Soluzione
StemSpan SFEMSTEMCELL Technologies09600Soluzione
Kit di clonazione TOPO TA per il sequenziamento con One Shot TOP10 Kit di K457501 scientifico E.coliThermo fisherdi vitalità
fissabile Zombie Aqua423102BioLegend 
BD della chimicamente competente Kit Soluzione di

Riferimenti

  1. Sasaki, Y., et al. Defective immune responses in mice lacking LUBAC-mediated linear ubiquitination in B cells. EMBO Journal. 32, 2463-2476 (2013).
  2. Ogilvy, S., et al. Transcriptional regulation of vav, a gene expressed thro....

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Ristampe e permessi

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