Summary

चूहा मस्तिष्क ऊतक के लिए एक हाइड्रोफोबिक ऊतक समाशोधन विधि

Published: December 23, 2020
doi:

Summary

यहां हम एक हाइड्रोफोबिक ऊतक समाशोधन विधि पेश करते हैं जो अक्षुण्ण मस्तिष्क संरचनाओं के हिस्से के रूप में लक्ष्य अणुओं को देखने की अनुमति देता है। इस तकनीक को अब F344/N नियंत्रण और एचआईवी-1 दोनों लिंगों के ट्रांसजेनिक चूहों के लिए मान्य किया गया है ।

Abstract

हाइड्रोफोबिक ऊतक समाशोधन विधियां आसानी से समायोज्य, तेज और कम लागत वाली प्रक्रियाएं हैं जो अनछुए ऊतक नमूनों में रुचि के अणु के अध्ययन के लिए अनुमति देती हैं। पारंपरिक इम्यूनोलाबेलिंग प्रक्रियाओं को नमूने को पतले वर्गों में काटने की आवश्यकता होती है, जो अक्षुण्ण संरचनाओं को लेबल और जांच करने की क्षमता को प्रतिबंधित करता है। हालांकि, यदि प्रसंस्करण के दौरान मस्तिष्क के ऊतक बरकरार रह सकते हैं, तो विश्लेषण के लिए संरचनाएं और सर्किट बरकरार रह सकते हैं। पहले स्थापित समाशोधन विधियों को ऊतक को पूरी तरह से साफ करने में महत्वपूर्ण समय जाता है, और कठोर रसायन अक्सर संवेदनशील एंटीबॉडी को नुकसान पहुंचा सकते हैं। iDISCO विधि जल्दी से और पूरी तरह से ऊतक को साफ करता है, कई एंटीबॉडी के साथ संगत है, और कोई विशेष प्रयोगशाला उपकरण की आवश्यकता है। इस तकनीक को शुरू में चूहों के ऊतकों में उपयोग के लिए मान्य किया गया था, लेकिन वर्तमान प्रोटोकॉल इस विधि को नियंत्रण और ट्रांसजेनिक चूहे के दिमाग के छवि गोलार्द्धों के लिए अनुकूलित करता है। इसके अलावा, वर्तमान प्रोटोकॉल कम पृष्ठभूमि धुंधला के साथ स्पष्ट छवियों को प्रदान करने के लिए पहले से मौजूद प्रोटोकॉल के लिए कई समायोजन भी करता है। वर्तमान हाइड्रोफोबिक ऊतक समाशोधन विधि का उपयोग करके एचआईवी-1 ट्रांसजेनिक चूहे में और F344/N नियंत्रण चूहों में आईबीए-1 और टायरोसिन हाइड्रोक्सिलेज के लिए एंटीबॉडी मान्य थे । मस्तिष्क एक इंटरबुने नेटवर्क है, जहां संरचनाएं एक दूसरे के अलग से अधिक बार एक साथ काम करती हैं। व्यक्तिगत टुकड़ों के संयोजन के विपरीत एक पूरी प्रणाली के रूप में मस्तिष्क का विश्लेषण करना इस पूरे मस्तिष्क समाशोधन विधि का सबसे बड़ा लाभ है।

Introduction

हाइड्रोजेल, हाइड्रोफिलिक और हाइड्रोफोबिक: मस्तिष्क में उपयोग के लिए कई ऊतक समाशोधन तकनीकों को मान्य किया गया है। इन तकनीकों का उद्देश्य सॉल्वैंट्स के प्रशासन के माध्यम से परिसीमन, विच्छेदन और डिक्लेरेशन के माध्यम से एक ऊतक को पारदर्शी बनाना है। एक बार जब ऊतक नमूने का अपवर्तक सूचकांक चुने गए इमेजिंग माध्यम के अपवर्तक सूचकांक से मेल खाता है, तो नमूने की एक स्पष्ट छवि प्राप्त की जा सकती है। स्पष्टता जैसी हाइड्रोगेल आधारित तकनीकें ऊतक में एक्रिल-आधारित हाइड्रोगेल से जोड़कर जैव अणुओं को सुरक्षित करती हैं, जो संरचनात्मक क्षति और प्रोटीन की हानि को रोकती है1। हालांकि, हाइड्रोगेल तकनीक कठोर रसायनों का उपयोग अधिक नाजुक ऊतकों को नुकसान पहुंचाने की क्षमता से होती है, और डेंजर ऊतक नमूने हाइड्रोगेल प्रोटोकॉल के साथ संगत नहीं हो सकते हैं। कुछ हाइड्रोगेल तकनीकों को महंगे उपकरणों की आवश्यकता हो सकती है या ऊतक विस्तार का कारण बन सकता है। क्यूबिक जैसी हाइड्रोफिलिक तकनीकें ऊतक 2 के भीतर हाइड्रोजन बांड के गठन के माध्यम से 3 डी संरचना कोसंरक्षितकरते हैं। ऊतक विस्तार भी कुछ हाइड्रोफिलिक प्रोटोकॉल में हो सकता है। हाइड्रोफिलिक तकनीकों की समाशोधन क्षमता अक्सर हाइड्रोफोबिक तकनीकों की क्षमता से मेल नहीं खाती है, जो डेंजर और मोटे ऊतकों के लिए महत्वपूर्ण है3।

हाइड्रोफोबिक तकनीक आमतौर पर तेज होती है, विशेष उपकरणों की आवश्यकता नहीं होती है, और एक नमूना पेश करती है जिसे संभालना और स्टोर करना आसान होता है। आईआईडस्को एक हाइड्रोफोबिक तकनीक है जो अन्य हाइड्रोफोबिक प्रोटोकॉल में होने वाली सिकुड़न को समाप्त करती है। मूल रूप से, iDISCO ऊतक समाशोधन तकनीक Renier एट अल द्वारा वर्णित किया गया था4 भ्रूण और घने, चूहों के वयस्क अंगों के लिए । यह तकनीक शुरुआती डिहाइड्रेशन स्टेप में टिश्यू से पानी निकालती है, जिससे लाइट स्कैटर कम हो जाती है। ऊतक को प्रीट्रीटमेंट के दौरान गहरे एंटीबॉडी प्रवेश की अनुमति देने के लिए पार किया जाता है। सुदूर लाल स्पेक्ट्रम में एलेक्सा फ्लोर रंगों का उपयोग कम तरंगदैर्ध्य 5 पर ऊतक के ऑटोफ्लोरेसेंस से बचने के लिए इम्यूनोलबेलिंग के लिए कियाजाताहै। ऊतक जो हाइड्रोफोबिक समाशोधन प्रोटोकॉल से गुजरा है, आसानी से संभाला जा सकता है और एलेक्सा फ्लोर रंगों की दीर्घायु के कारण कई बार इमेज किया जा सकता है। यदि ठीक से संग्रहीत किया जाता है, तो ऊतक प्रारंभिक प्रसंस्करण के बाद महीनों से एक साल तक छवियां प्रदान कर सकते हैं।

वर्तमान प्रोटोकॉल में नर और महिला नियंत्रण और एचआईवी-1 ट्रांसजेनिक (टीजी) चूहे के दिमाग पर टायरोसिन हाइड्रोक्सिलेज (टीएच) एंटीबॉडी, आईबीए1 एंटीबॉडी और हैजा टॉक्सिन सबयूनिट बी (सीटीबी) का इस्तेमाल किया गया । एचआईवी-1 टीजी चूहे में नौ जीन में से सात होते हैं जिनमें एचआईवी-1 वायरल जीनोम शामिल होता है, जो लंबे समय तक एचआईवी-1 प्रोटीन एक्सपोजर6, 7, 8के गैर-संक्रामक मॉडल की ओरजाताहै। डोपामिनेर्गिक परिवर्तन पहले एचआईवी-1 टीजी चूहे में प्रदर्शित किए गए हैं, और एचआईवी-1 अपने आप में एक भड़काऊ बीमारी है, इसलिए एंटीबॉडी विकल्प प्रायोगिक डिजाइन9,10, 11,12के लिए प्रासंगिक था। सीटीबी एक ट्रेसर है जो गैंगलियोसाइड बाइंडिंग के माध्यम से न्यूरॉन्स को देता है और मस्तिष्क में अफरेंट अनुमानों का पता लगाने के लिए इस्तेमाल किया जा सकता है। सीटीबी का उपयोग पहले नाभिक एकुम्बेंस से लेकर सबस्टेंटिया निगरा क्षेत्र तक के अनुमानों का अध्ययन करने के लिए किया जाता है, मस्तिष्क के दो क्षेत्र 13 ,14,15के साथ भारी रूप से शामिल होते हैं।

इस प्रोटोकॉल में, TH डोपामाइन उत्पादन के लिए एक मार्कर के रूप में काम करेगा, और Iba1 सक्रिय माइक्रोग्लिया को चिह्नित करेगा। टीएच एंटीबॉडी का उपयोग लगभग 62 केडीए पर एक बैंड को चुनिंदा रूप से लेबल करता है जो टायरोसिन हाइड्रोक्सिलेज से मेल खाता है। Iba1 एंटीबॉडी Iba1 कार्बोक्सी-टर्मिनल अनुक्रम से मेल खाती है। दोनों एंटीबॉडी खरगोश में उठाए गए थे और पॉलीक्लोनल थे। सीटीबी का उपयोग नाभिक एक्यूबेन्स क्षेत्र से सबस्टेंटिया निगरा क्षेत्र तक न्यूरॉन्स के प्रतिगामी ट्रेसिंग के लिए किया जाएगा। वर्तमान प्रोटोकॉल दो अलग-अलग तरीकों से मूल पहचानो प्रोटोकॉल के समायोजन के लिए एक दिशानिर्देश भी प्रदान करता है: 1) अवरुद्ध चरणों में सीरम अभिकर् म को बदलकर पृष्ठभूमि धुंधला की समग्र कमी, और 2) बड़े ऊतक नमूनों के लिए उपयुक्त होने के लिए इनक्यूबेशन समय की स्केलिंग। कुल मिलाकर, वर्तमान प्रोटोकॉल निरंतर सबूत प्रदान करता है कि हाइड्रोफोबिक समाशोधन तकनीक चूहे के मस्तिष्क के ऊतकों में संभव है, एचआईवी-1 वायरल प्रोटीन के साथ कोई प्रत्यक्ष हानिकारक बातचीत नहीं है, और टीएच एंटीबॉडी, Iba1 एंटीबॉडी और सीटीबी के साथ संगत हैं।

Protocol

सभी पशु प्रोटोकॉल की समीक्षा की और दक्षिण कैरोलिना विश्वविद्यालय में पशु देखभाल और उपयोग समिति द्वारा अनुमोदित किया गया । 1. स्टॉक समाधान तैयारी समाधान 1 (1 एल): डिओनाइज्ड एच2ओ के 900 एमएल …

Representative Results

F344/N और एचआईवी-1 चूहा मस्तिष्क ऊतक दोनों के बड़े वर्गों की पूर्ण समाशोधन इस संशोधित हाइड्रोफोबिक ऊतक समाशोधन प्रोटोकॉल का उपयोग कर प्राप्त किया गया था । चित्रा 1 सब्स्टाटिया निग्रा क्षेत्र म?…

Discussion

ऊतक समाशोधन पारंपरिक आईएचसी प्रोटोकॉल की सीमाओं का समाधान प्रदान करता है। एक नमूना जो पारदर्शी होता है, प्रकाश के बिखरने और अवशोषण को कम करता है, जो18,19को अक्षुण्ण ऊतकों तक सेलुलर ?…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

इस काम को एनआईएच अनुदान द्वारा वित्त पोषित किया गया था: NS100624, DA013137, HD043680, MH106392 और T32 प्रशिक्षण अनुदान द्वारा 5T32GM081740

Materials

Cholera Toxin Subunit B (Recombinant), Alexa Fluor 488 Invitrogen C34775
DBE Sigma-Aldrich 108014-1KG
DCM Sigma-Aldrich 270997-100mL
DMSO Sigma-Aldrich 472301-1L
Glycine Fisher Chemical G46-500
Goat anti-rabbit Alexa Fluor Plus 647 Invitrogen A32733
Goat serum Sigma Life Science G9023-10mL
Heparin Acros Organics 41121-0010
Iba1 primary antibody FUJIFILM Wako 019-19741
Kwik-sil epoxy VWR 70730-062
Methanol Sigma-Aldrich 34860-1l-R
PBS Fisher Bioreagents BP2944-100
Perfusion machine VWR 70730-062 mini pump variable flow
PFA Sigma-Aldrich 158127-3KG
TH primary antibody Millipore Sigma AB152
TritonX-100 Fisher Bioreagents BP151-500
Tween-20 Fisher Bioreagents BP337-500

References

  1. Chung, K., et al. Structural and molecular interrogation of intact biological systems. Nature. 497 (7449), 332-337 (2013).
  2. Susaki, E. A., et al. Whole-brain imaging with single-cell resolution using chemical cocktails and computational analysis. Cell. 157 (3), 726-739 (2014).
  3. Ueda, H. R., et al. Tissue clearing and its applications in neuroscience. Nature Reviews Neuroscienc. 21, 298 (2020).
  4. Renier, N., et al. iDISCO: a simple, rapid method to immunolabel large tissue samples for volume imaging. Cell. 159 (4), 896-910 (2014).
  5. Renier, N., et al. Mapping of brain activity by automated volume analysis of immediate early genes. Cell. 165 (7), 1789-1802 (2016).
  6. Reid, W., et al. An HIV-1 transgenic rat that develops HIV-related pathology and immunologic dysfunction. Proceedings of the National Academy of Science U. S. A. 98, 9271-9276 (2001).
  7. Vigorito, M., Connaghan, K. P., Chang, S. L. The HIV-1 transgenic rat model of neuroHIV. Brain, Behavior, and Immunity. 48, 336-349 (2015).
  8. McLaurin, K. A., et al. Synaptic connectivity in medium spiny neurons of the nucleus accumbens: A sex-dependent mechanism underlying apathy in the HIV-1 transgenic rat. Frontiers in Behavior Neurosciences. 12, 285 (2018).
  9. Fitting, S., Booze, R. M., Mactutus, C. F. HIV-1 proteins, Tat and gp120, target the developing dopamine system. Current HIV Research. 13, 135-137 (2015).
  10. Javadi-Paydar, M., Roscoe, R. F., Denton, A. R., Mactutus, C. F., Booze, R. M. HIV-1 and cocaine disrupt dopamine reuptake and medium spiny neurons in female rat striatum. PLos One. 12 (11), 0188404 (2017).
  11. Bertrand, S. J., Mactutus, C. F., Harrod, S. B., Moran, L. M., Booze, R. M. HIV-1 proteins dysregulate motivational processes and dopamine circuitry. Science Report. 8, 6152 (2018).
  12. Denton, A. R., et al. Selective monoaminergic and histaminergic circuit dysregulation following long-term HIV-1 protein exposure. Journal of neurovirology. 25 (4), 540-550 (2019).
  13. Berendse, H. W., Groenewegen, H. J., Lohman, A. H. Compartmental distribution of ventral striatal neurons projecting to the mesencephalon in the rat. Journal of Neuroscienc. 12 (6), 2079-2103 (1992).
  14. Peyron, C., Petit, J. M., Rampon, C., Jouvet, M., Luppi, P. H. Forebrain afferents to the rat dorsal raphe nucleus demonstrated by retrograde and anterograde tracing methods. Neuroscience. 82 (2), 443-468 (1998).
  15. Barrot, M., et al. Braking dopamine systems: a new GABA master structure for mesolimbic and nigrostriatal functions. The Journal of Neuroscience: The Official Journal of the Society for Neuroscienc. 32 (41), 14094-14101 (2012).
  16. Roostalu, U., et al. Quantitative whole-brain 3D imaging of tyrosine hydroxylase-labeled neuron architecture in the mouse MPTP model of Parkinson’s disease. Disease Models & Mechanisms. 12 (11), (2019).
  17. Ransohoff, R., Cardona, A. The myeloid cells of the central nervous system parenchyma. Nature. 468, 253-262 (2010).
  18. Rocha, M. D., et al. Tissue Clearing and Light Sheet Microscopy: Imaging the Unsectioned Adult Zebra Finch Brain at Cellular Resolution. Frontiers in Neuroanatomy. 13, 13 (2019).
  19. Richardson, D. S., Lichtman, J. W. Clarifying tissue clearing. Cell. 162 (2), 246-257 (2015).
check_url/61821?article_type=t

Play Video

Cite This Article
Kirchner, K. N., Li, H., Denton, A. R., Harrod, S. B., Mactutus, C. F., Booze, R. M. A Hydrophobic Tissue Clearing Method for Rat Brain Tissue. J. Vis. Exp. (166), e61821, doi:10.3791/61821 (2020).

View Video