Summary

Aip1p Dynamics são alteradas pela R256H Mutação em actina

Published: July 30, 2014
doi:

Summary

Mutações causadoras de doenças em actina pode alterar a função do citoesqueleto. Dinâmica do citoesqueleto são quantificados através de imagens de proteínas fluorescentes marcados através de microscopia de fluorescência total de interna. Como exemplo, a proteína do citoesqueleto, Aip1p, alterou a localização e movimento em células que expressam a isoforma da actina mutante, R256H.

Abstract

Mutações em actina causar uma variedade de doenças humanas devido a alterações moleculares específicos que muitas vezes alteram a função do citoesqueleto. Neste estudo, a imagiologia por fluorescência utilizando proteínas marcadas com fluorescência interna total (TIRF) microscopia é usado para visualizar e quantificar as alterações na dinâmica do citoesqueleto. Microscopia TIRF e a utilização de marcadores fluorescentes também permite a quantificação das alterações na dinâmica do citoesqueleto causadas por mutações em actina. Usando esta técnica, a quantificação da função do citoesqueleto em células vivas complementa um valioso em estudos in vitro da função da proteína. Como um exemplo, as mutações que afectam a missense resíduo R256 actina foram identificadas três isoformas de actina em humanos, sugerindo este aminoácido desempenha um papel importante nas interacções reguladoras. Os efeitos da mutação R256H actina do citoesqueleto em movimentos foram estudadas utilizando o modelo de levedura. A proteína, AIP1, que é conhecido por auxiliar cofilina na despolimerização da actina, estavamarcado com proteína verde fluorescente (GFP) na extremidade N-terminal e rastreados in vivo utilizando microscopia TIRF. A taxa de movimento Aip1p, tanto do tipo selvagem e mutantes foi quantificada. Em células que expressam R256H actina mutante, Aip1p movimento é restringido e a velocidade do movimento é quase metade da velocidade medida em células do tipo selvagem (0,88 ± 0,30 mM / seg em células R256H em comparação com 1,60 ± 0,42 mM / seg em células de tipo selvagem, p <0,005).

Introduction

A actina é a proteína predominante, compreendendo o citoesqueleto e participa em processos celulares importantes, incluindo a divisão celular, movimento organelo, motilidade celular, a contracção, e de sinalização. Ao longo da última década, as mutações que causam doenças em actina foram descobertos em cada uma das seis isoformas de actina humanos que conduzem a uma variedade de desordens, a partir de miopatias para doença da artéria coronária 1-7. Os processos pelos quais as mutações que conduzem à doença de actina continuar a ser elucidados. O modelo de levedura continua sendo o padrão ouro para o estudo dos efeitos bioquímicos de mutações na função actina devido às vantagens da única isoforma de actina essencial, rastreabilidade genética e alta conservação de seqüência e função de actina. Estudos mostram que as mutações individuais de actina levar a disfunções específicas moleculares com efeitos negativos dominantes 8. Por exemplo, as mutações que causam surdez na actina γ não-músculo-que afetam o resíduo Lys-118 altera regulamentação pora proteína de ligação à actina Arp2 / 3 9. Estudos in vitro freqüentemente empregam análises de proteína: interações protéicas. As investigações sobre o efeito da actina mutações em biologia celular e, em particular, agindo localização da proteína de ligação na célula são limitados.

Estudos sobre o citoesqueleto de levedura in vivo convencionalmente dependem de imagens de células fixadas a partir de um microscópio de fluorescência invertido 10. Estas experiências forneceu dados fundamentais sobre a morfologia do citoesqueleto de actina. As investigações, desde então, incorporou três dimensional imagem confocal para visualizar a rede do citoesqueleto complexo 11, 12. Esta imagem permite a quantificação da abundância e localização relativa de manchas de actina e filamentos. A tomografia de electrões secção fina tem sido utilizado para a imagem da morfologia das redes filamentosas densas relativos a estruturas subcelulares conservados 13. Lotado s celularespassos com uma pequena seção transversal pode ser examinado em detalhes finos com esta técnica. Estudos de imagem foram estendidas para as células vivas por microscopia de fluorescência de lapso de tempo. Quando branqueamento foto e fluorescência de fundo pode ser moderado, lapso de tempo de imagem permite que as investigações a respeito da dinâmica de proteínas do citoesqueleto ea resposta a condições ambientais 11, 14. Separadamente, a visualização da dinâmica dos filamentos de actina in vitro foi avançada pela introdução de reflexão total interna microscopia de fluorescência (TIRF). Em comparação com a microscopia de campo amplo, TIRF tem a vantagem da diminuição da fluorescência de fundo e contraste melhorado para controlar os filamentos individuais 15, 16. Com estas características, microscopia TIRF foi adaptado por biólogos celulares para monitorizar estruturas celulares na membrana de plasma 17, 18. Eventos celulares, incluindo mudanças no citoesqueleto, podeser visualizados em tempo real, com baixa fototoxicidade, máximo contraste e fundo mínimo de fluorescência 19.

Para entender melhor o efeito de mutações de actina sobre a movimentação, localização e volume de negócios de proteínas do citoesqueleto da célula, microscopia TIRF e proteína de marcação foram utilizados. Nisto, os métodos para estudar os efeitos de uma mutação clinicamente relevante em actina sobre a dinâmica do citoesqueleto em Saccharomyces cerevisiae, são descritos. Especificamente, a localização e movimento da proteína de ligação a actina, Aip1p, foi visualizada e quantificada em células que expressam a mutação R256H em actina. Estas técnicas complementares em estudos bioquímicos in vitro e permitir uma maior compreensão das interações protéicas e funções.

Protocol

1. Clonagem no plasmídeo PB1996 Planejar e ativar primers de DNA de um oligonucleotídeo empresa de fabricação que ladeiam a sequência alvo e contêm sítios de restrição únicos no plasmídeo pai selecionado. NOTA: neste caso, os iniciadores foram concebidos para amplificar os pares de base 400 na extremidade 5 'da sequência de AIP1. O local de restrição Xhol, foi incorporado no iniciador de cerca de 20 pb antes da sequência de AIP1, e Xmal foi incluído de cerca de 20 pb após a sequência alv…

Representative Results

Um método para a imagem dinâmica das proteínas do citoesqueleto da célula é apresentado. A proteína de ligação à actina, Aip1p, foi marcado com GFP. O projeto para o plasmídeo que codifica para o produto marcado é mostrado na Figura 1. O plasmídeo foi então transformado em células de levedura. Expressão do fluorescentemente marcado Aip1p permitiu a visualização do comportamento da proteína na célula. Aip1p normalmente localiza a patches de actina em locais de endocitose 22….

Discussion

Uma estratégia eficaz para visualizar a dinâmica do citoesqueleto e a utilidade em investigações sobre mutações patogénicas tem sido descrito aqui. Modalidades de imagem avançadas criaram novas oportunidades para entender o movimento intracelular de proteínas, perto da membrana celular. A microscopia de fluorescência de reflexão interna total (TIRF) é uma técnica sensível para estudos funcionais em células vivas. TIRF usa um laser de excitação angular que cria um campo evanescente, devido à diferença …

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Os autores agradecem Peter Rubenstein para discussão útil e assessoria técnica e David Pellman para o clone PB1996 originais. Este trabalho foi apoiado por uma bolsa da March of Dimes e financiamento do passeio para as crianças.

Materials

Agarose rpi 9012-36-6
Bromophenol Blue Amresco 115-39-9
BSA NEB B9001S
Change-IT Multiple Mutation Site Directed Mutagenesis Kit USB Corporation 4166059
CutSmart Buffer NEB B7204S
DNA, single stranded from salmon testes Sigma 9007-49-2
EDTA pH 7.4 Sigma 93302
Ethidium Bromide Invitrogen 15585-011 Warning! Harmful irritation
Fungal/Bacterial DNA Kit Symo Research D6005
HpaI NEB R0105S
Lithium Acetate AlfaAesar 6108-17-4
Low DNA Mass Ladder Invitrogen 10068-013
NE Buffer #4 NEB B7004S
Platinum PCR SuperMix High Fidelity Invitrogen 12532-016
Miniprep Kit Qiagen 27106 Any kit will work
Quick Ligation Kit NEB M2200S
Sodium azide Sigma 26628-22-8
PBS Invitrogen 10010-023
PEG Amresco 25322-68-3
Tris Base Ultrapure rpi 77-86-1
Wizard SV Gel and PCR Clean-Up System Promega 1/6/2015
XhoI NEB R0146S
XmaI NEB R0180S
YPD media LabExpress 3011
-URA Media LabExpress 3010
PCR Machine Invitrogen 4359659 Any PCR machine will work
TIRF Microscope Olympus IX81
Hamamatsu ORCA-R camera Hamamatsu

References

  1. Lehtonen, H. J., et al. Segregation of a missense variant in enteric smooth muscle actin gamma-2 with autosomal dominant familial visceral myopathy. Gastroenterology. 143, 1482-1491 (2012).
  2. Matsson, H., et al. Alpha-cardiac actin mutations produce atrial septal defects. Hum Mol Genet. 17, 256-265 (2008).
  3. Zhu, M., et al. Mutations in the gamma-actin gene (ACTG1) are associated with dominant progressive deafness (DFNA20/26). Am J Hum Genet. 73, 1082-1091 (2003).
  4. Nowak, K. J., et al. Mutations in the skeletal muscle alpha-actin gene in patients with actin myopathy and nemaline myopathy. Nat Genet. 23, 208-212 (1999).
  5. Olson, T. M., Michels, V. V., Thibodeau, S. N., Tai, Y. S., Keating, M. T. Actin mutations in dilated cardiomyopathy, a heritable form of heart failure. Science. 280, 750-752 (1998).
  6. Riviere, J. B., et al. De novo mutations in the actin genes ACTB and ACTG1 cause Baraitser-Winter syndrome. Nat Genet. 44, 440-444 (2012).
  7. Guo, D. C., et al. Mutations in smooth muscle alpha-actin (ACTA2) lead to thoracic aortic aneurysms and dissections. Nat Genet. 39, 1488-1493 (2007).
  8. Sparrow, J. C., et al. Muscle disease caused by mutations in the skeletal muscle alpha-actin gene (ACTA1). Neuromuscul Disord. 13, 519-531 (2003).
  9. Kruth, K. A., Rubenstein, P. A. Two deafness-causing (DFNA20/26) actin mutations affect Arp2/3-dependent actin regulation. J Biol Chem. 287, 27217-27226 (2012).
  10. Amberg, D. C. Three-dimensional imaging of the yeast actin cytoskeleton through the budding cell cycle. Mol Biol Cell. 9, 3259-3262 (1998).
  11. Pelham, R. J., Chang, F. Role of actin polymerization and actin cables in actin-patch movement in Schizosaccharomyces pombe. Nat Cell Biol. 3, 235-244 (2001).
  12. Vavylonis, D., Wu, J. Q., Hao, S., O’Shaughnessy, B., Pollard, T. D. Assembly mechanism of the contractile ring for cytokinesis by fission yeast. Science. 319, 97-100 (2008).
  13. Bertin, A., et al. Three-dimensional ultrastructure of the septin filament network in Saccharomyces cerevisiae. Mol Biol Cell. 23, 423-432 (2012).
  14. Senning, E. N., Marcus, A. H. Actin polymerization driven mitochondrial transport in mating S. cerevisiae. Proc Natl Acad Sci U.S.A. 107, 721-725 (2010).
  15. Breitsprecher, D., Kiesewetter, A. K., Linkner, J., Faix, J. Analysis of actin assembly by in vitro TIRF microscopy. Methods Mol Biol. 571, 401-415 (2009).
  16. Popp, D., Narita, A., Iwasa, M., Maeda, Y., Robinson, R. C. Molecular mechanism of bundle formation by the bacterial actin ParM. Biochem Biophys Res Commun. 391, 1598-1603 (2010).
  17. Trache, A., Lim, S. M. Live cell response to mechanical stimulation studied by integrated optical and atomic force microscopy. J Vis Exp. (44), (2010).
  18. Spira, F., Dominguez-Escobar, J., Muller, N., Wedlich-Soldner, R. Visualization of cortex organization and dynamics in microorganisms, using total internal reflection fluorescence microscopy. J Vis Exp. (63), e3982 (2012).
  19. Manneville, J. B. Use of TIRF microscopy to visualize actin and microtubules in migrating cells. Methods Enzymol. 406, 520-532 (2006).
  20. Cook, R. K., Sheff, D. R., Rubenstein, P. A. Unusual metabolism of the yeast actin amino terminus. J Biol Chem. 266, 16825-16833 (1991).
  21. Feng, L., et al. Fluorescence probing of yeast actin subdomain 3/4 hydrophobic loop 262-274. Actin-actin and actin-myosin interactions in actin filaments. J Biol Chem. 272, 16829-16837 (1997).
  22. Lin, M. C., Galletta, B. J., Sept, D., Cooper, J. A. Overlapping and distinct functions for cofilin, coronin and Aip1 in actin dynamics in vivo. J Cell Sci. 123, 1329-1342 (2010).
  23. Malloy, L. E., et al. Thoracic Aortic Aneurysm (TAAD)-causing Mutation in Actin Affects Formin Regulation of Polymerization. J Biol Chem. 287, 28398-28408 (2012).
  24. Smyth, J. W., Shaw, R. M. Visualizing ion channel dynamics at the plasma membrane. Heart Rhythm. 5, S7-S11 (2008).
  25. Bhattacharya, R., et al. Recruitment of vimentin to the cell surface by beta3 integrin and plectin mediates adhesion strength. J Cell Sci. 122, 1390-1400 (2009).
  26. Hetheridge, C., et al. The formin FMNL3 is a cytoskeletal regulator of angiogenesis. J Cell Sci. 125, 1420-1428 (2012).
  27. Bergeron, S. E., et al. Allele-specific effects of thoracic aortic aneurysm and dissection alpha-smooth muscle actin mutations on actin function. J Biol Chem. 286, 11356-11369 (2011).
check_url/51551?article_type=t

Play Video

Cite This Article
Pierick, A. R., McKane, M., Wen, K., Bartlett, H. L. Aip1p Dynamics Are Altered by the R256H Mutation in Actin. J. Vis. Exp. (89), e51551, doi:10.3791/51551 (2014).

View Video