Summary
该方法利用线粒体通透性转变孔隙对低导质子泄漏的贡献,确定与野生型对照相比,心肌细胞线粒体辅酶Q含量增加的新生儿脆性X综合征小鼠孔隙开放的电压阈值。
Abstract
线粒体通透性转变孔(mPTP)是一种电压门控,非选择性,线粒体内膜(IMM)巨型通道,在健康和疾病中很重要。mPTP介导质子在低电导开口期间通过IMM泄漏,并被环孢菌素A(CsA)特异性抑制。辅酶Q(CoQ)是mPTP的调节因子,在脆性X综合征(FXS, Fmr1 敲除)的新生小鼠模型中,已经发现前脑和心脏线粒体中CoQ含量和mPTP开放概率的组织特异性差异。我们开发了一种技术来确定这种突变应变中mPTP开口的电压阈值,利用mpTPP作为质子泄漏通道的作用。
为此,在泄漏呼吸期间,使用极谱法和四苯基膦(TPP +)离子选择性电极在分离的线粒体中同时测量氧消耗量和膜电位(ΔΨ)。mPTP打开的阈值由CsA介导的对特定膜电位处质子泄漏的抑制的发作决定。使用这种方法,在辅酶Q过量的背景下精确定义了mpTPP的电压门控差异。这种新技术将允许未来的研究,以增强对mpTPP低电导开口的生理和病理调节的理解。
Introduction
mPTP介导渗透率转变(PT),由此IMM突然变得对小分子和溶质1,2具有渗透性。这种惊人的现象明显背离了IMM的特征不渗透性,后者是建立氧化磷酸化3所需的电化学梯度的基础。与其他线粒体转运机制不同,PT是一种高电导,非特异性和非选择性过程,允许一系列分子通过高达1.5 kDa4,5。mPTP是IMM内的电压门控通道,其开口会改变ΔΨ,ATP产生,钙稳态,活性氧(ROS)产生和细胞活力4。
在病理极端,mPTP的不受控制和长时间的高电导开放导致电化学梯度的塌陷,基质肿胀,基质吡啶核苷酸的消耗,外膜破裂,膜间蛋白(包括细胞色素c)的释放,最终导致细胞死亡4,6。这种病理性 mPTP 开放与心肌缺血再灌注损伤、心力衰竭、创伤性脑损伤、各种神经退行性疾病和糖尿病有关1,7。然而,低电导 mPTP 开孔本质上是生理性的,与高导通度开路相比,不会导致严重的去极化或线粒体肿胀4.
孔隙的低电导开口将渗透率限制在~300 Da,允许质子独立于ATP合成通过,并且是生理质子泄漏的潜在来源5。生理mPTP开放导致ΔΨ的受控下降,通过呼吸运输链增加电子通量,并导致超氧化物的短爆发或闪光,有助于ROS信号传导8。调节这种短暂的mPTP开放对于钙稳态和正常细胞发育和成熟很重要4,9,10,11。例如,发育中神经元的瞬时孔隙打开触发分化,而mPTP的闭合诱导未成熟心肌细胞4,5的成熟。
尽管mpTPP在健康和疾病中的功能意义已经确定,但其确切的分子身份仍然存在争议。mPTP的分子结构和功能研究进展已在别处进行了全面综述12.简言之,目前,mPTP的高导率和低电导状态已被假设为由不同的实体介导12。主要候选者是F1 / F0 ATP合酶(ATP合酶)和腺嘌呤核苷酸转运蛋白(ANT),分别用于高导和低电导模式,分别为12。
尽管对mpTPP的孔隙形成成分的确切身份缺乏共识,但某些关键特征已经详细说明。mPTP的一个公认特征是它受电化学梯度调节,使得IMM的去极化导致孔隙开口13。先前的研究表明,副硫醇基团的氧化还原状态改变了mPTP的电压门控,使得氧化以相对较高的ΔΨs打开孔隙,硫醇基团还原导致闭合mPTP概率为14。然而,蛋白质电压传感器的身份是未知的。
已经确定了调节孔隙开放概率的各种小分子。例如,mPTP可以被钙、无机磷酸盐、脂肪酸和ROS刺激打开,并且可以被腺嘌呤核苷酸(特别是ADP)、镁、质子和CsA5,12抑制。其中一些监管机构的作用机制已经阐明。线粒体钙至少部分通过与ATP合酶15的β亚基结合来触发mPTP开放。ROS可以通过降低其对ADP的亲和力并增强其对亲和力环蛋白D(CypD)的亲和力来激活mpTPP,环蛋白D是研究最好的蛋白质mpTPP激活剂16。无机磷酸盐和脂肪酸活化mpTPP的机制尚不清楚。至于内源性抑制剂,ADP被认为通过在ANT或ATP合酶处结合来抑制mpTPP,而镁通过从其结合位点15,17,18,19中取代钙来发挥其抑制作用。
低 pH 值通过质子化 ATP 合酶 12,20,21 的调节寡霉素敏感性赋予蛋白 (OSCP) 亚基的组氨酸112 来抑制 mPTP 开放。mPTP的典型药物抑制剂CsA通过结合CypD并阻止其与OSCP22,23的关联起作用。先前的工作还表明,各种CoQ类似物与mpTPP相互作用,抑制它或激活它24。在最近的研究中,我们发现由于新生FXS小鼠幼崽的前脑线粒体CoQ缺乏而导致的病理性开放mPTP,过度质子泄漏和低效氧化磷酸化的证据。
用外源性辅酶Q闭合孔阻断了树突状棘的病理性质子泄漏并诱导了形态学成熟25。有趣的是,在相同的动物中,与野生型对照组相比,FXS心肌细胞具有过量的CoQ水平和闭合的mPTP概率26。虽然这些组织特异性CoQ水平差异的原因尚不清楚,但这些发现强调了内源性CoQ可能是mpTPP的关键调节因子的概念。然而,我们的知识存在重大差距,因为辅酶Q介导的mPTP抑制机制仍然未知。
mPTP的调节是细胞信号传导和存活的关键决定因素4。因此,在考虑特定的病理生理机制时,检测线粒体内的mPTP开放是关键。通常,高导电孔隙开口的阈值是使用钙来触发渗透性转变来确定的。这种钙负荷导致膜电位的塌陷,氧化磷酸化的快速解偶联和线粒体肿胀27,28。我们试图开发一种方法来 检测原位 低电导的mPTP开口,而不会诱导它 本身。
该方法利用了mpTPP作为质子泄漏通道的作用。为此,采用Clark型和TPP+ 离子选择性电极分别在泄漏呼吸期间同时测量孤立线粒体中的耗氧量和膜电位29。mPTP打开的阈值由CsA介导的对特定膜电位处质子泄漏的抑制的发作决定。使用这种方法,可以精确地定义在CoQ过量的情况下mPTP的电压门控差异。
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Protocol
哥伦比亚大学医学中心机构动物护理和使用委员会批准了所有描述的方法。FXS (Fmr1 KO) (FVB.129P2-Pde6b+ Tyrc-ch Fmr1tm1Cgr/J) 和对照 (FVB) (FVB.129P2-Pde6b+ Tyrc-ch/AntJ) 小鼠作为本研究的模型系统,在商业上获得(见 材料表)。每个实验组使用五到十一只动物。使用产后第10天(P10)小鼠模拟人类婴儿期的某个时间点。
1. 从小鼠心脏中分离线粒体
- 制备用于线粒体分离和呼吸实验的缓冲液,如 表1所述。如果提前制作,请储存在4°C。
- 制备15%密度梯度培养基:用密度梯度稀释剂将商业密度梯度培养基稀释至80%体积/体积(v / v)。通过添加线粒体分离缓冲液(MI)/牛血清白蛋白(BSA),进一步稀释80%密度梯度培养基15%v / v。
- 从新鲜,非冷冻组织中分离线粒体用于这些实验,并在制备当天使用,通常在5小时内26。在冰上执行所有隔离步骤。
- 将鼠标斩首并切除心脏。立即在培养皿中用冰冷的MI / BSA清洗1-2次。切下心房并切碎组织。
- 将切碎的心脏组织转移到含有1 mL MI / BSA的玻璃玻璃均质器中。用较松的(A)杵(10冲程)均匀化,然后用较紧的(B)杵(10冲程)均匀化。
- 将匀浆物在4°C下以1,100× g 离心2分钟以除去核和细胞碎片。
- 轻轻地取上清液而不接触任何蓬松的沉淀,并小心地将其层放在离心管中700μL15%密度梯度培养基上。在4°C下以18,500× g 离心15分钟。
- 将沉淀重悬于1mL蔗糖缓冲液(SB)/ BSA中,并在4°C下以10,000× g 离心10分钟。
- 完全除去并丢弃上清液。将沉淀重悬于SB / BSA中至最终体积为55μL。
- 使用标准测定(例如双辛胆酸(BCA)蛋白质测定)定量线粒体蛋白质含量。
2. 线粒体氧 (O2) 消耗量和 ΔΨ
- 氧电极组装和校准
- 根据制造商的说明设置和校准氧电极(参见 材料表)。
- 将一滴50%氯化钾(KCl)电解质溶液放在电极盘圆顶的顶部。
- 在电解质滴上放置一小块〜2厘米2 的香烟纸垫片,上面覆盖着一块稍大的提供的聚四氟乙烯(PTFE)膜。
- 使用提供的涂覆器工具,将小电极盘O形圈推过电极的圆顶。
注意:确保没有气泡,并且膜是光滑的。
- 用电解质溶液充分补充储液槽。
- 将较大的O形圈放在电极盘周围的凹槽中。
- 将圆盘安装到电极室中,然后将其连接到控制单元。
- 向反应室中加入2 mL空气饱和去离子水,向反应室中加入PTFE涂层磁铁。
- 将腔室连接到控制单元的后部。
- 将温度设置为37°C,搅拌速度设置为100。
- 在开始校准之前,等待10分钟以使系统温度平衡。
- 在“ 校准 ”选项卡下,选择“ 液相校准 ”以执行液相校准。确认温度设置为37°C,搅拌速度为100,压力设置为大气压(101.32 kPa)。
- 按 确定 并等待信号稳定。
- 达到平台值时,按 OK。
- 通过加入少量(〜20mg )的连二亚硫酸钠在腔室中建立零O 2。
- 按 确定 并等待信号稳定。
- 达到平台值时,按 保存 接受校准。
- 根据制造商的说明设置和校准氧电极(参见 材料表)。
- TPP+选择性电极组件
- 使用提供的注射器和柔性针头用10 mM TPP溶液填充TPP +-选择性电极头,注意避免气泡。
- 根据制造商的说明组装TPP+选择性电极装置,包括参比电极和电极支架(见 材料表)。
- 简单地拧松电极支架盖,然后将内部参比电极插入TPP+尖端。拧紧盖子以固定尖端。将提供的电缆连接到电极支架和控制盒的辅助端口。
- 将 TPP+ 选择性电极和参比电极插入适合的离子选择性电极的柱塞组件中。将参比电极连接到控制箱的参比端口。
- 将 TPP+ 选择性电极和参比电极插入适合的离子选择性电极的柱塞组件中。
- 反应室制备
- 将反应混合物加入反应室:10mM琥珀酸酯(复合物II底物),5μM鱼藤酮(复合物I抑制剂),80ngmL-1尼日利亚霉素(使IMM上的pH梯度塌陷),2.5μgmL-1寡霉素(诱导4级呼吸)和呼吸缓冲液(RB)/ BSA反应缓冲液至最终体积为1mL。注意避免将气泡引入腔室。
- 使用经过调整的柱塞组件关闭腔室,并采用 TPP+ 选择性电极,并将参比电极就位。选择 GO 开始录制。一旦腔室关闭,使用用塑料管修饰的单独微量注射器将其他试剂直接引入反应溶液中,以调整针头长度。
- TPP+ 校准
- 获得稳定的电压信号后,通过将0.1 mM TPP溶液的1 μM增量添加到3 μM的最终浓度来校准TPP +选择性电极。观察到每次添加时,TPP+ 电压信号都会有对数下降。
注意:在每个实验开始时校准TPP+选择性电极。
- 获得稳定的电压信号后,通过将0.1 mM TPP溶液的1 μM增量添加到3 μM的最终浓度来校准TPP +选择性电极。观察到每次添加时,TPP+ 电压信号都会有对数下降。
- 数据采集
- 让O2 和TPP + 痕量稳定,并通过柱塞组件中的试剂加成端口将100μg新鲜制备的心肌细胞线粒体加入反应室至终浓度为0.1mg mL-1 。观察当线粒体通电并消耗O2 时腔室中O2 水平的降低,以及当线粒体产生膜电位并从溶液中吸收TPP + 时TPP + 电压信号的突然增加。
- 加入2.5μgmL-1寡霉素诱导4状态呼吸。
注意:O2 消耗率现在将表示质子泄漏呼吸的速率。寡霉素可以在TPP+ 之前加入反应室作为替代。
- 评估 mPTP 的开放概率
- 观察ΔΨ在泄漏呼吸期间随时间下降。一旦达到所需的ΔΨ,向反应室中加入1μM CsA(mPTP抑制剂)以评估mPTP在该特定ΔΨ处的开放概率。
- 测量CsA对加入CsA之前和之后的O2 消耗和ΔΨ的影响
- 通过改变连续实验中加入CsA的ΔΨ来确定mPTP开路的电压依赖性。
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Representative Results
显示了这些实验中产生的典型O2 消耗和ΔΨ曲线(图1A,B)。TPP+ 校准时电压信号的对数下降显示在每个实验开始时。没有这种对数模式可能表明TPP+ 选择性电极存在问题。线粒体通常在加入呼吸缓冲液后立即产生ΔΨ。ΔΨ可以从基于能斯特方程([线粒体基质内TPP+ 的对数比]到[外部TPP+ ])的TPP+电压变化来解释为30。请注意,生理ΔΨ近似于标准曲线的2μM TPP + 水平。因此,相对于2 μM TPP+ 标准(表示为Δ mV TPP+ 电压信号)定义了电压阈值。
例如,“高ΔΨ”被定义为~Δ0 mV(在2 μM TPP+ 水平下),“中间ΔΨ”被设定为~Δ5 mV(低于2 μM TPP+),“低ΔΨ”被设定为~Δ10 mV(低于2 μM TPP+)(图1A,B)。在中试实验中,Δ0 mV的线粒体表现出100%mPTP闭合概率,Δ10 mV的线粒体表现出100%的开放概率;代表性图如图 1A、B所示。因此,Δ5 mV阈值被任意选择为中间ΔΨ。请注意,在这些实验中,当线粒体添加到反应室时,线粒体处于状态2呼吸,暴露于过量的底物。线粒体不受刺激进入ADP状态3;结果,一旦添加寡霉素,它们直接过渡到4态寡霉素(泄漏呼吸)。结果,在寡霉素添加后通常没有观察到明显的耗氧量差异,这表明ATP合酶在状态2期间对呼吸的贡献最小(图1A,B)。为了评估mpTPP的打开或关闭状态,比较了CsA添加前后的O2 消耗率和膜电位(图1C)。O2 消耗率的降低以及响应CsA的ΔΨ的增加和稳定表明开放mPTP闭合(阻断孔介导的质子泄漏)(图1C,黑色曲线)。
当mpTPP关闭时,O2 消耗率没有下降,ΔΨ不会增加和稳定,而是继续下降(图1C,红色曲线)。实验结果在FVB对照和 Fmr1 KO心脏线粒体中分别在高ΔΨs和低ΔΨs下表现出相似的闭合和开放mPTP概率(图1D)。这些发现与mPTP的已知电压敏感特性一致,其中孔隙倾向于在高ΔΨs下闭合,在低ΔΨs13处打开。因此,使用这种方法,我们可靠地证明了mPTP在两种应变中通常的电压依赖性。有趣的是,在中间ΔΨ(Δ5 mV阈值)处, 与FVB 对照组相比,Fmr1 KO心脏线粒体显示出增加的闭合mPTP概率(图1D)。因此, Fmr1 KO心脏线粒体表现出门控的变化,使得孔隙需要较低的ΔΨ才能触发开口。这与之前的发现一致, 即Fmr1 KO具有升高的CoQ水平和相对封闭的mPTP26。因此,该方法确定了最佳ΔΨ阈值来解决mpTPP开口的差异。重要的是,定义这个ΔΨ阈值将使进一步的研究能够更好地了解辅酶Q如何调节mpTPP以及辅酶Q缺乏如何导致FXS中的病理性毛孔开放。
图1:检测低电导mPTP打开概率(A,B)同时消耗O2的代表性曲线(红色,数字是以nmol为单位的O2 mL-1 min-1 mg蛋白-1)与ΔΨ(黑色,[TPP+])的速率。箭头表示 TPP+、线粒体、寡霉素和 CsA 的添加。图中显示了相对于 2 μM TPP+ 校准电平的高、中、低电压阈值。图中显示了在高 (A) 和低 (B) 电压阈值处的 CsA 相加。(C)在CsA添加点处(A)和(B)中O2消耗(上)和ΔΨ(下)曲线的放大部分,说明在高ΔΨ(对CsA不敏感)和低ΔΨ(对CsA敏感)时闭合mPTP(红色)和在低ΔΨ(对CsA敏感)时开放mpTP(黑色)。(D) FVB 控件(黑色)和 Fmr1 KO(灰色)的 mPTP 在高、低和中间 ΔΨs 下的 mPTP 打开和关闭状态摘要图。在每个ΔΨ阈值处评估5至11只动物;p值使用卡方检验计算,*p<0.05。缩写:ΔΨ = 线粒体膜电位;mPTP = 线粒体通透性过渡孔;TPP+ = 四苯基膦;mito = 线粒体;寡核苷酸=寡霉素;CsA = 环孢菌素 A;ΔΨ = ;KO = 淘汰赛。请点击此处查看此图的大图。
元件 | MI/BSA* | SB/BSA* | 密度梯度稀释剂 | 经常预算/白细胞管理局* |
甘露醇 | 225 毫米 | - | - | - |
蔗糖 | 75 毫米 | 250 毫米 | 1 米 | 200 毫米 |
赫皮斯 | 5 毫米 | 5 毫米 | 50 毫米 | 5 毫米 |
断续器 | 1 毫米 | 0.1 毫米 | 10 毫米 | - |
氯化钾 | - | - | - | 25 毫米 |
KH2PO4 | - | - | - | 2 毫米 |
氯化镁2 | - | - | - | 5 毫米 |
酸碱度** | 7.4 | 7.4 | - | 7.2 |
疯牛血清学士*** | 0.10% | 0.10% | - | 0.02% |
AP5A*** | - | - | - | 30 毫米 |
表1:缓冲液和溶液。
* 通过 0.2 μm 过滤器进行过滤
**根据需要用3M氢氧化钾调节pH值。
表示在线粒体分离之前添加的缓冲液组分。
缩写:MI =线粒体分离缓冲液;SB =蔗糖缓冲液;RB = 呼吸缓冲液;BSA = 无脂肪酸牛血清白蛋白;HEPES = 4-(2-羟乙基)-1-哌嗪乙烷磺酸;EGTA = 乙二醇-双(β-氨基乙基醚)-N,N,N′,N′-四乙酸;KCl = 氯化钾;KH2PO4 = 磷酸二氢钾;MgCl2 = 氯化镁;AP5A = P1,P5-二腺苷-5' 五磷酸五钠。
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Discussion
本文介绍了一种评估mpTPP开放概率的方法。具体而言,通过评估CsA抑制对ΔΨs范围内质子泄漏的影响来确定低电导mPTP开路的电压阈值。使用这种技术,我们可以识别FXS小鼠和FVB对照之间mpTPP电压门控的差异,这与它们在组织特异性辅酶Q含量的差异一致。这种方法成功的关键是线粒体在使用前新鲜分离并且质量良好。在分离过程中受损或太老的线粒体将无法产生适当的ΔΨ,并且通常会解耦。请注意,虽然基质pH通常有助于质子动力,但在这些实验中,尼日利亚霉素用于使IMM上的ΔpH塌陷,如先前在评估质子泄漏的标准方案29中所述。因此,在这种情况下,质子动力等效于ΔΨ,这简化了实验方法。
另一个重要的考虑因素是,呼吸混合物中使用的一些抑制剂(如鱼藤酮,寡霉素和CsA)很难在实验之间冲洗掉,因为它们粘附在反应室的塑料表面上,包括离子选择性电极。必须用乙醇和粗制的冻融线粒体悬浮液常规清洗腔室,以将这些抑制剂从腔室中“清除”,并减少可能影响实验可重复性的抑制剂残留的可能性。
由于线粒体必须新鲜制备以保持其完整性,因此该方法不适合高通量分析。此外,每个实验需要相对大量的线粒体。通常,对于P10动物,可以从一个器官中分离出足够的线粒体来进行单个实验。因此,通常不可能在同一批线粒体上测试不同的条件。如果对老年动物进行实验,鉴于组织和器官的尺寸相对较大,这种限制就不那么成问题了。
有许多描述良好的方法来研究分离完整线粒体中mpTPP的开放概率。诸如线粒体基质肿胀和钙负荷或保留能力测定的技术必然会触发高电导PT,因此不允许研究在这些实验中感兴趣的生理低电导开孔28。膜片钳技术为研究mpTPP31,32的高导率或低电导态的电压依赖性提供了一种强大而直接的方法。然而,这是一种费力的技术,一次只能研究一个线粒体和一个实验条件,这使得比较研究更加困难32,33。
此外,线粒体外膜通常裂解,线粒体内膜通常在用于分离线粒体的膜片钳方法中破裂,这可能导致与IMM31没有密切关联的mpTPP调节因子的丧失。mPTP的低导开度也已使用各种荧光技术进行了研究,通常采用四甲基罗丹明酯(以评估ΔΨ的变化)单独使用或与钙黄绿素组合,其线粒体内荧光在mPTP打开时易受钴淬灭的影响8,34。然而,在基于荧光的方法中,由于ΔΨ的变化表示为荧光的相对变化,因此该方法通常不允许精确测量ΔΨ8,34。
该方法为评估mPTP相对于ΔΨ的低电导开度提供了一种新的替代方法。使用这种方法,研究人员可以研究生理和病理mpTP电压门控的调节。该技术还有望帮助理解mpTPP在器官成熟中的发育作用,因为它可以应用于各种组织和不同的发育阶段。这种方法可以很容易地应用于研究FXS小鼠前脑组织中mPTP的电压门控,其先前表现出CoQ水平降低25。此外,我们提出该技术还可用于研究其他内源性或外源性药物如何影响mpTPP的电压门控。因此,它将被证明是一个有用的工具,可以扩大对mpTPP对健康和疾病的贡献的理解。
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Disclosures
作者没有利益冲突需要披露。
Acknowledgments
这项工作得到了以下资助:NIH / NIGMS T32GM008464(K.K.G.),哥伦比亚大学欧文医学中心机会教务长目标麻醉学系(K.K.G.),儿科麻醉学会青年研究奖(K.K.G.)和NIH / NINDS R01NS112706(R.J.L.)。
Materials
Name | Company | Catalog Number | Comments |
4-(2-hydroxyethyl)-1-piperazineethanesulfonic acid (HEPES) | Fisher Scientific | 15630080 | |
Adapted plunger assembly for pH or ion-selective electrodes for use with OXYT1 | PP systems | 941039 | |
BD Intramedic PE Tubing, PE 50, 0.023 in. 10 ft. | Fisher Scientific | 14-170-11B | to modify the length of the hamilton synringe as needed |
Bovine Serum Albumin (BSA). Fatty acid free | Sigma | A7030-10G | |
Dri-Ref Reference Electrode, 2 mm | World Precision Inst. LLC | DRIREF-2 | |
Electrode Holder for KWIK-Tips | World Precision Inst. LLC | KWIK-2 | ion selective electrode holder |
Ethylene glycol-bis(β-aminoethyl ether)-N,N,N′,N′-tetraacetic acid (EGTA) | Sigma | 324626 | |
FVB.129P2-Pde6b+ Tyrc-ch Fmr1tm1Cgr/J | Jackson Laboratory, Bar Harbor, ME | FXS mice, Fmr1 KO | |
FVB.129P2-Pde6b+ Tyrc-ch/AntJ | Jackson Laboratory, Bar Harbor, ME | FVB mice | |
Hamilton 80366 Standard Syringes, 10 uL, Cemented-Needle, 6/pk | Cole-Parmer | EW-07938-30 | microsyringe |
Hamilton 80500 Standard Microliter Syringes, 50 uL, Cemented-Needle | Cole-Parmer | EW-07938-02 | microsyringe |
Hansatech Instruments Oxytherm+ System (Respiration) Complete | PP systems | OXYTHERM+R | oxygen electrode and software |
Magnesium Chloride (MgCl2) | Sigma | 1374248 | |
Mannitol | Sigma | M9546-250G | |
P1,P5-diadenosine-5′ pentaphosphate pentasodium (AP5A) | Sigma | D4022-10MG | |
Percoll | Sigma | P1644 | medium for density gradient separation |
Potassium chloride (KCl) | Sigma | P3911 | |
Potassium dihydrogen phosphate (KH2PO4) | Sigma | 5.43841 | |
Sucrose | Sigma | S0389 | |
TPP+ Electrode Tips (3) | World Precision Inst. LLC | TIPTPP |
References
- Rasola, A., Bernardi, P. The mitochondrial permeability transition pore and its involvement in cell death and in disease pathogenesis. Apoptosis. 12 (5), 815-833 (2007).
- Szabó, I., Zoratti, M. The mitochondrial megachannel is the permeability transition pore. Journal of Bioenergetics and Biomembranes. 24, 111-117 (1992).
- Brand, M., Ferguson, S., Nunnari, J., Kühlbrandt, W. Molecular Biology of the Cell. Alberts, B., et al. 14, Garland Science. Chapter 14 767-830 (2002).
- Perez, M. J., Quintanilla, R. A. Development or disease: duality of the mitochondrial permeability transition pore. Developmental Biology. 426 (1), 1-7 (2017).
- Kwong, J. Q., Molkentin, J. D. Physiological and pathological roles of the mitochondrial permeability transition pore in the heart. Cell Metabolism. 21 (2), 206-214 (2015).
- Javadov, S., Kuznetsov, A. Mitochondrial permeability transition and cell death: the role of cyclophilin d. Frontiers in Physiology. 4, 76 (2013).
- Dorn, G. W. Mechanisms of non-apoptotic programmed cell death in diabetes and heart failure. Cell Cycle. 9 (17), 3442-3448 (2010).
- Boyman, L., et al. Dynamics of the mitochondrial permeability transition pore: Transient and permanent opening events. Archives of Biochemistry and Biophysics. 666, 31-39 (2019).
- Hom, J. R., et al. The permeability transition pore controls cardiac mitochondrial maturation and myocyte differentiation. Developmental Cell. 21 (3), 469-478 (2011).
- Hou, Y., et al. Mitochondrial superoxide production negatively regulates neural progenitor proliferation and cerebral cortical development. Stem Cells. 30 (11), 2535-2547 (2012).
- Elrod, J. W., et al. Cyclophilin D controls mitochondrial pore-dependent Ca(2+) exchange, metabolic flexibility, and propensity for heart failure in mice. Journal of Clinical Investigation. 120 (10), 3680-3687 (2010).
- Bonora, M., Giorgi, C., Pinton, P. Molecular mechanisms and consequences of mitochondrial permeability transition. Nature Reviews Molecular Cell Biology. , (2021).
- Bernardi, P. Modulation of the mitochondrial cyclosporin A-sensitive permeability transition pore by the proton electrochemical gradient. Evidence that the pore can be opened by membrane depolarization. Journal of Biological Chemistry. 267 (13), 8834-8839 (1992).
- Petronilli, V., et al. The voltage sensor of the mitochondrial permeability transition pore is tuned by the oxidation-reduction state of vicinal thiols. Increase of the gating potential by oxidants and its reversal by reducing agents. Journal of Biological Chemistry. 269 (24), 16638-16642 (1994).
- Giorgio, V., et al. Ca(2+) binding to F-ATP synthase beta subunit triggers the mitochondrial permeability transition. European Molecular Biology Organization Reports. 18 (7), 1065-1076 (2017).
- Halestrap, A. P., Woodfield, K. Y., Connern, C. P. Oxidative stress, thiol reagents, and membrane potential modulate the mitochondrial permeability transition by affecting nucleotide binding to the adenine nucleotide translocase. Journal of Biological Chemistry. 272 (6), 3346-3354 (1997).
- Szabo, I., Bernardi, P., Zoratti, M. Modulation of the mitochondrial megachannel by divalent cations and protons. Journal of Biological Chemistry. 267 (5), 2940-2946 (1992).
- Karch, J., et al. Inhibition of mitochondrial permeability transition by deletion of the ANT family and CypD. Science Advances. 5 (8), (2019).
- Alavian, K. N., et al. An uncoupling channel within the c-subunit ring of the F1FO ATP synthase is the mitochondrial permeability transition pore. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 111 (29), 10580-10585 (2014).
- Antoniel, M., et al. The unique histidine in OSCP subunit of F-ATP synthase mediates inhibition of the permeability transition pore by acidic pH. European Molecular Biology Organization Reports. 19 (2), 257-268 (2018).
- Haworth, R. A., Hunter, D. R. The Ca2+-induced membrane transition in mitochondria. II. Nature of the Ca2+ trigger site. Archives of Biochemistry and Biophysics. 195 (2), 460-467 (1979).
- Halestrap, A. P., Connern, C. P., Griffiths, E. J., Kerr, P. M. Cyclosporin A binding to mitochondrial cyclophilin inhibits the permeability transition pore and protects hearts from ischaemia/reperfusion injury. Molecular and Cellular Biochemistry. 174 (1-2), 167-172 (1997).
- Giorgio, V., Fogolari, F., Lippe, G., Bernardi, P. OSCP subunit of mitochondrial ATP synthase: role in regulation of enzyme function and of its transition to a pore. British Journal of Pharmacology. 176 (22), 4247-4257 (2019).
- Fontaine, E., Ichas, F., Bernardi, P. A ubiquinone-binding site regulates the mitochondrial permeability transition pore. Journal of Biological Chemistry. 273 (40), 25734-25740 (1998).
- Griffiths, K. K., et al. Inefficient thermogenic mitochondrial respiration due to futile proton leak in a mouse model of fragile X syndrome. Federation of American Societies for Experimental Biology Journal. 34 (6), 7404-7426 (2020).
- Barajas, M., et al. The newborn Fmr1 knockout mouse: a novel model of excess ubiquinone and closed mitochondrial permeability transition pore in the developing heart. Pediatric Research. 89 (3), 456-463 (2021).
- Parks, R. J., Murphy, E., Liu, J. C. Mitochondrial Bioenergetics: Methods and ProtocolsMethods in Molecular Biology. Palmeira, C. M., Moreno, A. J. , The Humana Press. Chapter 11 187-196 (2018).
- Carraro, M., Bernardi, P. Measurement of membrane permeability and the mitochondrial permeability transition. Methods in Cell Biology. 155, 369-379 (2020).
- Affourtit, C., Wong, H., Brand, M. D. Mitochondrial Bioenergetics: Methods and ProtocolsMethods in Molecular Biology. Palmeira, C. M., Moreno, A. J. , The Humana Press. Chapter 9 157-170 (2018).
- Teodoro, J. S., Palmeira, C. M., Rolo, A. P. Mitochondrial Bioenergetics: Methods and ProtocolsMethods in Molecular Biology. Palmeira, C. M., Moreno, A. J. , The Humana Press. Chapter 6 109-119 (2018).
- Neginskaya, M. A., Pavlov, E. V., Sheu, S. S. Electrophysiological properties of the mitochondrial permeability transition pores: Channel diversity and disease implication. Biochimica et Biophysica Acta - Bioenergetics. 1862 (3), 148357 (2021).
- Zoratti, M., Szabo, I.
The mitochondrial permeability transition. Biochimica et Biophysica Acta. 1241 (2), 139-176 (1995). - Yajuan, X., Xin, L., Zhiyuan, L. A comparison of the performance and application differences between manual and automated patch-clamp techniques. Current Chemical Genomics. 6, 87-92 (2012).
- Petronilli, V., et al. Transient and long-lasting openings of the mitochondrial permeability transition pore can be monitored directly in intact cells by changes in mitochondrial calcein fluorescence. Biophysical Journal. 76 (2), 725-734 (1999).