Summary

Protocole optimisé pour les Swiss Rolls intestinaux et la coloration immunofluorescente des tissus inclus dans la paraffine

Published: July 19, 2024
doi:

Summary

L’intestin est vital pour la digestion et l’absorption. Chaque région – duodénum, jéjunum, iléon, côlon – remplit des fonctions distinctes en raison de structures cellulaires uniques. L’étude de la physiologie intestinale nécessite une analyse méticuleuse des tissus. Ce protocole décrit la fixation et le traitement des tissus à l’aide de la technique du rouleau suisse, assurant une immunocoloration précise grâce à une préservation et une orientation appropriées des tissus.

Abstract

L’intestin est un organe complexe composé de l’intestin grêle et du gros intestin. L’intestin grêle peut être divisé en duodénum, jéjunum et iléon. Chaque région anatomique de l’intestin a une fonction unique qui se reflète dans les différences de structure cellulaire. L’étude des changements dans l’intestin nécessite une analyse approfondie des différentes régions tissulaires et des altérations cellulaires. Pour étudier l’intestin et visualiser de gros morceaux de tissu, les chercheurs utilisent couramment une technique connue sous le nom de rouleaux suisses intestinaux. Dans cette technique, l’intestin est divisé en chaque région anatomique et fixé dans une orientation plate. Ensuite, le tissu est soigneusement roulé et traité pour l’enrobage de paraffine. La fixation et l’orientation correctes des tissus sont une technique de laboratoire souvent négligée, mais elles sont d’une importance cruciale pour l’analyse en aval. De plus, un mauvais roulement suisse du tissu intestinal peut endommager l’épithélium intestinal fragile, entraînant une mauvaise qualité des tissus pour l’immunocoloration. S’assurer que les tissus sont bien fixés et correctement orientés avec des structures cellulaires intactes est une étape cruciale qui garantit une visualisation optimale des cellules intestinales. Nous présentons une méthode simple et rentable pour fabriquer des rouleaux suisses afin d’inclure toutes les sections de l’intestin dans un seul bloc inclus dans la paraffine. Nous décrivons également la coloration par immunofluorescence optimisée du tissu intestinal pour étudier divers aspects de l’épithélium intestinal. Le protocole suivant fournit aux chercheurs un guide complet pour obtenir des images d’immunofluorescence de haute qualité grâce à la fixation des tissus intestinaux, à la technique du Swiss-roll et à l’immunomarquage. L’utilisation de ces approches raffinées préserve la morphologie complexe de l’épithélium intestinal et favorise une compréhension plus profonde de la physiologie et de la pathobiologie intestinales.

Introduction

L’architecture cellulaire de l’intestin pose un défi unique pour maintenir son intégrité structurelle lorsque le tissu intestinal est préservé pour l’immunomarquage. L’intestin grêle est composé de structures allongées en forme de doigts appelées villosités1. Ces villosités se déforment souvent au cours des processus d’encastrement. Il est crucial de s’assurer que les chercheurs disposent de techniques pour intégrer correctement les intestins afin d’obtenir des coupes efficaces, permettant de visualiser toutes les régions de l’intestin, ainsi que les couches qui composent l’intestin (c’est-à-dire la musculeuse propria, la muqueuse et la séreuse), est crucial pour une analyse expérimentale robuste2. Une fixation inadéquate, une fixation excessive et une manipulation inappropriée des tissus compromettront l’intégrité des tissus, entraînant des dommages accidentels à l’épithélium intestinal 3,4. Endommager l’épithélium intestinal au cours de ces étapes peut diminuer considérablement la qualité des analyses ultérieures, comme l’immunofluorescence, indépendamment de l’efficacité des protocoles d’immunohistochimie et des anticorps utilisés.

L’immunomarquage, comme la bonne fixation des tissus, est une partie importante de la recherche biomédicale. Lorsqu’elle est bien faite, l’immunocoloration peut mettre en lumière des aspects jusque-là inconnus de la structure et de la fonction cellulaires. La coloration par immunofluorescence des sections de paraffine peut être difficile en raison des modifications physicochimiques résultant du processus de fixation et d’enrobage de la paraffine5. La fixation et l’intégration de la paraffine entraînent un masquage de l’antigène qui peut interférer avec la détection par immunofluorescence des épitopes d’intérêt6. Une fixation retardée peut induire une dégradation protéolytique, ce qui entraîne une coloration affaiblie ou absente des épitopes critiques7. De plus, les anticorps sont souvent imprécis avec des niveaux élevés de bruit de fond. Les protocoles d’immunomarquage qui favorisent une liaison cohérente et spécifique des anticorps et un rapport signal/bruit élevé peuvent fournir des informations précieuses aux chercheurs.

Ici, nous fournissons un protocole complet conçu pour obtenir des images d’immunofluorescence de haute qualité grâce à la fixation des tissus intestinaux, à la préparation du rouleau suisse8 et à l’immunomarquage. Mettant l’accent sur les lignes directrices visant à préserver l’intégrité de l’intestin, le protocole vise à fournir aux chercheurs une méthodologie robuste pour améliorer la qualité et la fiabilité des études d’imagerie par immunofluorescence. Nous avons également cherché à utiliser des ressources rentables, notamment du papier filtre et une récupération d’antigène maison, des solutions de blocage et des diluants d’anticorps pour rendre le protocole plus accessible aux laboratoires qui peuvent disposer de fonds limités. Comme pour tous les protocoles expérimentaux, les chercheurs doivent optimiser le protocole actuel en fonction de leur approche expérimentale et de leurs domaines d’intérêt.

Protocol

Le comité institutionnel de soin et d’utilisation des animaux de l’Université médicale de Caroline du Sud a approuvé tous les soins, l’entretien et le traitement des animaux. Du tissu intestinal a été prélevé sur des souris adultes C57BL/6J (mâles et femelles âgés de 3 à 5 mois, pesant environ 30 g) pour être utilisé dans la présente étude. 1. Fixation du tissu intestinal Disséquez soigneusement tout l’intestin d’une souris euthanasiée et …

Representative Results

Une coloration à l’hématoxyline et à l’éosine (H&E) a été effectuée, comme décrit précédemment12. En utilisant la méthode optimisée, les Swiss Rolls intestinaux comprenaient les trois segments de l’intestin grêle et du gros intestin sur une seule lame. Le fait d’avoir l’intestin entier logé sur une lame permet aux chercheurs d’analyser les changements dans toutes les parties de l’intestin et de réduire les coûts de sectionnement et de coloration des réactifs (<strong…

Discussion

Ici, nous présentons une méthode optimisée de fixation tissulaire utilisant la technique du rouleau suisse pour préserver l’architecture intestinale et favoriser une immunocoloration précise. Une fois maîtrisée, cette technique peut être utilisée pour étudier une grande variété de questions de recherche impliquant la physiologie intestinale et la biologie cellulaire19. Plusieurs méthodes de laminage suisses optimisées ont été publiées et sont très utiles20,21<…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Cette étude a été financée par les subventions K01 DK121869 des National Institutes of Health (NIH) à l’ACE et cette publication a été financée en partie par les GM132055 T32 (RME), F31 DK139736 (SAD), T32 DK124191 (SAD), TL1 TR001451 (RS), UL1 TR001450 (RS) et les subventions HCS cornerstone à SAD & RS. Ce travail a été soutenu par des fonds de démarrage de l’Université médicale de Caroline du Sud (MUSC) à l’ACE et a été soutenu par le MUSC Digestive Disease Research Core Center (P30 DK123704) et le COBRE in Digestive and Liver Disease (P20 GM120475). L’imagerie a été réalisée à l’aide de la carotte d’imagerie cellulaire et moléculaire de MUSC.

Materials

β-CATENIN GeneTex GTX101435
Cellulose filter paper Cytiva 10427804 Thick Whatman paper
Charged glass slides Thermo Fisher Scientific 23888114
Coverslip Epredia 152440
Dissecting pins size 00 Phusis B082DH4TZF
E-CADHERIN R&D Systems AF748
Freezer gloves Tempshield UX-09113-02
Heating block Premiere XH-2001 Slide Warmer
Histo-Clear II Electron Microscopy Sciences 64111-04 Clearing reagent
Hoescht Thermo Fisher Scientific 62249
Hydrochloric Acid Sigma Aldrich 320331
Hydrophobic pen Millipore 402176
LAMININ GeneTex GTX27463
LAMP1 Santa Cruz SC-19992
Large cassettes Tissue-Tek 4173
Minutien pins Fine Science Tools NC9679721
Mouse-on-mouse blocking reagent Vector Laboratories MKB-2213 Mouse-on-mouse block
MUC2 GeneTex GTX100664
PCNA Cell Signaling Technology 2586S
Pressure Cooker Cuisinart B000MPA044
ProLong gold antifade Thermo Fisher Scientific P36934 Mounting medium
Reverse action forceps Dumont 5748
Slide Rack Tissue-Tek 62543-06
Slide Staining Set Tissue-Tek 62540-01 Solvent Resistant Dishes and Metal Frame
Small cassettes Fisherbrand 15-200-403B
Sodium citrate dihydrate Fisher Bioreagents BP327-1
Teleostein Gelatin Sigma G7765 Blocking buffer
Triton X-100 Thermo Fisher Scientific A16046
Tween 20 Thermo Fisher Scientific J20605-AP
Wipes KimTech 34155
Xylenes Fisher Chemical 1330-20-7
γ-ACTIN Santa Cruz SC-65638

References

  1. Louvard, D., Kedinger, M., Hauri, H. P. The differentiating intestinal epithelial cell: Establishment and maintenance of functions through interactions between cellular structures. Annu Rev Cell Biol. 8, 157-195 (1992).
  2. Rieger, J., Pelckmann, L. M., Drewes, B. . Animal models of allergic disease: Methods and protocols. , (2021).
  3. Webster, J. D., Miller, M. A., Dusold, D., Ramos-Vara, J. Effects of prolonged formalin fixation on the immunohistochemical detection of infectious agents in formalin-fixed, paraffin-embedded tissues. Vet Pathol. 47 (3), 529-535 (2010).
  4. Hayashi, Y., Koike, M., Matsutani, M., Hoshino, T. Effects of fixation time and enzymatic digestion on immunohistochemical demonstration of bromodeoxyuridine in formalin-fixed, paraffin-embedded tissue. J Histochem Cytochemis. 36 (5), 511-514 (1988).
  5. Werner, M., Chott, A., Fabiano, A., Battifora, H. Effect of formalin tissue fixation and processing on immunohistochemistry. Am J Surg Pathol. 24 (7), 1016-1019 (2000).
  6. Scalia, C. R., et al. Antigen masking during fixation and embedding, dissected. J Histochem Cytochem. 65 (1), 5-20 (2017).
  7. Masood, S., Von Wasielewski, R., Mengel, M., Nolte, M., Werner, M. Influence of fixation, antibody clones, and signal amplification on steroid receptor analysis. Breast J. 4 (1), 33-40 (1998).
  8. Moolenbeek, C., Ruitenberg, E. J. The "swiss roll": A simple technique for histological studies of the rodent intestine. Lab Anim. 15 (1), 57-59 (1981).
  9. Casteleyn, C., Rekecki, A., Van Der Aa, A., Simoens, P., Van Den Broeck, W. Surface area assessment of the murine intestinal tract as a prerequisite for oral dose translation from mouse to man. Lab Animals. 44 (3), 176-183 (2010).
  10. Lunnemann, H. M., et al. Cecum axis (cecax) preservation reveals physiological and pathological gradients in mouse gastrointestinal epithelium. Gut Microbes. 15 (1), 2185029 (2023).
  11. Qin, C., et al. The cutting and floating method for paraffin-embedded tissue for sectioning. J Vis Exp. (139), e58288 (2018).
  12. Feldman, A. T., Wolfe, D. . Histopathology: Methods and protocols. , (2014).
  13. Yang, W. H., et al. Innate mechanism of mucosal barrier erosion in the pathogenesis of acquired colitis. iScience. 26 (10), 107883 (2023).
  14. Dooley, S. A., et al. Myosin 5b is required for proper localization of the intermicrovillar adhesion complex in the intestinal brush border. Am J Physiol Gastrointest Liver Physiol. 323 (5), G501-G510 (2022).
  15. Danan, C. H., et al. Intestinal transit amplifying cells require mettl3 for growth factor signaling, kras expression, and cell survival. bioRxiv. , (2023).
  16. Han, B., Qi, S., Hu, B., Luo, H., Wu, J. Tgf-beta i promotes islet beta-cell function and regeneration. J Immunol. 186 (10), 5833-5844 (2011).
  17. Chen, L. C., Wang, H. W., Huang, C. C. Modulation of inherent niches in 3d multicellular msc spheroids reconfigures metabolism and enhances therapeutic potential. Cells. 10 (10), 2747 (2021).
  18. Fang, Y., et al. Cd36 inhibits beta-catenin/c-myc-mediated glycolysis through ubiquitination of gpc4 to repress colorectal tumorigenesis. Nat Commun. 10 (1), 3981 (2019).
  19. Whittem, C. G., Williams, A. D., Williams, C. S. Murine colitis modeling using dextran sulfate sodium (dss). J Vis Exp. (35), e1652 (2010).
  20. Bialkowska, A. B., Ghaleb, A. M., Nandan, M. O., Yang, V. W. Improved swiss-rolling technique for intestinal tissue preparation for immunohistochemical and immunofluorescent analyses. J Vis Exp. (113), e54161 (2016).
  21. Le Naour, J., et al. Improved swiss-rolling method for histological analyses of colon tissue. MethodsX. 9, 101630 (2022).
  22. Cardiff, R. D., Miller, C. H., Munn, R. J. Mouse tissue fixation. Cold Spring Harb Protoc. 2014 (5), (2014).
  23. Pereira E Silva, A., Lourenço, A. L., Marmello, B. O., Bitteti, M., Teixeira, G. a. P. B. Comparison of two techniques for a comprehensive gut histopathological analysis: Swiss roll versus intestine strips. Exp Mol Pathol. 111, 104302 (2019).
  24. Williams, J. M., Duckworth, C. A., Vowell, K., Burkitt, M. D., Pritchard, D. M. Intestinal preparation techniques for histological analysis in the mouse. Curr Prot Mouse Biol. 6 (2), 148-168 (2016).
  25. Boenisch, T. Effect of heat-induced antigen retrieval following inconsistent formalin fixation. Appl Immunohistochem Mol Morphol. 13 (3), 283-286 (2005).
  26. Hasegawa, Y., Mark Welch, J. L., Rossetti, B. J., Borisy, G. G. Preservation of three-dimensional spatial structure in the gut microbiome. PLoS One. 12 (11), e0188257 (2017).
  27. Garabedian, E. M., Roberts, L. J., Mcnevin, M. S., Gordon, J. I. Examining the role of paneth cells in the small intestine by lineage ablation in transgenic mice. J Biol Chem. 272 (38), 23729-23740 (1997).
  28. Moshi, J. M., Ummelen, M., Broers, J. L. V., Ramaekers, F. C. S., Hopman, A. H. N. Impact of antigen retrieval protocols on the immunohistochemical detection of epigenetic DNA modifications. Histochem Cell Biol. 159 (6), 513-526 (2023).
  29. Krenacs, L., Krenacs, T., Stelkovics, E., Raffeld, M. Heat-induced antigen retrieval for immunohistochemical reactions in routinely processed paraffin sections. Methods Mol Biol. 588, 103-119 (2010).
  30. Pereira, E. S. A., Lourenco, A. L., Marmello, B. O., Bitteti, M., Teixeira, G. Comparison of two techniques for a comprehensive gut histopathological analysis: Swiss roll versus intestine strips. Exp Mol Pathol. 104302, 111 (2019).
  31. Bolognesi, M. a. O., et al. Antibodies validated for routinely processed tissues stain frozen sections unpredictably. BioTechniques. 70 (3), 137-148 (2021).
This article has been published
Video Coming Soon
Keep me updated:

.

Cite This Article
Dooley, S. A., Stubler, R., Edens, R. M., McKee, P. R., Rucker, J. N., Engevik, A. Optimized Protocol for Intestinal Swiss Rolls and Immunofluorescent Staining of Paraffin Embedded Tissue. J. Vis. Exp. (209), e66977, doi:10.3791/66977 (2024).

View Video